Si t’i bëni bashkësitë interaktive të të dhënave të hulumtimeve biomjekësore

Si t'i bëjmë të dhënat e hulumtimit biomjekësor të aftë për të bashkëvepruar?

Parimi i ndërveprimit përcakton aftësinë e sistemeve të ndryshme për tu lidhur. Kjo është një vështirësi e konsiderueshme në kërkimet biomjekësore, si dhe posaçërisht, në fushën e mjekimit të personalizuar, i cili bazohet kryesisht në mbledhjen, si dhe vlerësimin e grupeve të panumërta të të dhënave Për rrethana, pandemia COVID-19 ka zbuluar në të vërtetë se edhe kur teknologjia , ngrihen kufizime të ligjshme dhe të ndershme, informacioni vazhdon të jetë i vështirë për t'u vlerësuar si rezultat i errësirave semantike. Nën kujdesin e Rrjetit Shëndetësor të Personalizuar Zviceran (SPHN) si dhe në bashkëpunim të ngushtë me përfaqësues nga të 5 spitalet mësimore Zvicerane si dhe eHealth Suisse, një grup studiuesish nga Universiteti i Gjenevës (UNIGE) si dhe Spitalet Universitare i Gjenevës (HUG), në bashkëpunim me Institutin Zviceran të Bioinformatikës SIB si dhe Spitalin Universitar të Lozanës (CHUV), në të vërtetë kanë krijuar teknikën për një kornizë mbarëkombëtare të përqafuar nga të gjithë spitalin mësimor zviceran si dhe institucionet skolastike. Me strategjinë e saj praktike, kjo teknikë bazohet në avancimin e një strukture të zakonshme semantike që nuk synon të ndryshojë kërkesat ekzistuese, megjithatë t'i përdorë ato në një mënyrë bashkëpunuese, si dhe mjete të gjithanshme, sipas kërkesave të kërkimit, si dhe shoqëruesve. të përfshira Zbatimi i kësaj teknike, e cila aktualisht ka filluar, vë në dukje një veprim të rëndësishëm për të promovuar kërkimin si dhe zhvillimin për një ilaç të përshtatur vërtet në Zvicër

Medikamentet e personalizuara bazohen në shfrytëzimin, si dhe vlerësimin e sasive të mëdha të informacionit qoftë gjenomik, epidemiologjik ose nga imazhet klinike, deri në përcaktimin e esencës. Për të qenë në gjendje ta bëjmë këtë, referencat e kryqëzuara si dhe grumbullimi i informacionit po aq të pagabueshëm është i detyrueshëm, edhe kur ato vijnë nga burime vërtet të ndryshme.

Me këtë në mendje, qeveria federale zvicerane prodhoi në vitin 2017 Rrjetin Shëndetësor të Personalizuar Zviceran (SPHN), një fushatë e vendosur nën menaxhimin e Akademisë Zvicerane të Shkencave Mjekësore në bashkëpunim me SIB Instituti Zviceran i Bioinformatics që synon të reklamojë përdorimin si si dhe shkëmbimi i informacionit për shëndetin e kërkimit "Pavarësisht investimeve të mëdha gjatë dekadës së kaluar, ka akoma pabarazi të mëdha", pohon Christian Lovis, mbikëqyrës i Departamentit të Radiologjisë si dhe Informatikës Mjekësore në Fakultetin e Mjekësisë UNIGE si dhe shef i Divizioni i Shkencave të Informacionit Mjekësor në HUG. "Kjo është arsyeja pse ne donim, me partnerët tanë dhe SPHN, të propozonim një strategji dhe standarde të përbashkëta që janë mjaft fleksibël për të akomoduar të gjitha llojet e bazave të të dhënave aktuale dhe të ardhshme."

Një teknikë me tre shtylla

Ne lidhemi me 3 kërkesa kryesore: përkufizimi që u ofrojmë pikave, pasi duhet të vendosemi mbi një bazë të zakonshme për të kuptuar njëri-tjetrin; një kërkesë teknologjike - zhurma, me të cilën flasim; si dhe në fund të fundit, shoqëria e përkufizimit, si dhe zhurma me fjali, si dhe gramatika për të kornizuar ndërveprimin në një mjet të kuptueshëm. “Për sa i përket të dhënave, është e njëjta gjë, shpjegon Christophe Gaudet-Blavignac, një studiues në ekipin e udhëhequr nga Christian Lovis. Ju duhet të bini dakord për një semantik, për të përfaqësuar konceptualisht atë që duhet komunikuar. Atëherë na duhet një gjuhë kompozicionale për të kombinuar këto kuptime me gjithë lirinë e kërkuar për të shprehur gjithçka që duhet të shprehet. Dhe së fundmi, në varësi të projekteve dhe komuniteteve kërkimore të përfshira, kjo do të 'përkthehet' sipas nevojës në modele të të dhënave, të cilat janë aq të shumta sa gjuhët që fliten në botë. ”

"Qëllimi ynë ka qenë që të unifikojmë fjalorët në mënyrë që ato të mund të komunikohen në çdo gramatikë, në vend se të krijojmë një fjalor të ri nga e para që të gjithë do të duhet ta mësojnë përsëri", pohonKristian Lovis "Në këtë kuptim, federalizmi Zviceran është një avantazh i madh : na ka detyruar të imagjinojmë një strategji të decentralizuar, e cila mund të zbatohet kudo. Prandaj, kufizimi ka krijuar mundësinë për të zhvilluar një sistem që funksionon pavarësisht gjuhëve, kulturave dhe rregulloreve lokale. " Kjo e bën të mundshme përdorimin e versioneve të veçanta të informacionit vetëm për veprimin e fundit që do të rregullohet në stilet e kërkuara nga një punë e caktuar - Plani i Ushqimit dhe Administrimit të Barnave (FDA) kur bëhet fjalë për bashkëpunim me një grup amerikan, si një shembull, ose ndonjë lloj paraqitjeje të ndryshme të veçanta të përdorura nga një komb i caktuar ose fushatë kërkimore. Kjo përfshin një garanci për mirëkuptim si dhe një kursim masiv të kohës.

Nuk ka ndikim në mbrojtjen e informacionit

Sidoqoftë, ndërveprimi i informacionit nuk nënkupton ndarjen metodike të informacionit. “Bota bankare, për shembull, ka kohë që ka miratuar standarde globale të ndërveprimit, thekson Christophe Gaudet-Blavignac. Një IBAN i thjeshtë mund të përdoret për të transferuar para nga çdo llogari në ndonjë llogari tjetër. Sidoqoftë, kjo nuk do të thotë që dikush, qofshin individë, organizata private apo qeveri, mund të dijë se çfarë ka në këto llogari pa një kornizë të rreptë ligjore. " Në të vërtetë, duhet të bëhet një ndryshim midis mjeteve që prodhojnë ndërveprim, si dhe zbatimit të tyre, nga njëra anë, si dhe strukturës rregullatore që rregullon lehtësinë e tyre të hyrjes, nga ana tjetër.

Zbatimi i strategjisë

Kjo teknikë është zbatuar në të vërtetë hap pas hapi në Zvicër duke marrë parasysh që qendra e vitit 2019, në strukturën e Rrjetit Shëndetësor të Personalizuar të Zvicrës “Spitalet universitare zvicerane tashmë po ndjekin strategjinë e propozuar për të ndarë të dhëna ndërvepruese për të gjitha projektet kërkimore multicentrike të financuara nga Iniciativa SPHN ”, regjistron Katrin Crameri, mbikëqyrësi i Grupit të Personalizuar të Informatikës Shëndetësore në SIB përgjegjës i Qendrës së Koordinimit SPHNData Më tej, disa pajisje mjekësore kanë filluar të ekzekutojnë këtë teknikë pas fushatës së SPHN.