Genómové testovanie odpadových vôd dokáže efektívne sledovať príslušné varianty COVID-19

Výskum ukazuje, že genómové testovanie odpadových vôd dokáže efektívne sledovať príslušné varianty COVID-19 v rámci regiónu

Testovanie odpadových vôd dokáže presne a tiež rýchlo rozpoznať stupne infekcií COVID-19 v tejto oblasti, ktoré pozostávajú z nárastu obávaných variantov, odporúča úplne nová výskumná štúdia vedená učiteľom UBC Dr. Ryanom Zielsom.

Ziels a tiež jeho spolupracovníci hodnotili príklady stoka z 5 metropolitných čistiarní odpadových vôd v oblasti metra Vancouver počas trvania zvýšeného počtu prípadov COVID-19, od februára do apríla 2021.

Výsledky, ktoré boli vysvetlené online predtlačou v spoločnosti medrxiv, odhalili, že vírusové zameranie na odpadové vody nahromadené v oblasti Vancouveru starostlivo sledovalo počty profesionálnych situácií v tejto oblasti.

Vedci, medzi ktorých bol zahrnutý aj žiak Ph D. Civil Design Xuan Lin, takisto zistili, že pravidelnosť anomálií spojených s variantmi znepokojenia v odpadových vodách je vysoko spojená so vzorcami vo vedecky identifikovaných situáciách v tejto oblasti.

V tejto otázke Dr. Ziels, vedecký pracovník v oblasti ekologického dizajnu, ktorý skúma mikrobiálnu ekológiu, hovorí o hľadaní výskumných štúdií - a tiež o tom, ako môže genomické testovanie odpadových vôd upozorniť na bezpečnosť chorôb a tiež o prístupoch správy.

Ako ste sa dostali k tejto výskumnej štúdii?

V skutočnosti sa už niekoľko rokov zaoberám sekvenovaním genomiky odpadových vôd a tiež keď som sa poškodil (a) pandémiou, rozhodol som sa využiť toto porozumenie na pochopenie infekcie SARS-CoV-2 v spolupráci s rôznymi ďalšími vedcami. Našu skupinu tvoria ekologickí mikrobiológovia, dizajnéri a tiež epidemiológovia (v UBC a tiež BC CDC) a tiež sme mali tú česť spolupracovať pri svojej práci s Metro Vancouver.

Rovnako ako mnoho iných chorôb, aj infekcia SARS-CoV-2 klesá počas celej infekcie vo výkaloch a v metropolitnej odpadovej vode sa nachádzajú aj kúsky vírusového genómu.

Obrovským dotazom bolo, ako môžeme tieto kúsky identifikovať rýchlo a tiež presne, aby sme mohli ponúknuť ďalšie vstupy priamo do súboru nástrojov pre verejné zdravie a wellness?

Aké techniky ste použili na meranie a tiež sledovanie variantov záujmu v odpadových vodách metra Vancouver?

Predtým som vytvoril rýchlu a presnú metódu sekvenovania využívajúcu prenosné sekvencéry DNA a tiež s niekoľkými zmenami moja skupina a tiež som použil tento systém na meranie častí genómu koronavírusu v príkladoch odpadových vôd z oblasti Vancouveru.

To, čo robíme, sa podobá práci, ktorú vykonáva CanCOGeN, kanadská sieť COVID Genomics Network - konzorcium kanadskej vlády, vidieckych a tiež miestnych úradov pre verejné zdravie a wellness, ktoré sekvenuje približne 150,000 XNUMX vírusových genómov v celej Kanade. Ale nižšie, skôr ako sekvenčné príklady osôb , radíme príklady odpadových vôd, ktoré akumulujú vstupy od celých populácií v danej oblasti.

Čo ste hľadali?

Pokiaľ ide o meranie množstva kusov genómu koronavírusu, zistili sme trochu veľmi skorý signál v kontraste s úpravami pobytov v nemocnici alebo počtov prípadov. Toto odporúčalo, aby testovanie odpadových vôd mohlo ponúknuť určitý druh veľmi skorej opatrnosti.

Pomocou sekvenovania genómu odpadových vôd môžeme identifikovať nárasty anomálií spojených s variantmi, ktoré nás znepokojujú, a tiež ponúkame tieto informácie našim orgánom pre zdravie a wellness ako ďalšiu pomoc v ich prístupoch k verejnému zdraviu a wellness.

Máme možnosť upraviť náš prístup k hľadaniu vznikajúcich variantov a tiež skutočne získať obraz celej oblasti v jednom príklade. Sekvenovanie genómu nám tiež umožnilo identifikovať, ktoré stoky v metre Vancouver sú variantmi, ktoré budú mimoriadne populárne.

Rýchle sekvenovanie informácií o vírusoch nám umožňuje ponúknuť skutočne rýchly obrat - ponúkame záznamy na vylepšenie našich klinických policajtov v oblasti zdravia a wellness už za 3 až 4 dni od odobratia vzorky.

Aké sú dôsledky pre budúce pandemické testovanie a tiež pre správu?

Rozširuje sa výskumná štúdia, že ochutnávanie odpadových vôd môže slúžiť na pochopenie stupňa infekcií COVID-19 v oblastiach. Naším cieľom je dopĺňať, a nemeniť, rôzne ďalšie testovacie techniky v oblasti verejného zdravia. Testovanie odpadových vôd môže slúžiť, ak je profesionálne testovanie náročné alebo ak nemáte testovanie v metropolitnej oblasti.

Rovnako prijímame kanadskú vodnú sieť, aby sme vytvorili celonárodný pracovný tím, ktorý bude zdieľať poznatky o sledovaní odpadových vôd. Takáto celonárodná sieť môže priniesť dôveryhodné informácie, keď postupujeme v smere znovuotvorenia našej hospodárskej situácie.