Veľká genomická analýza zdôrazňuje rizikové faktory COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

V marci 2020 sa stovky vedcov z celého sveta pripojili, aby odpovedali na naliehavé a zložité otázky: aké dedičné faktory majú vplyv na to, prečo niektorí klienti COVID-19 vytvárajú extrémny smrteľný stav vyžadujúci pobyt v nemocnici, zatiaľ čo iným unikajú mierne príznaky a príznaky alebo nijaké?

Podrobná rekapitulácia ich dnešných vyhľadávaní, zverejnená v príroda, popisuje 13 lokusov alebo oblastí v ľudskom genóme, ktoré sú vysoko spojené s infekciou alebo extrémom COVID-19 Vedci ďalej určili príčinné faktory, ako je fajčenie cigariet, a tiež vysoký index telesnej hmotnosti. Tieto výsledky pochádzajú z najväčších výskumov organizácie zameraných na celý genóm, ktoré sa kedy uskutočnili, ktoré zahŕňajú takmer 50,000 19 klientov COVID-2 a tiež XNUMX milióny čistých kontrol.

Hľadanie môže pomôcť určiť ciele budúcej liečby a tiež zdôrazniť silu dedičných výskumov pri zisťovaní ďalších informácií o stave prenosnosti.

Túto svetovú iniciatívu nazvanú COVID-19 Host Genomics Initiative zahájila v marci 2020 Andrea Ganna, vedúca tímu Inštitútu pre molekulárnu medicínu Fínsko (FIMM), Helsinská univerzita a tiež Mark Daly, vedúci FIMM a tiež účastník ústavu na Broad Institute of MIT and also Harvard Kampaň sa skutočne rozšírila tak, že patrí medzi jedno z najpodstatnejších partnerstiev v ľudských génoch. V súčasnosti ju tvorí viac ako 3,300 61 autorov a tiež 25 výskumov z XNUMX krajín.

Ben Neale, spoluriaditeľ Programu pre lekársku a populačnú genetiku a tiež hlavný autor výskumu, uviedol, že hoci očkovanie poskytuje obranu proti infekcii, v liečbe liekom COVID-19 stále existuje značný priestor na renováciu, ktorý môže byť oznámený dedičnou analýzou. Zahrnul, že zdokonalenie terapeutických techník môže pomôcť zmeniť pandémiu - ktorá si skutočne vyžaduje veľké uzávery na veľkej časti sveta - na pôvodný stav na ostrove, ktorý je oveľa lokálnejší a tiež existuje pri znížených, avšak stupňa v populácii, rovnako ako chrípka.

"Čím lepšie sa budeme liečiť COVID-19, tým lepšie bude lekárska komunita vybavená na zvládnutie choroby," uviedol. "Keby sme mali mechanizmus na liečenie infekcie a na to, aby sme niekoho dostali z nemocnice, radikálne by to zmenilo našu reakciu na verejné zdravie."

Využitie rozmanitosti

Na vykonanie svojej analýzy konzorcium zlúčilo lekárske a tiež dedičné informácie od takmer 50,000 2 klientov vo svojom výskume, ktorí skontrolovali priaznivý stav infekcie, a tiež 23 milióny kontrol v nespočetných biobankách, lekárskych výskumoch a tiež v dedičných obchodoch zameraných priamo na spotrebiteľa, napríklad ako XNUMXandMe. Vďaka veľkému množstvu informácií zhromažďovaných z celého sveta mali vedci schopnosť vytvárať štatisticky trvanlivé hodnotenia ešte rýchlejšie a tiež z lepšej rozmanitosti populácií, než aké dokáže niesť akýkoľvek iný tím.

Z 13 lokusov, ktoré doposiaľ určila skupina, mali 2 väčšie zákonitosti medzi klientmi východoázijského alebo juhoázijského pôvodu ako klienti európskeho pôvodu, čo zdôrazňuje význam rozmanitosti v dedičných súboroch údajov.

"Boli sme oveľa úspešnejší ako minulé snahy o odber vzoriek genetickej rozmanitosti, pretože sme vyvinuli spoločné úsilie s cieľom osloviť populácie po celom svete," uviedol Daly. "Myslím si, že nás čaká ešte dlhá cesta, ale sme dosahujú veľmi dobrý pokrok. “

Skupina osobitne zdôraznila medzi týmito 2 lokusmi blízko genetiky FOXP4, ktorá je spojená s bunkami rakoviny pľúc. Verzia FOXP4 spojená s extrémnym COVID-19 zvyšuje genetický výraz a odporúča, aby brzdenie genetiky mohlo byť perspektívnou liečebnou metódou. Ďalšie miesta spojené s extrémnym COVID-19 pozostávali z DPP9, genetiky navyše spojenej s bunkami rakoviny pľúc a tiež pľúcnej fibrózy, a tiež TYK2, ktorá je spojená s niektorými autoimunitnými ochoreniami.

Mari Niemi, dodatočne na FIMM a tiež vedúca odborníčka na výskum, uvádza, že konzorcium sa zameriava na interakciu, keď vedci hodnotili informácie, a okamžite zverejňujú výsledky na svojej internetovej stránke po presnom vyhľadaní. Skupina si želá, aby sa ich výsledky zamerali na pomocné ciele pre lieky, ktoré sa majú opätovne použiť.

Vedci určite zostanú skúmať ešte viac informácií, ktoré sa dajú nájsť, a tiež vylepšiť svoje výsledky usporiadaním „Matters Arising“ na adresepríroda Určite začnú skúmať, čo odlišuje „diaľkových dopravcov“ alebo klientov, ktorých príznaky a príznaky COVID-19 pretrvávajú mesiace, od ostatných, a tiež zostanú rozpoznávať pridané miesta spojené s infekciou a tiež extrémnym stavom.

"Chceli by sme sa v budúcom roku zamerať na získanie zopár veľmi konkrétnych terapeutických hypotéz," uviedol Daly. "Realisticky sa budeme s COVID-19 s najväčšou pravdepodobnosťou dlho zaoberať ako s vážnym zdravotným problémom." Akékoľvek liečivo, ktoré sa objaví tento rok, napríklad z opätovného použitia existujúceho lieku na základe jasných genetických poznatkov, by malo veľký vplyv. “

Úplne nová oblasť pre gény

Ganna zdôraznil, že vedci majú schopnosť objavovať trvalé dedičné signály ako výsledok svojich kolektívnych iniciatív, prirodzeného ducha zdieľania údajov a tiež otvorenosti, ako aj závažnosti, ktorá zahŕňa pochopenie celej planéty, a stretáva sa s tým istým rizikom presne rovnaký čas. Zahrnul, že genetici, ktorí sa pravidelne zaoberajú veľkými súbormi údajov, skutočne veľmi dlho chápali výhody otvorenej spolupráce. "Toto iba ilustruje, o koľko je veda lepšia - o koľko rýchlejšie ide a koľko toho objavíme - keď pracujeme spolu," uviedla Ganna.

Daly je pre svoju zložku nadšený tým, aké jasné a interpretovateľné boli ich výsledky pre genetikov. Tvrdí, že chápanie tejto práce bolo v skutočnosti zvláštne a možno aj posunom paradigmy pre oblasť ľudských génov, ktorú skutočne kontrolovali výskumy obvyklých pretrvávajúcich chorôb, neobvyklých dedičných chorôb a tiež rakovinových buniek.

"Tieto objavy boli skutočne informatívne a vďaka čomu sme si uvedomili, že v genetike existuje veľa nevyužitého potenciálu na pochopenie a potenciálny vývoj terapeutík na infekčné choroby," uviedol Daly. "Dúfam, že to bude príkladom toho, ako môžeme priniesť prístupy populačnej genetiky k novému súboru problémov, ktoré sú obzvlášť dôležité v rozvojových častiach sveta."

Detonic