Омикрон: Роль Т-клеток

8eb4513b44bf68c6bcb46ebd83a95d1b - January 23, 2022По сценарию Тимоти Хузара в январе 10, 2022- Факт рассмотрен Фердинанд Лали, доктор философииПредставление двух сталкивающихся Т-клеток

  • Наряду с антителами Т-клетки играют важную роль в иммунной обратной связи против вируса.
  • Альтернатива SARS-CoV-2 Omicron имеет многочисленные аномалии, что позволяет предположить, что она может избежать обратной связи с антителами.
  • Тем не менее, исследование «здесь и сейчас» рекомендует, чтобы Т-клетки по-прежнему использовали безопасность, а не изменчивость.

В совершенно новом исследовании ученые фактически обнаружили доказательство того, что Т-клетки должны использовать безопасность по сравнению с альтернативой SARS-CoV-2 Omicron.

Исследование, опубликованное в журнале Viruses, закладывает основу для курсов повышения квалификации для подтверждения результатов поиска.

Т-клетки

Т-клетки выполняют ряд функций в иммунной системе организма. Профессор Розмари Бойтон с медицинского факультета отделения инфекционных заболеваний Имперского колледжа Лондона в Соединенном Королевстве обсуждает:

«Т-клетки могут играть разные роли. Они могут действовать как «клетки-убийцы», атаковать клетки, инфицированные вирусом или другим типом патогена, или они могут действовать как «клетки-помощники», поддерживая В-клетки для выработки антител ».

Профессор Флориан Керн, заведующий кафедрой иммунологии в Медицинской школе Брайтона и Сассекса, Великобритания, в беседе с «"Detonic.shop"» рассказал, что Т-клетки делают это, идентифицируя здоровые белковые фрагменты, состоящие из коротких цепочек аминокислот, также называемых пептидами. связаны с исследованиями здесь и сейчас.

Т-клеткам дополнительно требуется, чтобы пептиды были связаны со специализированными белками здоровой поверхности клетки, называемыми частицами MHC.

«У вакцинированных людей или у людей с предшествующей историей COVID-19 Т-клетки памяти будут быстро реагировать, если они снова столкнутся с теми же вирусными пептидами, связанными с теми же молекулами MHC».

«Однако, если пептиды, которые они первоначально распознали, больше не присутствуют в вирусе вследствие мутаций, эти Т-клетки памяти могли утратить свое предназначение. Это зависит от того, смогут ли они распознать мутировавшие пептиды», — заявил профессор Керн.

Альтернатива SARS-CoV-2 компании Omicron имеет множество аномалий, которые, по мнению исследователей, помогают ей убежать, уменьшая действие антител.

Однако, если Omicron не сможет убежать от Т-клеток, после этого они все еще могут иметь определенную степень защиты от вариации.

Вирусные штуки

Чтобы определить, может ли Omicron избежать обратной связи Т-клеток, ученые оценили 1,500 эпитопов SARS-CoV-2 — своего рода вирусную частицу.

«Авторы фактически загрузили список признанных пептидов SARS-CoV-2 из общедоступного репозитория и сопоставили их с аминокислотной последовательностью мутировавшего белка варианта Omicron».

«Это позволило им точно определить, какие из пептидов, распознаваемых в более ранних вариантах вируса, больше не существовали с точно такой же последовательностью в варианте Omicron», — заявил профессор Керн.

Подводя итоги поисков, профессор Гэри Маклин, преподаватель молекулярной иммунологии в Лондонском университете Метрополитен, Великобритания, которые не были связаны с исследованием, заявил MNT, что индивидуальная устойчивость Т-клеток к вариации Омикрона должна по-прежнему использовать некоторую безопасность:

«Это исследование, основанное на биоинформатике, в котором рассматриваются эпитопы Т-клеток, обнаруженные в варианте SARS-CoV-2 Omicron. В нем указано, что подавляющее большинство предсказанных эпитопов Т-клеток спайков Omicron не изменены в этом варианте, что говорит о том, что существующий Т-клеточный иммунитет к Omicron от вакцинации или естественной инфекции не должен сильно пострадать».

Профессор Керн согласился. «Авторы подвергли соответствующие измененные пептидные последовательности, обнаруженные в Omicron, ряду компьютерных алгоритмов, которые хорошо предсказывают, могут ли определенные пептиды связываться с определенными молекулами MHC. Они обнаружили, что только некоторые из этих пептидов, вероятно, утратили способность связываться с теми же молекулами MHC, что и их немутантные предшественники ».

«Это дало им уверенность в том, что подавляющее большинство пептидов, важных для ответа Т-клеток на SARS-CoV-2, не были затронуты мутациями, обнаруженными в Omicron, и по-прежнему будут связываться с молекулами MHC, с которыми связаны немутированные последовательности. ».

– Профессор Флориан Керн

Профессор Маклин помнил, что «ограничением [исследования] является отсутствие биологических исследований, подтверждающих выводы. По этой причине результаты исследования носят несколько предварительный характер».

«В то же время неудивительно, что Т-клеточные эпитопы в этом варианте менее затронуты. Известно также, что это явление происходит с другими респираторными вирусами человека и свидетельствует о том, что Т-клеточный иммунитет к SARS-CoV-2, однажды установленный, потенциально более широко защитный и [может быть более] важным, чем антитела».

«Хотя антитела эффективны для нейтрализации SARS-CoV-2, мутации в шиповидном белке в новых вариантах часто приводят к снижению способности ранее существовавших антител делать это».

«Эти данные могут указывать на то, что Т-клеточный иммунитет лучше защищает от тяжелых заболеваний, вызванных Омикроном, чем антитела, что подтверждает некоторые недавние клинические данные», — порекомендовал профессор Маклин.

Профессор Мэтью Маккей, соавтор исследования из Мельбурнского университета в Австралии, заявляет: «Несмотря на то, что это предварительное исследование, мы считаем, что это позитивная новость».

«Даже если Omicron — или какой-либо другой вариант, если уж на то пошло — потенциально может избежать антител, можно ожидать, что сильный ответ Т-клеток обеспечит защиту и поможет предотвратить серьезное заболевание».

Уклонение от Т-клеток

В беседе с MNT д-р Ахмед Абдул Куадир, соавтор исследования с факультета электронной и вычислительной техники Гонконгского университета науки и технологий, заявил, что маловероятно, что вариация может возникают, которые, безусловно, избежали бы обратной связи Т-клеток индивидуального иммунного ответа.

«Уклонение от ответов Т-клеток может быть относительно сложным. Это связано с тем, что, в отличие от нейтрализующих антител, которые в основном распознают шиповидный (поверхностный) белок SARS-CoV-2, Т-клетки распознают фрагменты нескольких белков вируса».

«Таким образом, Т-клетки, индуцированные инфекцией [SARS-CoV-2], довольно гетерогенны. Исследования показали, что даже в шиповидном белке, который является основным антигеном-мишенью нескольких вакцин против COVID-19, у каждого человека мишенями являются несколько эпитопов».

«Чтобы избежать такого обширного иммунного ответа, вирусу необходимо будет произвести значительно больше мутаций, чем мы видели до сих пор, что может быть нежизнеспособным для вируса», — заявил доктор Квадир.

Профессор Маклин согласился. «В целом, вероятность появления вариантов, ускользающих от Т-клеточного иммунитета, менее вероятна, поскольку Т-клеточные эпитопы часто испытывают меньшее давление на изменение, в отличие от эпитопов антител, которые имеют тенденцию группироваться в поверхностных областях шипа, которые имеют критическую функцию, позволяющую проникновение вируса в клетки ».

«Т-клетки действуют, ища и уничтожая клетки, зараженные вирусом, нацеливаясь на разные части шипа по сравнению с [с] антителами, тем самым допуская мутации, обнаруженные в новых вариантах».

Естественное заражение или прививка?

Доктор Квадир заявил, что Т-клетки, вероятно, будут использовать безопасность независимо от того, были ли они созданы в соответствии с инокуляцией или полностью естественной инфекцией — тем не менее, для подтверждения этого требуются дополнительные исследования.

«Было продемонстрировано, что как естественная инфекция, так и вакцины против COVID-19 вызывают сильный Т-клеточный ответ. Тем не менее, многое нужно понять о конкретных различиях и сходствах между ответами Т-клеток, вызванными естественной инфекцией и вакцинами. Сейчас это активно изучается».

«Есть некоторые очевидные различия между двумя ответами, основанными на составе вакцин против COVID-19».

«Было показано, что для вакцин, ориентированных на спайки, ответы Т-клеток распознают несколько эпитопов спайкового белка. Что касается цельновирусных инактивированных вакцин, то, хотя литературы относительно мало, было показано, что ответы Т-клеток нацелены, помимо шиповидного белка, на другие структурные белки, такие как нуклеокапсидные и мембранные белки».

«В случае инфекции [SARS-CoV-2] было обнаружено, что Т-клетки нацелены на фрагменты нескольких белков вируса в ходе многочисленных экспериментальных исследований, проведенных с использованием крови людей из разных географических регионов — обзор см. в нашей предыдущей работе. ».

«Сходство между реакциями Т-клеток, вызванными вакцинами, и естественной инфекцией также было показано в новых исследованиях. Например, в некоторых исследованиях сообщалось, что Т-клетки, вызванные как инфекцией [SARS-CoV-2], так и вакцинами, нацелены на аналогичные фрагменты», — описал доктор Куадир.