Progres CLEVER în descoperirea versiunii SARS-CoV-2 în apele uzate

Progresă SMART în detectarea variantei SARS-CoV-2 în apele uzate

Cercetători din cadrul grupului de cercetare interdisciplinară antimicrobiană de rezistență (AMR) (IRG) de la Singapore-MIT Alliance for Research, precum și Technology (SMART), activitatea de cercetare a MIT din Singapore, împreună cu parteneri de la Biobot Analytics, Nanyang Technological University (NTU) ca precum și Institutul de Tehnologie din Massachusetts (MIT), au creat efectiv o tehnică de descoperire moleculară de vârf, cu sursă deschisă, care are capacitatea de a detecta și de a măsura versiunea B. 1.1.7 (Alpha) a SARS-CoV- 2. Progresul este calea pentru monitorizarea rapidă și accesibilă a diferitelor alte variante SARS-CoV-2 în apele uzate.

Pe măsură ce globul rămâne să lupte, precum și să aibă COVID-19, recunoașterea actuală a variațiilor SARS-CoV-2 cu transmisibilitate mai mare, precum și intensitatea sporită a făcut de fapt necesitatea avansării unor tehnici practice de monitorizare alternative. În prezent, variațiile recunoscute constau în alternativa B. 1.17 (Alpha) recunoscută pentru prima dată în Regatul Unit, precum și în varianta B. 1.617.2 (Delta) găsită pentru prima dată în India

Monitorizarea apelor uzate a devenit de fapt un dispozitiv esențial de sănătate publică pentru a urmări în siguranță, precum și pentru a urmări în mod eficient epidemia SARS-CoV-2 într-un mod neintruziv, oferind informații corespunzătoare care permit autorităților de sănătate să obțină informații viabile la nivel de comunitate. În ultima vreme, bucăți virale de SARS-CoV-2 au fost găsite în proprietăți imobiliare din Singapore printr-un program pozitiv de monitorizare a apelor uzate. Aceste informații, împreună cu monitorizarea screening-ului, au permis Ministerului Sănătății din Singapore (MOH) să reacționeze cu promptitudine, să separe și să efectueze examene de tamponare ca componentă a procedurilor preventive.

Cu toate acestea, identificarea variațiilor prin monitorizarea apelor uzate este mult mai puțin tipică ca urmare a dificultăților din tehnologia modernă existentă. Secvențierea de nouă generație (NGS) pentru monitorizarea apelor uzate este lungă și costisitoare. În plus, acestea nu au nivelul de sensibilitate solicitat pentru a identifica bogățiile alternative reduse în exemplele de apă uzată slăbite, precum și combinate ca urmare a acoperirii asigurării neregulate și / sau secvențiale reduse.

Tehnica creată de oamenii de știință este personalizată în mod distinct pentru a face față acestor dificultăți, precum și pentru a crește energia monitorizării apelor uzate în trecut pentru screening-ul SARS-CoV-2, în direcția urmăririi răspândirii variațiilor problemei SARS-CoV-2. Dr. Wei Lin Lee, cercetător la SMART AMR, precum și primul scriitor pe lucrarea inclusă, „Acest lucru este deosebit de important în țările care se luptă cu variantele SARS-CoV-2. Supravegherea apelor uzate va ajuta la aflarea proporției și răspândirii adevărate a variantelor în comunitățile locale. Metoda noastră este suficient de sensibilă pentru a detecta variante în concentrații de SARS-CoV-2 foarte diluate observate în mod obișnuit în probele de apă uzată și produce rezultate fiabile chiar și pentru probele care conțin mai multe linii de SARS-CoV-2. ”

Condus de profesorul asociat Janelle Thompson de la NTU, precum și de profesorul MIT, precum și de cercetătorul principal SMART AMR, Eric Alm, studiul grupului „Cantitative SARS-CoV-2 Alpha variant B.1.1.7 Tracking in Wastewater by Allele-Specific RT -qPCR ”a fost de fapt lansat în Scrieri de știință și tehnologie ale mediului Studiul de cercetare discută despre tehnica de descoperire moleculară ingenioasă, cu sursă deschisă, bazată pe RT-qPCR specifică alelelor, care identifică și măsoară versiunea B. 1.1.7 (Alpha). Testul creat, verificat și verificat în exemple de ape uzate în 19 zone din Statele Unite, are capacitatea de a detecta cu precizie, precum și de a măsura gradele reduse ale alternativei B. 1.1.7 (Alpha) cu reactivitate încrucișată redusă, ca precum și la procentaje alternative la 1% într-un istoric de infecții combinate cu SARS-CoV-2.

Țintind anomaliile proteice sănătoase care anticipează foarte mult alternativa B. 1.1.7 (Alpha), tehnica poate fi realizată utilizând metode RT-qPCR ușor disponibile. Spre deosebire de articolele ușor disponibile, care utilizează ghiduri exclusive, precum și sonde pentru monitorizarea apelor uzate, informațiile pe hârtie, tehnica open-source, precum și avansarea acesteia, care pot fi utilizate în mod deschis de diferite alte companii, precum și de institutele de studii de cercetare pentru tratarea apelor uzate monitorizarea SARS-CoV-2, precum și a variațiilor sale.

Progresul realizat de grupul de studiu de cercetare din Singapore este utilizat în prezent de Biobot Analytics, un lider mondial în domeniul sănătății publice a apelor uzate cu sediul în Cambridge, Massachusetts, în Statele Unite, oferind atât statelor, cât și regiunilor din întreaga țară. Folosind tehnica, Biobot Analytics are capacitatea de a aproba și de a evalua exemple de ape uzate pentru alternativa B. 1.1.7 (Alpha), precum și intenționează să includă variații suplimentare la evaluarea sa pe măsură ce sunt create tehnici.

„Folosind metoda inovatoare a echipei, am reușit să monitorizăm varianta B.1.1.7 (Alpha) în populațiile locale din SUA - împuternicind liderii cu informații despre tendințele COVID-19 din comunitățile lor și permițându-le să facă recomandări și recomandări considerate și modificări ale măsurilor de control ”, a susținut dr. Mariana Matus, CEO Biobot Analytics, precum și cofondator.

Grupul SMART AMR creează în prezent teste speciale care vor avea cu siguranță capacitatea de a detecta și de a măsura alternativa B. 1.617.2 (Delta), care a fost recunoscută în ultima vreme ca o variație a problemei de către Organizația Mondială a Sănătății

„Această metodă poate fi rapid adaptată pentru a detecta noi variante de îngrijorare dincolo de B.1.1.7”, a afirmat scriitorul corespondent, profesorul Eric Alm de la MIT, precum și investigatorul principal la SMART AMR. „Parteneriatul nostru cu Biobot Analytics ne-a tradus cercetările în impactul real al lumii dincolo de țărmurile Singapore și a ajutat la detectarea COVID-19 și a variantelor sale, servind ca un sistem de avertizare timpurie și îndrumare pentru factorii de decizie politică în timp ce urmăresc grupurile de infecții și iau în considerare măsuri adecvate de sănătate publică. ”

Studiul de cercetare este executat de SMART, precum și susținut de Fundația Națională de Cercetare (NRF) Singapore, în cadrul programului Campus pentru Excelență în Cercetare și Întreprindere Tehnologică (CREATE).

Detonic