Cum să faceți seturi de date de cercetare biomedicală interactive

Cum putem face ca datele cercetării biomedicale să poată interacționa?

Principiul interoperabilității definește capacitatea diferitelor sisteme de conectare. Aceasta este o dificultate semnificativă în cercetarea biomedicală, precum și în mod specific, în domeniul medicației personalizate, care se bazează în principal pe colectarea, precum și pe evaluarea a nenumărate seturi de date. În circumstanțe, pandemia COVID-19 a relevat că, de asemenea, atunci când , pe măsură ce sunt ridicate restricții legale, precum și oneste, informațiile continuă să fie greu de evaluat ca urmare a obscurităților semantice. Sub egida Rețelei de sănătate personalizate elvețiene (SPHN), precum și în strânsă cooperare cu reprezentanți din toate cele 5 spitale de predare elvețiene, precum și eHealth Suisse, un grup de cercetători de la Universitatea din Geneva (UNIGE), precum și de la spitalele universitare din Geneva (HUG), în cooperare cu Institutul Elvețian de Bioinformatică SIB, precum și Spitalul Universitar Lausanne (CHUV), au creat de fapt tehnica pentru un cadru național îmbrățișat de toate spitalele de predare elvețiene, precum și de unitățile școlare. Cu strategia sa practică, această tehnică se bazează pe avansarea unei structuri semantice obișnuite care nu are ca obiectiv modificarea cerințelor existente, însă să le utilizeze într-un mijloc de colaborare și versatil, în funcție de cerințele cercetării, precum și ale însoțitorilor. presupus. Aplicarea acestei tehnici, care de fapt a început în prezent, constată o acțiune importantă pentru promovarea cercetării, precum și dezvoltarea unui medicament cu adevărat personalizat în Elveția

Medicația personalizată se bazează pe exploatarea, precum și pe evaluarea unor cantități uriașe de informații, indiferent dacă sunt genomice, epidemiologice sau de la imagistica clinică, până la definirea esenței. Pentru a putea face acest lucru, referințele încrucișate, precum și acumularea de informații la fel de inconfundabile sunt obligatorii, chiar și atunci când provin din resurse cu adevărat diverse.

Având în vedere acest lucru, guvernul federal elvețian a produs în 2017 Rețeaua Elvețiană Personalizată de Sănătate (SPHN), o campanie pusă sub conducerea Academiei Elvețiene de Științe Medicale în cooperare cu Institutul Elvețian de Bioinformatică SIB, care intenționează să facă publicitate utilizării ca precum și schimbul de informații privind sănătatea pentru cercetare „În ciuda investițiilor majore din ultimul deceniu, există încă disparități majore”, susține Christian Lovis, supervizor al Departamentului de Radiologie, precum și informatică medicală la Facultatea de Medicină UNIGE, precum și șef al Divizia de Științe ale Informației Medicale la HUG. „Acesta este motivul pentru care am dorit, împreună cu partenerii noștri și SPHN, să propunem o strategie și standarde comune care să fie suficient de flexibile pentru a găzdui tot felul de baze de date actuale și viitoare.”

O tehnică cu trei piloni

Ne conectăm la 3 cerințe majore: definiția pe care o oferim punctelor, deoarece trebuie să ne stabilim în mod obișnuit pentru a ne înțelege; o cerință tehnologică - zgomotul cu care vorbim; precum și, în cele din urmă, compania definiției, precum și zgomotul cu propoziții, precum și gramatica pentru a încadra interacțiunea într-un mijloc de înțeles. „În ceea ce privește datele, este același lucru, explică Christophe Gaudet-Blavignac, cercetător în echipa condusă de Christian Lovis. Trebuie să fiți de acord cu un semantic, pentru a reprezenta conceptual ceea ce trebuie comunicat. Apoi, avem nevoie de un limbaj compozițional pentru a combina aceste semnificații cu toată libertatea necesară pentru a exprima tot ceea ce trebuie exprimat. Și, în sfârșit, în funcție de proiectele și comunitățile de cercetare implicate, acest lucru va fi „tradus” după cum este necesar în modele de date, care sunt la fel de numeroase ca limbile vorbite în lume. ”

„Scopul nostru a fost, prin urmare, să unificăm vocabularele astfel încât să poată fi comunicate în orice gramatică, mai degrabă decât să creăm un vocabular nou de la zero pe care toată lumea ar trebui să îl învețe din nou”, susține Christian Lovis „În acest sens, federalismul elvețian este un avantaj imens : ne-a obligat să ne imaginăm o strategie descentralizată, care poate fi aplicată peste tot. Prin urmare, constrângerea a creat posibilitatea de a dezvolta un sistem care funcționează în ciuda limbilor, culturilor și reglementărilor locale. ” Acest lucru face posibilă utilizarea anumitor versiuni de informații doar pentru ultima acțiune care trebuie ajustată la stilurile solicitate de un anumit loc de muncă - aspectul Food and Drug Administration (FDA) atunci când vine vorba de cooperarea cu un grup american, ca de exemplu, sau orice alt fel de aspect diferit utilizat de o anumită națiune sau campanie de cercetare. Aceasta include o garanție de bună înțelegere, precum și o economie masivă de timp.

Nicio influență asupra apărării informației

Cu toate acestea, interoperabilitatea informațiilor nu implică schimbul metodic de informații. „Lumea bancară, de exemplu, a adoptat de mult standardele globale de interoperabilitate, subliniază Christophe Gaudet-Blavignac. Un simplu IBAN poate fi utilizat pentru a transfera bani din orice cont către oricare altul. Cu toate acestea, acest lucru nu înseamnă că oricine, fie că este vorba de persoane fizice, organizații private sau guverne, poate ști ce este în aceste conturi fără un cadru legal strict. ” Într-adevăr, ar trebui făcută o diferență între instrumentele care produc interoperabilitatea, precum și aplicarea lor, pe de o parte, precum și structura de reglementare care le reglementează ușurința de acces, pe de altă parte.

Aplicarea strategiei

Această tehnică a fost aplicată pas cu pas în Elveția, având în vedere că centrul anului 2019, în structura rețelei de sănătate personalizate din Elveția, „spitalele universitare elvețiene urmează deja strategia propusă de partajare a datelor interoperabile pentru toate proiectele de cercetare multicentrică finanțate de Inițiativa SPHN ”, înregistrează Katrin Crameri, supraveghetorul Grupului personalizat de informatică asupra sănătății la SIB, responsabil de Centrul de coordonare SPHNData. În plus, unele facilități medicale încep să execute această tehnică după campania SPHN.

Detonic