Os testes genômicos de águas residuais podem rastrear com eficácia as variantes de COVID-19 preocupantes

A pesquisa mostra que os testes genômicos de águas residuais podem rastrear com eficácia as variantes do COVID-19 que causam preocupação em uma região

O teste de águas residuais pode reconhecer com precisão e rapidez os graus de infecções por COVID-19 na área, consistindo no aumento de variantes preocupantes, recomenda um novo estudo de pesquisa liderado pelo professor da UBC, Dr. Ryan Ziels.

Ziels e também seus colegas de trabalho avaliaram exemplos de esgoto de 5 estações metropolitanas de águas residuais na área do Metro Vancouver ao longo de um período de contagens de instâncias COVID-19 aumentadas, de fevereiro a abril de 2021.

Os resultados, explicados online em preprint em medrxiv, revelaram que o foco viral em águas residuais acumuladas na área de Vancouver rastreou cuidadosamente o número de situações profissionais na área.

Os cientistas, que incluíam o aluno de design civil do Ph D. Xuan Lin, também descobriram que a regularidade das anomalias conectadas com variantes preocupantes em águas residuais estava altamente associada a padrões em situações cientificamente identificadas na área.

Nesta sessão de perguntas e respostas, o Dr. Ziels, um cientista de design ecológico que pesquisa ecologia microbiana, fala sobre as pesquisas do estudo de pesquisa - e também como os testes genômicos de águas residuais podem notificar a segurança de doenças e também as abordagens de administração.

Como você passou a ser associado a este estudo de pesquisa?

Na verdade, tenho pesquisado o sequenciamento genômico de águas residuais por vários anos e também quando a pandemia se agravou, escolhi usar esse conhecimento para compreender a infecção por SARS-CoV-2 em cooperação com vários outros cientistas. Nosso grupo consiste de microbiologistas ecológicos, designers e também epidemiologistas (na UBC e também no BC CDC), e também tivemos o privilégio de trabalhar junto com o Metro Vancouver em nosso trabalho.

Como várias outras doenças, a infecção SARS-CoV-2 é descartada nas fezes durante a infecção, e também pedaços do genoma viral podem ser encontrados em águas residuais metropolitanas.

A enorme investigação era apenas como podemos identificar essas peças com rapidez e também com precisão, a fim de oferecer informações extras diretamente para o conjunto de ferramentas de saúde pública e bem-estar geral?

Que técnicas você usou para medir e também rastrear as variantes de preocupação nas águas residuais do Metro Vancouver?

Eu estabeleci anteriormente um método de sequenciamento rápido e preciso usando sequenciadores de DNA portáteis, e também com algumas alterações meu grupo e também usei esse sistema para medir pedaços do genoma do coronavírus em exemplos de águas residuais da área de Vancouver.

O que estamos fazendo se assemelha ao trabalho da CanCOGeN, a Canadian COVID Genomics Network - um consórcio do governo canadense, autoridades rurais e também de saúde pública local e autoridades de bem-estar, que está sequenciando aproximadamente 150,000 genomas virais em todo o Canadá. Mas abaixo, em vez de sequenciar exemplos de pessoas , estamos sequenciando exemplos de águas residuais que acumulam insumos de populações inteiras em uma área.

Quais foram suas pesquisas vitais para?

Em termos de medição da quantidade de fragmentos do genoma do coronavírus, descobrimos um pequeno sinal muito precoce em contraste com as modificações nas internações hospitalares ou no número de instâncias. Isso recomendou que o teste de águas residuais pode oferecer algum tipo de cautela inicial.

Com o sequenciamento do genoma de águas residuais, podemos identificar aumentos em anomalias relacionadas com variantes preocupantes, e também oferecemos essas informações às nossas autoridades de saúde e bem-estar como uma ajuda adicional em suas abordagens de saúde pública e bem-estar.

Temos a capacidade de ajustar nossa abordagem para buscar variantes emergentes e também obter uma imagem de toda a área em um exemplo. O sequenciamento do genoma também nos permitiu identificar em quais galerias de esgoto no Metro Vancouver as variantes estavam se tornando mais importantes.

O sequenciamento rápido de informações virais nos permite oferecer respostas realmente rápidas - oferecemos registros para atualizar nossos policiais clínicos de saúde e bem-estar em apenas 3 a 4 dias a partir da coleta de exemplos.

Quais são os efeitos para futuros testes de pandemia e também administração?

Há um estudo de pesquisa em expansão de que a degustação de águas residuais pode servir para compreender o grau de infecções por COVID-19 em áreas. Nosso objetivo é complementar, e não alterar, várias outras técnicas de teste de saúde pública. O teste de águas residuais pode servir quando o teste profissional é desafiador ou não em uma área metropolitana.

Da mesma forma, estamos aceitando que a Rede Canadense de Água desenvolva uma equipe de trabalho em todo o país que compartilhe conhecimentos sobre o rastreamento de águas residuais. Essa rede nacional pode trazer informações confiáveis ​​à medida que avançamos na direção da reabertura de nossa situação econômica.