Como tornar interativos conjuntos de dados de pesquisa biomédica

Como fazer com que os dados da pesquisa biomédica possam interagir?

O princípio de interoperabilidade define a capacidade de conexão de vários sistemas. Esta é uma dificuldade significativa na pesquisa biomédica, e também especificamente na área de medicação customizada, que se baseia principalmente na coleta e avaliação de inúmeros conjuntos de dados. Por circunstâncias, a pandemia COVID-19 realmente revelou que também quando a tecnologia , restrições legais e honestas são levantadas, as informações continuam a ser difíceis de avaliar como resultado de obscuridades semânticas. Sob os auspícios da Rede Suíça Personalizada de Saúde (SPHN), bem como em estreita cooperação com representantes de todos os 5 hospitais universitários suíços, bem como eHealth Suisse, um grupo de pesquisadores da Universidade de Genebra (UNIGE), bem como dos hospitais universitários de Genebra (HUG), em cooperação com o Instituto Suíço de Bioinformática SIB e também com o Hospital Universitário Lausanne (CHUV), criaram a técnica para uma estrutura nacional adotada por todos os hospitais universitários suíços, bem como estabelecimentos escolares. Com sua estratégia prática, esta técnica baseia-se no avanço de uma estrutura semântica usual que não objetiva alterar os requisitos existentes, mas utilizá-los de forma colaborativa e versátil de acordo com as demandas da pesquisa e também dos acompanhantes. implicado. A aplicação dessa técnica, efetivamente iniciada, indica uma importante ação de fomento à pesquisa e ao desenvolvimento de um medicamento genuinamente customizado na Suíça.

A medicação personalizada é baseada na exploração e avaliação de grandes quantidades de informações, sejam genômicas, epidemiológicas ou de imagens clínicas, até a definição da essência. Para isso, é obrigatório o cruzamento de referências, bem como o acúmulo de informações igualmente inconfundíveis, inclusive quando se originam de recursos realmente diversos.

Com isso em mente, o governo federal suíço produziu em 2017 a Rede de Saúde Personalizada Suíça (SPHN), uma campanha colocada sob a gestão da Academia Suíça de Ciências Médicas em cooperação com o Instituto Suíço de Bioinformática SIB que pretende divulgar o uso como além da troca de informações de bem-estar para pesquisa “Apesar dos grandes investimentos na última década, ainda existem grandes disparidades”, afirma Christian Lovis, supervisor do Departamento de Radiologia e Informática Médica da Faculdade de Medicina da UNIGE e chefe do Divisão de Ciências da Informação Médica do HUG. “É por isso que queríamos, com nossos parceiros e a SPHN, propor uma estratégia e padrões comuns que fossem flexíveis o suficiente para acomodar todos os tipos de bancos de dados atuais e futuros.”

Uma técnica de três pilares

Conectamos em 3 requisitos principais: a definição que oferecemos aos pontos, uma vez que precisamos estabelecer uma base usual para compreender uns aos outros; uma exigência tecnológica - o ruído com que falamos; bem como, em última análise, a companhia da definição e do ruído com as frases e a gramática para enquadrar a interação de uma forma apreensível. “Em termos de dados, é a mesma coisa, explica Christophe Gaudet-Blavignac, pesquisador da equipe liderada por Christian Lovis. Você tem que concordar com uma semântica, para representar conceitualmente o que deve ser comunicado. Então, precisamos de uma linguagem composicional para combinar esses significados com toda a liberdade necessária para expressar tudo o que precisa ser expresso. E, finalmente, dependendo dos projetos e comunidades de pesquisa envolvidas, isso será 'traduzido' conforme necessário em modelos de dados, que são tão numerosos quanto as línguas faladas no mundo ”.

“Nosso objetivo, portanto, foi unificar vocabulários para que possam ser comunicados em qualquer gramática, ao invés de criar um novo vocabulário do zero que todos teriam que aprender de novo”, afirma Cristian Lovis “Nesse sentido, o federalismo suíço é uma grande vantagem : obrigou-nos a imaginar uma estratégia descentralizada, que pode ser aplicada em qualquer lugar. A restrição, portanto, criou a oportunidade de desenvolver um sistema que funcione apesar dos idiomas, culturas e regulamentos locais. ” Isso torna viável o uso de versões de informações específicas apenas para a última ação a ser ajustada aos estilos exigidos por um determinado trabalho - o layout Food and Drug Administration (FDA) quando se trata de cooperação com um grupo americano, como um exemplo, ou qualquer outro tipo de layout específico utilizado por uma determinada nação ou campanha de pesquisa. Isso inclui uma garantia de bom entendimento e também uma grande economia de tempo.

Sem influência na defesa da informação

No entanto, a interoperabilidade de informações não implica em compartilhamento metódico de informações. “O mundo bancário, por exemplo, há muito adotou padrões globais de interoperabilidade, enfatiza Christophe Gaudet-Blavignac. Um simples IBAN pode ser usado para transferir dinheiro de qualquer conta para outra. No entanto, isso não significa que qualquer pessoa, sejam eles indivíduos, organizações privadas ou governos, pode saber o que está nessas contas sem uma estrutura legal estrita. ” Com efeito, há que distinguir entre as ferramentas que produzem interoperabilidade e a sua aplicação, por um lado, e a estrutura reguladora que regula a sua facilidade de acesso, por outro.

Aplicação de estratégia

Esta técnica vem sendo aplicada passo a passo na Suíça considerando que o centro de 2019, na estrutura da Rede Suiça de Saúde Personalizada “Os hospitais universitários suíços já estão seguindo a estratégia proposta de compartilhar dados interoperáveis ​​para todos os projetos de pesquisa multicêntricos financiados pelo Iniciativa SPHN ”, registra Katrin Crameri, supervisora ​​do Grupo de Informática em Saúde Personalizada no SIB, responsável pelo Centro de Coordenação SPHNData. Além disso, algumas instalações médicas estão começando a executar esta técnica após a campanha SPHN.