COVID-19: Geneticistas criticam esforços de sequenciamento insatisfatórios nos EUA

Imprima as informações de DNA com uma cruz vermelha

  • O sequenciamento genético do SARS-CoV-2, o vírus que causa o COVID-19, é vital para rastrear a disseminação de variantes existentes e identificar rapidamente novas variantes preocupantes.
  • Escrevendo na revista PLOS Genetics, os cientistas dizem que os Estados Unidos não contribuíram de forma adequada para esses esforços de vigilância global.
  • Eles culpam a coordenação central deficiente e, até recentemente, a falta de financiamento.

“Conheça o seu inimigo” tem sido o mantra dos generais pelo menos desde o século 5 aC, quando o estrategista militar chinês Sun Tzu cunhou a frase em A Arte da Guerra.

O princípio é tão importante quando seu inimigo é um vírus em rápida evolução que já matou mais de 4 milhões de pessoas em todo o mundo.

Tradicionalmente, a vigilância de doenças infecciosas por órgãos públicos, como a Organização Mundial da Saúde (OMS) e os Centros para Controle e Prevenção de Doenças (CDC), tem se concentrado em dados como números de casos, hospitalizações e óbitos.

Mais recentemente, no entanto, o sequenciamento rápido do genoma permitiu que especialistas em saúde pública pesquisassem a variação entre os patógenos até o nível de suas bases de DNA ou RNA, que são as letras químicas do código genético.

No entanto, de acordo com geneticistas populacionais da Case Western Reserve University em Cleveland, OH, alguns países negligenciaram essa linha vital de informação durante a pandemia de COVID-19.

“Apesar da disponibilidade e onipresença do sequenciamento em vários países, a adoção da genômica como estratégia para vigilância de patógenos tem sido lenta, difícil e inconsistente”, escreve Dana Crawford, Ph.D. e Scott Williams, Ph.D., no jornal PLOS Genetics.

Os cientistas, que trabalham no Departamento de População e Ciências Quantitativas da Saúde da universidade, destacam os EUA para críticas específicas.

“Para um país que liderou o sequenciamento do genoma humano há mais de 2 décadas, a falta de acúmulo de dados de sequenciamento em meio a essa pandemia é inacreditável e problemática”, escrevem eles.

Eles observam que o país tem capacidade e experiência para realizar o trabalho de sequenciamento necessário, mas esses recursos permaneceram “relativamente inativos” até recentemente.

Por exemplo, havia menos de 7,000 novas sequências do vírus na semana de 6 de março de 2021, de mais de 415,000 novos casos registrados na mesma semana.

Falta de coordenação 'chocante'

“Para aqueles de nós em genética e genômica humana, a capacidade e a experiência de sequenciamento dos Estados Unidos nunca estiveram em questão”, disse o professor Crawford ao "Detonic.shop".

“Chocante para nós foi a falta de qualquer esforço coordenado até quase um ano após o início da pandemia.”

Eles escrevem que, no início de abril de 2021, os EUA estavam em 33º lugar no mundo em termos de porcentagem de casos COVID-19 sequenciados, ante 36º semanas antes.

Outros especialistas citaram o financiamento insuficiente, a falta de maneiras robustas de rastrear amostras e compartilhar dados e regulamentações rígidas sobre como isso pode ser feito, como possíveis razões para o déficit.

“Essas variáveis, que não são exclusivas dos Estados Unidos, foram tratadas com sucesso por outros países, como Dinamarca e Reino Unido”, escrevem os Profs. Crawford e Williams.

O professor Crawford reconheceu que a abordagem descentralizada, pública e privada da saúde nos Estados Unidos - em contraste com o Serviço Nacional de Saúde (NHS) do Reino Unido - era parcialmente culpada.

“Enquanto a abordagem dos EUA à saúde pode ser um fator importante, também o é a quase ausência de colaboração explícita e investimento em genética e genômica humana por parte da agência de saúde pública primária do país”, disse o Prof. Crawford ao MNT.

Os dois geneticistas escrevem em seu artigo que esse preconceito dentro dos Centros de Controle e Prevenção de Doenças (CDC) criou uma “lacuna” em nossa compreensão da evolução do COVID-19.

Em contraste com a “abordagem relativamente descoordenada e antiquada” da vigilância genômica do SARS-CoV-2 nos Estados Unidos, eles escrevem que programas bem-sucedidos de vigilância de sequenciamento de saúde pública em outros lugares adotaram a tecnologia no início da pandemia.

A China publicou a primeira sequência SARS-CoV-2 em fevereiro de 2020, o que permitiu comparações de sequências à medida que o vírus evoluía e o desenvolvimento rápido sem precedentes de vacinas.

O Reino Unido formou o COVID-19 Genomics UK Consortium em abril de 2020 e, desde então, registrou mais de 650,000 sequências.

Injeção de fundos extras

Os autores escrevem que, embora o financiamento tenha impedido os esforços iniciais nos Estados Unidos, em fevereiro de 2021, o CDC comprometeu mais de US $ 200 milhões para o sequenciamento.

Em abril de 2021, a Casa Branca anunciou mais uma injeção de US $ 1 bilhão em fundos para aumentar a capacidade de sequenciamento.

O principal problema agora é que os Estados Unidos não têm uma coorte organizada e contínua de indivíduos com base na população que possa ser usada para estudos COVID-19, afirmam os Profs. Crawford e Williams.

Eles escrevem:

“O acesso aos dados é isolado e as amostras são mantidas (ou descartadas) por uma infinidade de laboratórios desconectados, públicos e privados. Essa balcanização da saúde pública e dos esforços de teste não apenas retardou o processo; aumentou substancialmente as despesas. ”

Por outro lado, o Reino Unido pôde recorrer ao UK Biobank, um banco de dados biomédico estabelecido há muito tempo que contém informações genéticas e de saúde de meio milhão de pessoas.

“Uma questão óbvia é qual é a história natural de COVID-19 entre as variantes de sequência clinicamente”, disse o Prof. Christopher Chute, MD, da Escola de Saúde Pública Johns Hopkins Bloomberg.

O Prof. Chute faz parte do National COVID Cohort Collaborative (N3C), um consórcio estabelecido nos Estados Unidos em janeiro de 2021 para reunir dados de registros eletrônicos de saúde.

“Uma vez que o N3C cobre uma fração relativamente pequena de casos COVID-19, apesar de ser o maior repositório de casos COVID-19 nos EUA, mais sequências produziriam mais correlação clínica”, disse o Prof. Chute ao MNT.

Profs. Crawford e Williams reconhecem que as comparações entre os Estados Unidos e outros países são "um tanto injustas", visto que sua resposta à pandemia começou "sob um governo que já foi substituído".

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