90-letnia kobieta zarażona jednocześnie brytyjskimi i południowoafrykańskimi wariantami COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

Naukowcy w Belgii opisują przypadek 90-letniej kobiety, która była jednocześnie zarażona dwoma różnymi wariantami obawy (VOC) COVID-19, w raporcie przypadku przedstawionym na Europejskim Kongresie Mikrobiologii Klinicznej i Chorób Zakaźnych ( ECCMID), które odbyły się w tym roku online.

3 marca 2021 roku kobieta, której historia medyczna nie była znacząca, po serii upadków została przyjęta do szpitala OLV w belgijskim mieście Aalst. Tego samego dnia miała pozytywny wynik testu na COVID-19. Mieszkała sama i otrzymywała opiekę pielęgniarską w domu i nie była szczepiona przeciwko COVID-19.

Początkowo nie było oznak niewydolności oddechowej, a pacjent miał dobre saturację tlenem. Jednak szybko rozwinęły się u niej objawy ze strony układu oddechowego i zmarła pięć dni później.

Kiedy próbka oddechowa pacjenta została przebadana na obecność lotnych związków organicznych za pomocą PCR, odkryli, że została zarażona dwoma różnymi szczepami wirusa – jednym pochodzącym z Wielkiej Brytanii, znanym jako B.1.1.7 (Alfa), i drugim, który był pierwszym wykryty w Afryce Południowej (B.1.351; Beta).

Obecność obu szczepów potwierdzono metodą PCR na drugiej próbce oddechowej, sekwencjonowaniem genu S i sekwencjonowaniem całego genomu.

„Jest to jeden z pierwszych udokumentowanych przypadków koinfekcji dwoma niepokojącymi wariantami SARS-CoV-2”, mówi naczelna autorka i biolog molekularny dr Anne Vankeerberghen ze szpitala OLV w Aalst w Belgii. „Oba te warianty krążyły w tym czasie w Belgii, więc prawdopodobne jest, że kobieta została zarażona różnymi wirusami od dwóch różnych osób. Niestety nie wiemy, jak się zaraziła”.

14 grudnia 2020 r. władze Wielkiej Brytanii poinformowały WHO o wykryciu wariantu (B.1.1.7; Alpha) w południowo-wschodniej Anglii (Kent). W ciągu kilku tygodni wariant ten przejął szczepy wirusa krążące w tym regionie i od tego czasu rozprzestrzenił się w ponad 50 krajach, w tym w Belgii. 18 grudnia 2020 r. władze RPA poinformowały, że wykryto wariant (B.1.351; Beta), który szybko rozprzestrzeniał się w trzech prowincjach RPA, a obecnie został zidentyfikowany w co najmniej 40 krajach, w tym w Belgii.

W styczniu 2021 r. naukowcy z Brazylii poinformowali, że dwie osoby zostały jednocześnie zarażone dwoma różnymi szczepami koronawirusa — brazylijskim wariantem znanym jako B.1.1.28 (E484K) i nowym wariantem VUI-NP13L, który został wcześniej odkryty w Rio Grande do Sul. Ale badanie nie zostało jeszcze opublikowane w czasopiśmie naukowym [1]. Wcześniejsze badania wskazywały na osoby zarażone różnymi szczepami grypy [2].

„Trudno powiedzieć, czy współzakażenie dwóch wariantów obaw odegrało rolę w szybkim pogorszeniu stanu pacjenta”, mówi Vankeerberghen. „Do tej pory nie opublikowano żadnych innych spraw. Jednak globalne występowanie tego zjawiska jest prawdopodobnie niedoszacowane ze względu na ograniczone testy pod kątem wariantów budzących obawy i brak prostego sposobu identyfikacji koinfekcji z sekwencjonowaniem całego genomu”.

Kontynuuje: „Ponieważ koinfekcje z podejrzanymi wariantami można wykryć tylko za pomocą analizy LZO pozytywnych próbek, zachęcamy naukowców do wykonywania szybkiej, łatwej i taniej analizy LZO metodą PCR na dużej części ich pozytywnych próbek, a raczej niż tylko sekwencjonowanie całego genomu w małej proporcji. Niezależnie od zastosowanej techniki, bycie wyczulonym na koinfekcje pozostaje kluczowe”.