Omicron: T-cellenes rolle

8eb4513b44bf68c6bcb46ebd83a95d1b - January 23, 2022Skrevet av Timothy Huzar januar 10, 2022- Fakta undersøkt av Ferdinand Lali, Ph D.Representasjon av to T-celler som kolliderer

  • Ved siden av antistoffer er T-celler en hovedrolle i immunfeedback kontra virus.
  • Omicron-alternativet til SARS-CoV-2 har mange anomalier, noe som antyder at det kan unnslippe antistoff-tilbakemeldinger.
  • Imidlertid anbefaler forskningen her og nå at T-celler fortsatt må bruke sikkerhet kontra variasjonen.

I en helt ny forskningsstudie har forskere faktisk funnet bevis på at T-celler må bruke sikkerhet versus Omicron-alternativet til SARS-CoV-2.

Forskningsstudien, som dukker opp i tidsskriftet Viruses, legger grunnlaget for oppfriskningskurs for å validere søkene etter.

T-celler

T-celler spiller en rekke oppgaver i kroppens immunsystem. Prof. Rosemary Boyton, fra Det medisinske fakultet, Institutt for infeksjonssykdommer ved Imperial College London i Storbritannia, diskuterer:

"T-celler kan spille forskjellige roller. De kan fungere som 'dreperceller', angripe celler som har blitt infisert med et virus eller en annen type patogen, eller de kan fungere som 'hjelperceller' ved å støtte B-celler til å produsere antistoffer.»

Prof Florian Kern, leder for immunologi ved Brighton samt Sussex Medical School, Storbritannia, snakket med "Detonic.shop". Han beskrev at T-celler gjør dette ved å identifisere sunne proteinbiter sammensatt av korte aminosyrekjeder, i tillegg kalt peptider. knyttet til her og nå forskningsstudien.

T-celler krever i tillegg at peptidene bindes til spesialiserte celleoverflate-friske proteiner kalt MHC-partikler.

"Hos vaksinerte individer eller de med en tidligere historie med COVID-19, vil minne T-celler reagere raskt hvis de møter de samme virale peptidene bundet til de samme MHC-molekylene igjen."

"Men hvis peptidene de opprinnelig gjenkjente ikke lenger er tilstede i viruset som følge av mutasjoner, kan disse minne-T-cellene ha mistet sin hensikt. Dette avhenger av om de muterte peptidene fortsatt kan gjenkjennes av dem," hevdet prof Kern.

Omicron-alternativet til SARS-CoV-2 har mange anomalier, som forskere tror hjelper det til å løpe vekk og reduserer effekten av antistoffer.

Men hvis Omicron ikke kan løpe vekk T-celler, kan de etter det fortsatt ha en grad av sikkerhet kontra variasjonen.

Virale stykker

For å gjenkjenne om Omicron kan løpe vekk T-celle-feedback, evaluerte forskerne 1,500 SARS-CoV-2-epitoper – en slags viral del.

"Forfatterne lastet effektivt ned en liste over anerkjente SARS-CoV-2-peptider fra et offentlig depot og justerte dem til den muterte proteinaminosyresekvensen til Omicron-varianten."

"Dette tillot dem å identifisere nøyaktig hvilke av peptidene som ble gjenkjent i tidligere virale varianter som ikke lenger eksisterte med nøyaktig samme sekvens i Omicron-varianten," hevdet prof Kern.

For å oppsummere søkene etter, hevdet prof Gary McLean, lærer i molekylær immunologi ved London Metropolitan University, Storbritannia, som ikke var assosiert med forskningsstudien, overfor MNT at et individs T-celle-resistens mot Omicron-variasjonen fortsatt må bruke en viss sikkerhet:

"Dette er en bioinformatikkbasert studie som ser på T-celleepitoper funnet i SARS-CoV-2 Omicron-varianten. Den identifiserer at det store flertallet av forutsagte Omicron spike T-celleepitoper ikke er endret i denne varianten, noe som antyder at eksisterende T-celleimmunitet mot Omicron fra vaksinasjon eller naturlig infeksjon ikke bør påvirkes så hardt."

Prof Kern var enig. "Forfatterne utsatte de relevante endrede peptidsekvensene funnet i Omicron for en rekke dataalgoritmer som er gode til å forutsi om visse peptider kan binde seg til visse MHC-molekyler. De fant at bare noen av disse peptidene sannsynligvis hadde mistet evnen til å binde seg til de samme MHC-molekylene som deres ikke-muterte forgjengere."

"Dette ga dem tillit til at det store flertallet av peptidene som er viktige for T-celleresponsen på SARS-CoV-2 ikke ble påvirket av mutasjonene funnet i Omicron og fortsatt ville binde seg til MHC-molekylene som de ikke-muterte sekvensene bundet til ."

–Prof Florian Kern

Prof. McLean husket at "[begrensningen] [av studien] er at det ikke er noen biologiske studier som støtter funnene. Av den grunn er studieresultatene noe foreløpige.»

"Samtidig er det ikke overraskende at T-celleepitoper er mindre påvirket i denne varianten. Dette fenomenet er også kjent for å forekomme med andre humane luftveisvirus, og signaliserer at T-celleimmunitet mot SARS-CoV-2, når den er etablert, potensielt er mer bredt beskyttende og [kan være viktigere] enn antistoffer."

"Selv om antistoffer er effektive til å nøytralisere SARS-CoV-2, resulterer mutasjoner i spikeproteinet i nye varianter ofte i redusert evne til de eksisterende antistoffene til å gjøre det."

"Disse dataene kan indikere at T-celleimmunitet er mer beskyttende enn antistoffer mot alvorlig sykdom forårsaket av Omicron, og støtter noen av de nylige kliniske funnene," anbefalte professor McLean.

Prof Matthew McKay, medforfatter av forskningsstudien fra University of Melbourne i Australia, uttaler: "Til tross for at det er en foreløpig studie, tror vi dette er positive nyheter."

"Selv om Omicron - eller en annen variant, for den saks skyld - potensielt kan unnslippe antistoffer, kan en robust T-cellerespons fortsatt forventes å tilby beskyttelse og bidra til å forhindre betydelig sykdom."

T-celleunndragelse

I en snakk med MNT, hevdet Dr Ahmed Abdul Quadeer, medforfatter av forskningsstudien fra Institutt for elektronisk så vel som datateknikk ved Hong Kong University of Science samt Technology, at det kanskje ikke er sannsynlig at en variasjon kan oppstår som helt sikkert ville unnslippe et individs T-celle-immune tilbakemelding.

«Å unngå T-celleresponser kan være relativt vanskelig. Dette er fordi, i motsetning til nøytraliserende antistoffer som hovedsakelig gjenkjenner pigg-(overflate)proteinet til SARS-CoV-2, gjenkjenner T-celler fragmenter fra flere proteiner av viruset."

"Derfor er T-cellene indusert av [SARS-CoV-2]-infeksjon ganske heterogene. Selv innenfor spikeproteinet, som er hovedmålantigenet til flere COVID-19-vaksiner, har studier vist at flere epitoper er målrettet i hvert individ."

"For å unngå en så bred immunrespons, ville viruset trenge å gjøre betydelig flere mutasjoner enn det vi har sett så langt, noe som kanskje ikke er levedyktig for viruset," hevdet Dr. Quadeer.

Prof McLean var enig. "Samlet sett er det mindre sannsynlig at varianter som unnslipper T-celle-immunitet vil dukke opp, da T-celleepitopene ofte er under mindre press for å endre seg, i motsetning til antistoffepitopene, som har en tendens til å klynge seg sammen i overflateområder av piggen som har en kritisk funksjon som tillater viruset går inn i cellene."

"T-celler opererer ved å oppsøke og ødelegge celler infisert med virus, rettet mot forskjellige deler av piggen sammenlignet med antistoffer, og dermed tolerere mutasjoner funnet i nye varianter."

Naturlig infeksjon eller inokulering?

Dr. Quadeer hevdet at T-celler sannsynligvis ville bruke sikkerhet enten de ble opprettet i samsvar med inokulering eller en helt naturlig infeksjon - likevel kreves det mer forskningsstudie for å validere dette.

"Både naturlig infeksjon og covid-19-vaksiner har vist seg å generere en sterk T-cellerespons. Imidlertid er det mye å forstå om de spesifikke forskjellene og likhetene mellom T-celleresponser fremkalt fra naturlig infeksjon og vaksiner. Dette studeres for tiden aktivt.»

"Det er noen åpenbare ulikheter mellom de to svarene basert på sammensetningen av COVID-19-vaksiner."

"For piggfokuserte vaksiner har T-celleresponsene vist seg å gjenkjenne flere epitoper av piggproteinet. For helvirusinaktiverte vaksiner, mens litteraturen er relativt knapp, har T-celleresponser vist seg å målrette, i tillegg til piggproteinet, andre strukturelle proteiner, som nukleokapsidet og membranproteinene.

"I tilfelle av [SARS-CoV-2]-infeksjon, har T-celler blitt funnet å målrette mot fragmenter fra flere proteiner av viruset ved en rekke eksperimentelle studier utført med blod fra individer på tvers av forskjellige geografiske regioner - for en gjennomgang, se vårt tidligere arbeid ."

"Likheter mellom T-celleresponsene fremkalt av vaksiner og naturlig infeksjon har også blitt vist av nye studier. For eksempel har noen studier rapportert at lignende fragmenter er målrettet av T-celler fremkalt av både [SARS-CoV-2]-infeksjon og vaksiner," beskrev Dr. Quadeer.