Grote genomische analyse belicht COVID-19-risicofactoren

SARS-CoV-2, COVID-19

In maart 2020 kwamen honderden onderzoekers over de hele wereld samen om te reageren op een dringend en ook ingewikkeld onderzoek: welke erfelijke factoren beïnvloeden waarom sommige COVID-19-cliënten een extreme, dodelijke aandoening creëren die een ziekenhuisopname nodig heeft, terwijl anderen wegkomen met matige tekenen en symptomen of geen enkele manier?

Een gedetailleerde samenvatting van hun zoektochten voor vandaag, uitgebracht in NATUUR, onthult 13 loci, of gebieden in het menselijk genoom, die sterk verband houden met infectie of extreem COVID-19 De wetenschappers hebben bovendien oorzakelijke factoren vastgesteld, zoals het roken van sigaretten en ook een hoge body mass index. Deze resultaten zijn afkomstig van een van de grootste genoombrede organisatieonderzoeken die ooit eerder zijn uitgevoerd, waaronder bijna 50,000 COVID-19-klanten en ook 2 miljoen schone controles.

Het zoeken naar kan helpen om doelen te stellen voor toekomstige behandelingen en ook om de kracht van erfelijke onderzoeken te benadrukken om meer te weten te komen over overdraagbare aandoeningen.

Dit wereldwijde initiatief, het COVID-19 Host Genomics Initiative genaamd, werd in maart 2020 gestart door Andrea Ganna, teamleider bij het Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), University of Helsinki en ook Mark Daly, supervisor van FIMM en ook deelnemer aan het instituut aan het Broad Institute of MIT en ook Harvard. De campagne is uitgegroeid tot een van de meest substantiële samenwerkingsverbanden in menselijke genen en bestaat momenteel ook uit meer dan 3,300 schrijvers en ook 61 onderzoekers uit 25 landen.

Ben Neale, co-directeur van het programma in medische en ook populatiegenetica bij de Broad en ook co-senior schrijver van het onderzoek, verklaarde dat hoewel vaccinaties bescherming bieden tegen infectie, er nog steeds veel ruimte is voor renovatie in de COVID-19-therapie, die kan worden vastgesteld door erfelijke analyse. Hij voegde eraan toe dat het verbeteren van therapietechnieken kan helpen de pandemie - die in een groot deel van de wereld grote sluitingen heeft geëist - te veranderen in een inheemse toestand op het eiland die veel meer lokaal is en ook voorkomt graden in de bevolking, net als de griep.

"Hoe beter we worden in het behandelen van COVID-19, hoe beter de medische gemeenschap kan zijn om de ziekte te beheersen", verklaarde hij. "Als we een mechanisme hadden om infecties te behandelen en iemand uit het ziekenhuis te krijgen, zou dat onze reactie op de volksgezondheid radicaal veranderen."

Gebruik maken van variatie

Om hun analyse te doen, heeft het consortium medische en ook erfelijke informatie samengevoegd van de bijna 50,000 klanten in hun onderzoek die gunstig waren voor de infectie, en ook 2 miljoen controles in talloze biobanken, medische onderzoeken en ook direct-to-consumer erfelijke zaken zoals als 23andMe. Vanwege de grote hoeveelheid informatie die van over de hele wereld werd verzameld, waren de onderzoekers in staat om nog sneller statistisch duurzame evaluaties te maken, en ook van een grotere verscheidenheid aan bevolkingsgroepen, dan welk team dan ook zijn eigen team kan dragen.

Van de 13 loci die tot nu toe door de groep werden bepaald, hadden er 2 grotere regelmaat bij cliënten van Oost-Aziatische of Zuid-Aziatische afkomst dan bij die van Europese afkomst, wat het belang van variëteit in erfelijke datasets benadrukt.

"We zijn veel succesvoller geweest dan eerdere pogingen om genetische diversiteit te bemonsteren, omdat we een gezamenlijke inspanning hebben geleverd om populaties over de hele wereld te bereiken," verklaarde Daly. "Ik denk dat we nog een lange weg te gaan hebben, maar we zijn heel goede vorderingen maken.”

De groep benadrukte specifiek tussen deze 2 loci, in de buurt van de FOXP4-genetica, die is verbonden met longkankercellen. De FOXP4-versie die verband houdt met extreme COVID-19 verhoogt de expressie van de genetica en adviseert dat het belemmeren van de genetica een potentiële genezingsmethode kan zijn. Andere loci die verband houden met extreme COVID-19 bestonden uit DPP9, een genetica die bovendien wordt geassocieerd met longkankercellen en ook longfibrose, en ook TYK2, dat verband houdt met een auto-immuunziekte.

Mari Niemi, daarnaast bij FIMM en ook hoofdexpert voor het onderzoek, stelt dat het consortium zich concentreerde op interactie terwijl de onderzoekers informatie beoordeelden, en onmiddellijk resultaten op hun internetsite lanceerden nadat ze daadwerkelijk op precisie waren gezocht. De groep wenst dat hun resultaten de middelen kunnen richten op nuttige doelen voor hergebruikte medicijnen.

De wetenschappers zullen zeker blijven om nog meer informatie te onderzoeken, aangezien ze te vinden zijn in en ook hun resultaten upgraden met de lay-out "Matters Arising" opNATUUR Ze zullen zeker beginnen te onderzoeken wat "long-haulers", of klanten van wie de tekenen en symptomen van COVID-19 maandenlang aanhouden, van anderen, en zullen ook toegevoegde loci blijven herkennen die verband houden met infectie en ook met extreme conditie.

"We willen het komende jaar een flink aantal zeer concrete therapeutische hypothesen verzamelen," verklaarde Daly. “Realistisch gezien zullen we COVID-19 hoogstwaarschijnlijk lange tijd als een ernstig gezondheidsprobleem beschouwen. Elke therapie die dit jaar naar voren komt, bijvoorbeeld door een bestaand medicijn te hergebruiken op basis van duidelijke genetische inzichten, zou een grote impact hebben.”

Een gloednieuw gebied voor genen

Ganna benadrukte dat de onderzoekers het vermogen hadden om duurzame erfelijke signalen te ontdekken als resultaat van hun collectieve initiatieven, een natuurlijke geest van gegevensuitwisseling en ook openheid, en ook de ernst die inhoudt dat de hele wereld precies hetzelfde risico tegenkomt dezelfde tijd. Hij vertelde dat genetici, die regelmatig met grote datasets werken, de voordelen van open samenwerking eigenlijk al heel lang inzien. "Dit illustreert alleen maar hoeveel beter de wetenschap is - hoeveel sneller het gaat en hoeveel meer we ontdekken - als we samenwerken," verklaarde Ganna.

Daly, voor zijn component, is enthousiast over hoe duidelijk en ook interpreteerbaar hun resultaten eigenlijk zijn geweest voor genetici. Hij stelt dat de inzichten van deze baan eigenlijk speciaal waren en mogelijk ook paradigmaverschuivend voor het gebied van menselijke genen, dat feitelijk is gecontroleerd door onderzoeken naar gebruikelijke aanhoudende ziekten, ongebruikelijke erfelijke ziekten en ook kankercellen.

"Deze ontdekkingen waren erg informatief en dat heeft ons doen beseffen dat er veel onbenut potentieel zit in het gebruik van genetica om therapieën voor infectieziekten te begrijpen en mogelijk te ontwikkelen," verklaarde Daly. "Ik hoop dat dit een voorbeeld is voor hoe we populatiegenetica-benaderingen kunnen brengen voor een nieuwe reeks problemen die vooral belangrijk zijn in ontwikkelingsgebieden van de wereld.".