Ontoereikende sequentiebepaling van SARS-CoV-2-variaties beperkt wereldwijde actie tegen COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

De afwezigheid van sequentiebepaling van SARS-CoV-2-variaties door de VS en ook door verschillende andere landen brengt de wereldwijde actie tegen de COVID-19-pandemie in gevaar, zegt Dana Crawford van Case Western Reserve University in een gloednieuw gezichtspunt dat op 15 juli in de logboek PLOSGenetica

Surveillance is noodzakelijk voor een effectieve en snelle actie bij ziekte-episodes, maar de beveiliging van de volksgezondheid en het welzijn heeft zich over het algemeen geconcentreerd op het bijhouden van situatienummers, ziekenhuisopnames en ook dodelijke slachtoffers. Vooruitgang in genoomsequencing stelt ons momenteel in staat om erfelijke varianten bij het ontwikkelen van infecties te volgen in ongeëvenaarde informatie. Ondanks het schema van sequencing in een aantal landen, is het bevorderen van genomica als een techniek voor het bewaken van de SARS-CoV-2-infectie, die COVID-19 veroorzaakt, eigenlijk traag, uitdagend en ook onregelmatig. Crawford vermeldt dat de VS sinds zeer begin april 2021 wereldwijd 33e zijn geplaatst in SARS-CoV-2-sequencing voor alternatieve beveiliging. Ze beweert dat de Centers for Disease Control and also Prevention (CDC) zich traditioneel niet hebben gericht op genomisch onderzoek voor volksgezondheid en welzijn, en dat deze aanleg ook daadwerkelijk een open opening heeft ontwikkeld in ons begrip van de real-time ontwikkeling van SARS-CoV-2 en ook de invloed op ziekteoverdracht en ook op ernst.

Crawford noemt ontoereikende financiering, het ontbreken van een efficiënte voorbeeldradar en ook rigoureus beleid op het gebied van bijvoorbeeld en ook informatie-uitwisseling als de redenen voor de slechte sequencing-initiatieven. Toch hebben verschillende andere landen, zoals China en ook het VK, deze moeilijkheden effectief overwonnen. De CDC heeft onlangs meer dan $ 200 miljoen besteed aan het verbeteren van de sequencing, maar Crawford vermeldt dat deze late financiële investering aangeeft dat de VS geen gearrangeerde gegevensbron met individuele details voor COVID-19-onderzoeken heeft. Ze waarschuwt dat financiële investeringen in SARS-CoV-2-genomica door moeten gaan en ook moeten worden uitgebreid, aangezien er zich waarschijnlijk gloednieuwe variaties zullen ontwikkelen als gevolg van onregelmatigheden in de inentingsprijzen en ook de naleving van COVID-19-veiligheidsmaatregelen wereldwijd.

Aangezien SARS-CoV-2 een unieke zoönotische ziekte is zonder eerdere menselijke infecties, zegt Crawford dat sequencing en ook evaluatie belangrijk zijn om zowel het traject van de uitbraak als de ontwikkeling ervan te begrijpen. Voorzieningen zijn ook hard nodig om erfelijke informatie te koppelen aan professionele en ook epidemiologische informatiebronnen voor onderzoek naar volksgezondheid en welzijn. Ten slotte concludeert ze dat continue wereldwijde sequencing-initiatieven nog steeds nodig zijn om deze zich voortdurend ontwikkelende infectie die geen wereldwijde limieten kent, te herkennen en er ook op te reageren.

"COVID-19-controle vereist bijna realtime genomische en volksgezondheidsgegevens van gastheerpathogenen om te volgen hoe SARS-CoV-2 zich heeft ontwikkeld en hoe deze evolutie de overdracht en de ernst van de ziekte beïnvloedt", voegt Crawford toe. "Amerikaanse en wereldwijde sequencing-inspanningen zijn te weinig en te onsamenhangend geweest, wat de noodzaak onderstreept om met menselijke genomica om te gaan en zijn technologieën te integreren in opkomende volksgezondheidsreacties op infectieziekten.".