Lielā genomiskā analīze izceļ COVID-19 riska faktorus

SARS-CoV-2, COVID-19

2020. gada martā simtiem pētnieku visā pasaulē pievienojās, lai atbildētu uz steidzamu un arī sarežģītu izmeklēšanu: kādi iedzimti faktori ietekmē to, kāpēc daži COVID-19 klienti rada ārkārtēju, letālu stāvokli, kurā nepieciešama uzturēšanās slimnīcā, bet citi izzūd ar mērenām pazīmēm un simptomi vai nekādi nav?

Detalizēts viņu meklējumu kopsavilkums par šo dienu, kas izlaists XNUMX daba, atklāj 13 lokusus vai apgabalus cilvēka genomā, kas ir ļoti saistīti ar infekciju vai galēju COVID-19. Zinātnieki papildus noteica cēloņsakarības faktorus, piemēram, cigarešu smēķēšanu, kā arī augstu ķermeņa masas indeksu. Šie rezultāti ir iegūti no lielākajiem genoma līmeņa organizācijas pētījumiem, kas jebkad veikti, ieskaitot gandrīz 50,000 19 COVID-2 klientus un arī XNUMX miljonus tīru kontroli.

Meklējumi var palīdzēt noteikt mērķus turpmākajām ārstēšanas metodēm, kā arī uzsvērt iedzimtu pētījumu spēku, lai uzzinātu vairāk par pārnēsājamo stāvokli.

Šo pasaules mēroga iniciatīvu, ko sauc par COVID-19 Host Genomics Initiative, 2020. gada martā uzsāka Helsinku Universitātes Somijas Molekulārās medicīnas institūta (FIMM) komandas vadītāja Andrea Ganna, kā arī FIMM vadītājs un institūta dalībnieks Marks Dalijs. MIT plašajā institūtā un arī Hārvardā. Kampaņa faktiski ir kļuvusi par vienu no būtiskākajām partnerattiecībām cilvēka gēnu jomā, un šobrīd to veido arī vairāk nekā 3,300 rakstnieki un 61 pētījums no 25 valstīm.

Bens Nīls, Medicīnas un arī iedzīvotāju ģenētikas programmas līdzdirektors un arī pētījuma vecākais autors, paziņoja, ka, lai gan vakcinācijas nodrošina aizsardzību pret infekciju, COVID-19 terapijā joprojām ir ievērojama vieta atjaunošanai, par kuru var paziņot ar iedzimtu analīzi. Viņš arī piebilda, ka terapijas metožu uzlabošana var palīdzēt izmainīt pandēmiju, kas faktiski ir pieprasījusi ievērojamu slēgšanu lielā daļā pasaules, uz vietējiem salas iedzīvotājiem, kas ir daudz lokālāki un pastāv arī ar samazinātu, taču regulāri grādi populācijā, tāpat kā gripa.

"Jo labāk mums izdosies ārstēt COVID-19, jo labāk medicīniskā sabiedrība varētu būt slimības pārvarēšanai," viņš paziņoja. "Ja mums būtu infekcijas ārstēšanas mehānisms un kāds tiktu izvests no slimnīcas, tas radikāli mainītu mūsu sabiedrības veselības reakciju."

Izmantot šķirni

Lai veiktu analīzi, konsorcijs savā pētījumā apvienoja medicīnisko un iedzimto informāciju no gandrīz 50,000 2 klientu, kuri pārbaudīja infekcijai labvēlīgo stāvokli, kā arī 23 miljonus kontroles neskaitāmās biobankās, medicīniskos pētījumos, kā arī iedzimtu uzņēmējdarbību tieši patērētājiem. kā XNUMXandMe. Sakarā ar lielo informācijas vākšanas apjomu no visas pasaules, pētniekiem bija iespēja vēl straujāk izveidot statistiski izturīgus novērtējumus un arī no labākām iedzīvotāju grupām, nekā jebkura veida komanda var pārvadāt pati.

No 13 lokusiem, kurus grupa līdz šim noteikusi, 2 no Austrumāzijas vai Dienvidāzijas izcelsmes klientiem bija vairāk likumsakarību nekā Eiropas izcelsmes klientos, uzsverot šķirnes nozīmi iedzimtajās datu kopās.

"Mēs esam bijuši daudz veiksmīgāki nekā iepriekšējie centieni paraugu ņemšanā no ģenētiskās daudzveidības, jo mēs esam kopīgi pielikuši pūles, lai sasniegtu pasaules populācijas," paziņoja Dalijs. "Es domāju, ka mums vēl ir tāls ceļš ejams, bet mēs gūstot ļoti labus panākumus. ”

Grupa īpaši uzsvēra šos 2 lokusus, netālu no FOXP4 ģenētikas, kas ir saistīta ar plaušu vēža šūnām. FOXP4 versija, kas saistīta ar galēju COVID-19, paaugstina ģenētikas izteiksmi, iesakot, ka ģenētikas kavēšana var būt perspektīva dziedināšanas metode. Citus lokusus, kas saistīti ar ekstremālu COVID-19, veidoja DPP9, ģenētika, kas papildus saistīta ar plaušu vēža šūnām un arī plaušu fibrozi, kā arī TYK2, kas saistīts ar dažām autoimūnām slimībām.

Mari Niemi, papildus FIMM, un arī pētījuma vadošā eksperte, norāda, ka konsorcijs koncentrējas uz mijiedarbību, kad pētnieki novērtēja informāciju, nekavējoties publicējot rezultātus savā tīmekļa vietnē pēc tam, kad viņiem faktiski tika meklēta precizitāte. Grupa vēlas, lai viņu rezultāti varētu mērķēt līdzekļus uz noderīgiem mērķiem atkārtoti lietojamām zālēm.

Zinātnieki noteikti turpinās izpētīt vēl vairāk informācijas, jo to var atrast un arī uzlabot savus rezultātus, izmantojot izkārtojumu “Rodas jautājumi”daba Viņi noteikti sāks pētīt, kas atšķir “tālbraucējus” vai klientus, kuru COVID-19 pazīmes un simptomi turpinās mēnešiem ilgi, un arī viņi joprojām atpazīs pievienotās lokusus, kas saistīti ar infekciju un arī ārkārtēju stāvokli.

"Mēs vēlētos, lai nākamajā gadā tiktu iegūta laba sauja ļoti konkrētu terapeitisko hipotēžu," paziņoja Deilijs. "Reāli, visticamāk, mēs ilgu laiku pievērsīsimies COVID-19 kā nopietnām veselības problēmām. Jebkurai terapijai, kas parādās šogad, piemēram, esošās zāles atkārtotai izmantošanai, pamatojoties uz skaidru ģenētisko ieskatu, būtu liela ietekme. ”

Pavisam jauna gēnu zona

Ganna uzsvēra, ka pētniekiem bija iespēja atklāt ilgtspējīgus iedzimtus signālus, pateicoties viņu kopīgajām iniciatīvām, dabiskam datu koplietošanas garam un arī atvērtībai, kā arī nopietnībai, kas ietver visa pasaules izpratni, rodas tieši tāds pats risks precīzi tajā pašā laikā. Viņš piebilda, ka ģenētiķi, kas regulāri nodarbojas ar lielām datu kopām, faktiski jau ilgu laiku ir sapratuši atvērtās sadarbības priekšrocības. "Tas tikai parāda, cik daudz zinātne ir labāka - cik daudz ātrāk tā iet un cik daudz vairāk mēs atklājam", kad mēs strādājam kopā, "paziņoja Ganna.

Deilijs par savu komponentu ir saviļņots par to, cik skaidri un interpretējami viņu rezultāti patiesībā ir bijuši ģenētiķiem. Viņš apgalvo, ka izpratne par šo darbu faktiski ir bijusi īpaša un, iespējams, paradigmas maiņa attiecībā uz cilvēka gēnu jomu, ko faktiski kontrolē parasto pastāvīgo slimību, neparasto iedzimto slimību un arī vēža šūnu pētījumi.

"Šie atklājumi ir bijuši patiešām informatīvi, un tas mums lika saprast, ka ģenētikas izmantošanā ir daudz neizmantota potenciāla, lai izprastu un potenciāli izstrādātu infekcijas slimību terapiju," paziņoja Deilijs. "Es ceru, ka tas ir piemērs tam, kā mēs varētu novest pie populācijas ģenētikas pieejas jauniem problēmu kopumiem, kas ir īpaši svarīgi pasaules jaunattīstībā."