Kā padarīt biomedicīnas pētījumu datu kopas interaktīvas

Kā padarīt biomedicīnas pētījumu datus mijiedarboties?

Savietojamības princips nosaka dažādu sistēmu spēju savienoties. Šīs ir ievērojamas grūtības biomedicīnas pētījumos, kā arī īpaši pielāgotu medikamentu jomā, kas galvenokārt balstās uz neskaitāmu datu kopu vākšanu, kā arī novērtēšanu. Apstākļos COVID-19 pandēmija faktiski ir atklājusi, ka arī tad, kad tehnoloģiskā tehnoloģija , tiek izvirzīti likumīgi, kā arī godīgi ierobežojumi, informāciju joprojām ir grūti novērtēt semantisko neskaidrību rezultātā. Šveices personalizētā veselības tīkla (SPHN) paspārnē, kā arī ciešā sadarbībā ar visu 5 Šveices mācību slimnīcu, kā arī e-veselības Suisse pārstāvjiem, Ženēvas universitātes (UNIGE), kā arī universitātes slimnīcu pētnieku grupu. Ženēvas universitāte (HUG) sadarbībā ar SIB Šveices Bioinformātikas institūtu, kā arī Lozannas Universitātes slimnīcu (CHUV) faktiski ir izveidojusi tehniku ​​valsts mēroga ietvaram, kuru aptver visas Šveices mācību slimnīcas, kā arī mācību iestādes. Ar praktisko stratēģiju šis paņēmiens ir balstīts uz parastas semantiskās struktūras attīstību, kuras mērķis nav mainīt esošās prasības, bet gan izmantot tās sadarbojošos, kā arī daudzpusīgos līdzekļos atbilstoši pētījuma vajadzībām, kā arī pavadoņiem kas saistīts. Šīs tehnikas pielietošana, kas faktiski ir sākusies, norāda uz svarīgu darbību, lai veicinātu pētījumus, kā arī patiesi pielāgotu zāļu izstrādi Šveicē

Personalizēto medikamentu pamatā ir milzīga informācijas genomiskā, epidemioloģiskā vai klīniskā attēlojuma izmantošana līdz būtības definēšanai, kā arī novērtēšana. Lai to izdarītu, savstarpēja atsauce, kā arī tikpat nepārprotamas informācijas uzkrāšana ir obligāta, arī tad, ja tās ir iegūtas no patiešām dažādiem resursiem.

Paturot to prātā, Šveices federālā valdība 2017. gadā izveidoja Šveices Medicīnisko personāla veselības tīklu (SPHN) - kampaņu, kuru vadīja Šveices Medicīnas akadēmija sadarbībā ar SIB Šveices Bioinformātikas institūtu un kura paredz reklamēt lietojumu kā kā arī informācijas apmaiņa par labsajūtu pētījumiem “Neraugoties uz lielajiem ieguldījumiem pēdējās desmitgades laikā, joprojām pastāv lielas atšķirības”, apgalvo Christian Lovis, UNIGE Medicīnas fakultātes Radioloģijas, kā arī Medicīnas informātikas katedras vadītājs, kā arī Medicīniskās informācijas zinātņu nodaļa HUG. "Tāpēc mēs vēlējāmies kopā ar saviem partneriem un SPHN ierosināt stratēģiju un kopīgus standartus, kas ir pietiekami elastīgi, lai pielāgotos visu veidu pašreizējām un nākotnes datu bāzēm."

Trīs pīlāru tehnika

Mēs saistāmies ar 3 galvenajām prasībām: definīciju, kuru mēs piedāvājam punktiem, jo ​​mums jāapmetas uz parasto pamatu, lai saprastu viens otru; tehnoloģiska prasība - troksnis, ar kuru mēs runājam; kā arī galu galā definīcijas sabiedrība, kā arī troksnis ar teikumiem, kā arī gramatika, lai mijiedarbību veidotu uztverami. "Datu ziņā tas ir tas pats, paskaidro Kristofs Gaudē-Blavinaks, pētnieks Kristiana Lovisa vadītajā komandā. Jums ir jāvienojas par semantiku, lai konceptuāli pārstāvētu to, kas jāpaziņo. Tad mums ir vajadzīga kompozīcijas valoda, lai šīs nozīmes apvienotu ar visu nepieciešamo brīvību, lai izteiktu visu, kas jāizsaka. Un visbeidzot, atkarībā no iesaistītajiem projektiem un pētnieku kopienām tas pēc nepieciešamības tiks “tulkots” datu modeļos, kuru ir tikpat daudz kā pasaulē runāto valodu. ”

"Tāpēc mūsu mērķis ir bijis apvienot vārdu krājumus tā, lai tos varētu sazināties jebkurā gramatikā, nevis izveidot jaunu vārdu krājumu no nulles, kas visiem būtu jāmācās no jauna," apgalvo Christian Lovis "Šajā ziņā Šveices federālisms ir milzīga priekšrocība : tas mums ir licis iedomāties decentralizētu stratēģiju, kuru var piemērot visur. Tāpēc ierobežojums ir radījis iespēju izstrādāt sistēmu, kas darbojas, neskatoties uz vietējām valodām, kultūru un noteikumiem. ” Tas padara iespējamu izmantot īpašas informācijas versijas tikai pēdējai darbībai, kas jāpielāgo stiliem, kurus pieprasa noteikts darbs - Pārtikas, kā arī Narkotiku administrācijas (FDA) izkārtojums, kad runa ir par sadarbību ar amerikāņu grupu, kā piemērs, vai jebkura cita veida īpašs izkārtojums, ko izmanto noteikta tauta vai pētniecības kampaņa. Tas ietver garantiju par labu izpratni, kā arī par masveida laika taupīšanu.

Neietekmē informācijas aizsardzību

Tomēr informācijas sadarbspēja nenozīmē metodisku informācijas koplietošanu. “Piemēram, banku pasaule jau sen ir pieņēmusi globālos savietojamības standartus, uzsver Kristofs Gaudē-Blavignaks. Vienkāršu IBAN var izmantot, lai pārskaitītu naudu no jebkura konta uz jebkuru citu. Tomēr tas nenozīmē, ka kāds, neatkarīgi no tā, vai tas ir privātpersonas, privātas organizācijas vai valdības, var zināt, kas ir šajos kontos bez stingra tiesiskā regulējuma. ” Patiešām, būtu jāšķiras starp rīkiem, kas nodrošina savstarpēju izmantojamību, kā arī no to izmantošanas, no vienas puses, kā arī no regulatīvās struktūras, kas regulē to pieejamību, no otras puses.

Stratēģijas pielietošana

Šis paņēmiens Šveicē faktiski tiek izmantots pakāpeniski, ņemot vērā, ka 2019. gada centrs Šveices personalizētā veselības tīkla struktūrā “Šveices universitātes slimnīcas jau seko ierosinātajai stratēģijai, lai koplietotu sadarbspējīgus datus par visiem daudzcentru pētniecības projektiem, ko finansē SPHN iniciatīva ”, reģistrē Katrin Crameri, SIB personalizētās veselības informātikas grupas pārzinis, kurš ir atbildīgs SPHNData koordinācijas centrā. Turklāt dažas medicīnas iestādes sāk izmantot šo tehniku ​​jau pirms SPHN kampaņas.