Didelė genominė analizė išryškina COVID-19 rizikos veiksnius

SARS-CoV-2, COVID-19

2020 m. Kovo mėn. Šimtai tyrinėtojų visame pasaulyje prisijungė, norėdami atsakyti į skubų ir sudėtingą tyrimą: kokie paveldimi veiksniai daro įtaką tam, kad kai kurie COVID-19 klientai sukuria ekstremalią, mirtiną būklę, dėl kurios reikia gulėti ligoninėje, o kiti išsiskiria su vidutinio sunkumo požymiais ar simptomai, ar niekaip?

Išsamus šių dienų paieškų apibendrinimas, išleistas XNUMX m Pobūdis, atskleidžia 13 lokusų ar sričių žmogaus genome, kurios yra labai susijusios su infekcija ar ekstremaliais COVID-19. Mokslininkai papildomai nustatė tokius priežastinius veiksnius kaip cigarečių rūkymas ir aukštą kūno masės indeksą. Šie rezultatai kilo iš didžiausių kada nors atliktų visos genomo organizacijos tyrimų, apimančių beveik 50,000 19 „COVID-2“ klientų ir XNUMX milijonus švarių kontrolių.

Paieškos gali padėti nustatyti tikslus būsimam gydymui ir pabrėžti paveldimų tyrimų galią sužinoti daugiau apie perduodamą būklę.

Šią pasaulinę iniciatyvą, vadinamą COVID-19 priimančiosios genomikos iniciatyva, 2020 m. Kovo mėn. Pradėjo Andrea Ganna, Suomijos molekulinės medicinos instituto (FIMM), Helsinkio universiteto, komandos vadovas ir Markas Daly, FIMM vadovas ir instituto dalyvis. plačiajame MIT ir Harvardo institute. Kampanija iš tikrųjų išsiplėtė ir buvo viena iš reikšmingiausių žmonių genų partnerystės. Šiuo metu ją sudaro daugiau nei 3,300 rašytojų ir 61 tyrimas iš 25 tautų.

Bendrasis Medicinos ir gyventojų genetikos programos direktorius Benas Neale'as ir vyresnysis tyrimo rašytojas teigė, kad nors skiepai suteikia gynybą, palyginti su infekcija, COVID-19 terapijoje vis dar yra daug vietos atnaujinti, apie kurį galima pranešti paveldimos analizės būdu. Jis taip pat nurodė, kad patobulinti terapijos metodai gali padėti pakeisti pandemiją, kuri iš tikrųjų pareikalavo didelių uždarymų didžiojoje pasaulio dalyje, vietinei salos vietovei, kuri yra daug vietinė, taip pat egzistuoja mažesniu, tačiau reguliariai. laipsnių populiacijoje, kaip ir gripas.

"Kuo geriau mes gydysime COVID-19, tuo geriau medicinos bendruomenė galės valdyti ligą", - teigė jis. "Jei mes turėtume infekcijos gydymo ir žmogaus išvedimo iš ligoninės mechanizmą, tai radikaliai pakeistų mūsų visuomenės sveikatos reakciją".

Pasitelkiama įvairovė

Norėdami atlikti savo analizę, konsorciumas sujungė medicininę ir paveldimą informaciją iš beveik 50,000 2 klientų, atlikusių tyrimus, kurie patvirtino, kad infekcija yra palanki, taip pat 23 milijonus kontrolių daugybėje biobankų, medicininių tyrimų, taip pat tiesiogiai vartotojui paveldimą verslą, pvz., kaip XNUMXandMe. Dėl didelio informacijos, renkamos iš viso pasaulio, kiekio, tyrėjai sugebėjo dar greičiau ir statistiškai patvaresnius vertinimus kurti iš geresnės populiacijos įvairovės, nei bet kuri viena komanda gali turėti savo.

Iš 13 lokusų, kuriuos iki šiol nustatė grupė, 2 turėjo daugiau dėsningumų tarp Rytų Azijos ar Pietų Azijos kilmės klientų nei europietiškos kilmės, pabrėždami įvairovės reikšmę paveldimuose duomenų rinkiniuose.

„Mums buvo daug sėkmingiau nei ankstesnėms pastangoms atrinkti genetinę įvairovę, nes bendromis pastangomis siekėme susisiekti su viso pasaulio gyventojais“, - teigė Daly. „Manau, kad mums dar reikia daug nuveikti, bet mes labai gera pažanga “.

Grupė tarp šių 2 lokusų išskyrė šalia FOXP4 genetikos, kuri yra susijusi su plaučių vėžio ląstelėmis. FOXP4 versija, susijusi su ekstremaliu COVID-19, kelia genetikos išraišką, rekomenduodama, kad genetikos trukdymas gali būti perspektyvus gydymo metodas. Kitus lokusus, susijusius su ekstremaliu COVID-19, sudarė DPP9, genetika, papildomai susijusi su plaučių vėžio ląstelėmis ir plaučių fibroze, taip pat TYK2, kuris susijęs su kai kuriomis autoimuninėmis ligomis.

Be to, FIMM ir pagrindinis tyrimo ekspertas Mari Niemi teigia, kad konsorciumas sutelkė dėmesį į sąveiką, kai mokslininkai įvertino informaciją ir iškart paskelbė rezultatus savo interneto svetainėje, kai jie iš tikrųjų buvo tikslūs. Grupė nori, kad jų rezultatai galėtų būti nukreipti į naudingus tikslus pakartotinai vartojamiems vaistams.

Mokslininkai, be abejo, liks tyrinėti dar daugiau informacijos, nes ją galima rasti ir patobulinti savo rezultatus išdėstant „Klausimai kyla“ adresuPobūdis Jie tikrai pradės tirti, kuo „tolimieji vežėjai“ ar klientai, kurių COVID-19 požymiai ir simptomai tęsiasi mėnesius, skiriasi nuo kitų, taip pat liks atpažinti pridėtus lokusus, susijusius su infekcija ir ekstremalia būkle.

"Mes norėtume siekti, kad kitais metais gautume gerą saują labai konkrečių terapinių hipotezių", - pareiškė Daly. „Realiai, mes greičiausiai ilgą laiką spręsime COVID-19 kaip rimtą sveikatos problemą. Bet koks šiais metais atsirandantis gydymas, pavyzdžiui, pakeičiant esamą vaistą remiantis aiškia genetine įžvalga, turėtų didelę įtaką “.

Visiškai nauja genų sritis

Ganna pabrėžė, kad tyrėjai turėjo galimybę atrasti ilgalaikius paveldimus signalus dėl savo kolektyvinių iniciatyvų, natūralios dalijimosi duomenimis dvasios ir atvirumo, o taip pat rimtumas, apimantis viso pasaulio supratimą, susiduria su ta pačia rizika tiksliai Tuo pačiu metu. Jis įtraukė, kad genetikai, reguliariai dirbantys su dideliais duomenų rinkiniais, iš tikrųjų labai ilgai suprato atviro bendradarbiavimo pranašumus. "Tai tik parodo, kiek geriau mokslas yra - kiek greičiau jis vyksta ir kiek daugiau mes atrandame", kai dirbame kartu ", - teigė Ganna.

Dalį, jo komponentą, jaudina tai, kiek aiškūs ir interpretuojami jų rezultatai iš tikrųjų buvo genetikams. Jis teigia, kad supratimas iš šio darbo iš tikrųjų buvo ypatingas ir galbūt pakeitė paradigmą žmogaus genų srityje, kurią iš tikrųjų kontroliavo įprastų nuolatinių ligų, neįprastų paveldimų ligų ir vėžinių ląstelių tyrimai.

"Šie atradimai buvo tikrai informatyvūs ir tai leido mums suprasti, kad naudojant genetiką yra daug neišnaudotų galimybių suprasti ir potencialiai sukurti infekcinių ligų terapiją", - teigė Daly. "Tikiuosi, kad tai bus pavyzdys, kaip mes galime pritaikyti gyventojų genetikos metodus naujam problemų rinkiniui, kuris yra ypač svarbus besivystančiose pasaulio dalyse."