Nepakankamas SARS-CoV-2 variantų sekos nustatymas apriboja COVID-19 veikimą visame pasaulyje

SARS-CoV-2, COVID-19

JAV ir įvairių kitų šalių nesuderinus SARS-CoV-2 variantų, kyla pavojus pasauliniam veiksmui kovoti su COVID-19 pandemija, sako Dana Crawford iš Case Western Reserve universiteto visiškai naujame „Viewpoint“, išleistame liepos 15 d. žurnalas PLOSGenetika

Stebėjimas yra būtinas norint veiksmingai ir greitai reaguoti į ligos epizodus, tačiau visuomenės sveikatos ir sveikatingumo saugumas iš esmės sutelktas į situacijų skaičiaus, buvimo ligoninėje ir žuvusiųjų stebėjimą. Genomo sekvenavimo pažanga šiuo metu leidžia mums stebėti paveldimą variantą besivystančiose infekcijose pagal neprilygstamą informaciją. Nepaisant sekos nustatymo tvarkaraščio daugelyje šalių, genomikos, kaip SARS-CoV-2 infekcijos, kuria sukuriama COVID-19, tyrimo technika, skatinimas buvo lėtas, sudėtingas ir nereguliarus. Crawfordas mini, kad nuo labai 2021 m. Balandžio pradžios JAV užėmė 33 vietą SARS-CoV-2 sekose, kad būtų užtikrintas alternatyvus saugumas. Ji teigia, kad tradiciškai Ligų kontrolės ir prevencijos centrai (CDC) iš tikrųjų nesiorientavo į visuomenės sveikatos ir sveikatingumo genominius tyrimus, be to, ši polinkis iš tikrųjų atvėrė mūsų supratimą apie realaus laiko raidos plėtrą. SARS-CoV-2, taip pat įtaka ligos perdavimui ir sunkumui.

Crawfordas prastų sekų iniciatyvų priežastis nurodo nepakankamą finansavimą, efektyvaus radaro pavyzdžio nebuvimą, taip pat griežtą pavyzdžio politiką ir keitimąsi informacija. Vis dėlto įvairios kitos tautos, tokios kaip Kinija ir JK, iš tikrųjų veiksmingai įveikė šiuos sunkumus. CDC neseniai paskyrė daugiau nei 200 milijonų dolerių sekos tobulinimui, tačiau Crawfordas mini, kad ši vėluojanti finansinė investicija rodo, kad JAV neturi sutvarkyto duomenų šaltinio, kuriame būtų pateikiama individuali COVID-19 tyrimų informacija. Ji perspėja, kad reikia tęsti finansines investicijas į SARS-CoV-2 genomiką ir taip pat išplėsti, nes greičiausiai atsiras visiškai naujų variantų dėl inokuliacijos kainų netaisyklingumo ir dėl to, kad visame pasaulyje bus laikomasi COVID-19 saugumo priemonių.

Atsižvelgiant į tai, kad SARS-CoV-2 yra unikali zoonozinė liga be ankstesnių žmonių infekcijų, Crawfordas sako, kad sekos nustatymas ir įvertinimas yra svarbūs norint suprasti tiek išsiveržimo trajektoriją, tiek jos raidą. Taip pat labai reikalingos nuostatos, kad paveldima informacija būtų susieta su profesionaliais ir epidemiologiniais informacijos šaltiniais visuomenės sveikatos ir sveikatingumo tyrimams atlikti. Galiausiai ji apibendrina, kad vis dar reikalingos nuolatinės pasaulinės sekos nustatymo iniciatyvos, kad būtų galima atpažinti ir nuolat reaguoti į infekciją, kuri nesupranta pasaulinių ribų.

„COVID-19 kontrolei reikalingi beveik realaus laiko šeimininko-patogeno genominiai ir visuomenės sveikatos duomenys, kad būtų galima stebėti, kaip vystėsi SARS-CoV-2 ir kaip ši evoliucija veikia perdavimą ir ligos sunkumą“, - priduria Crawfordas. "JAV ir pasaulinės pastangų sekos nustatymas buvo per mažas ir per daug atskirtas, pabrėžiant poreikį užsiimti žmogaus genomika ir integruoti jos technologijas į kylančias visuomenės infekcinių ligų reakcijas".