Kaip padaryti biomedicininių tyrimų duomenų rinkinius interaktyvius

Kaip padaryti, kad biomedicininių tyrimų duomenys galėtų sąveikauti?

Sąveikos principas apibrėžia įvairių sistemų galimybes prisijungti. Tai yra didelis sunkumas atliekant biomedicinos tyrimus, taip pat specialiai pritaikytų vaistų srityje, kuris daugiausia grindžiamas nesuskaičiuojamų duomenų rinkinių rinkimu ir vertinimu. Esant tam tikroms aplinkybėms, COVID-19 pandemija iš tikrųjų parodė, , keliami teisėti ir sąžiningi suvaržymai, informaciją ir toliau sunku įvertinti dėl semantinių neaiškumų. Globojama Šveicarijos personalizuoto sveikatos tinklo (SPHN), taip pat glaudžiai bendradarbiaujant su visų 5 Šveicarijos mokymo ligoninių atstovais, taip pat su „eHealth Suisse“, tyrėjų grupe iš Ženevos universiteto (UNIGE) ir universitetinių ligoninių. Ženevos (HUG), bendradarbiaudamas su ŠIB Šveicarijos Bioinformatikos institutu ir Lozanos universitetine ligonine (CHUV), iš tikrųjų sukūrė visos Šveicarijos mokymo ligoninės, taip pat ir mokslo įstaigų, apimtį visoje šalyje. Taikant praktinę strategiją, ši technika remiasi įprastos semantinės struktūros pažanga, kurios tikslas nėra pakeisti esamus reikalavimus, tačiau jas panaudoti bendradarbiaujančiose ir įvairiapusiškose priemonėse, atsižvelgiant į tyrimo poreikius, taip pat į kompanionus sukėlė. Taikant šią iš tikrųjų pradėtą ​​techniką pažymima svarbus veiksmas, skatinantis mokslinius tyrimus ir tikrai pritaikytų vaistų plėtrą Šveicarijoje.

Individualizuoti vaistai yra pagrįsti milžiniškos informacijos, tiek genominės, epidemiologinės, tiek klinikinės vizualinės informacijos, panaudojimu ir vertinimu iki esmės apibrėžimo. Norint tai padaryti, būtina pateikti kryžmines nuorodas ir kaupti vienodai neabejotiną informaciją, taip pat tada, kai jos gaunamos iš tikrai įvairių išteklių.

Atsižvelgdama į tai, Šveicarijos federalinė vyriausybė 2017 m. Sukūrė Šveicarijos personalizuoto sveikatos tinklą (SPHN) - kampaniją, kurią vadovavo Šveicarijos medicinos mokslų akademija, bendradarbiaudama su SIB Šveicarijos bioinformatikos institutu, ketindama reklamuoti naudojimą kaip taip pat keitimasis sveikatingumo informacijos tyrimais „Nepaisant didelių investicijų per pastarąjį dešimtmetį, vis dar yra didelių skirtumų“, - teigia Christianas Lovis, UNIGE Medicinos fakulteto Radiologijos ir medicinos informatikos katedros vadovas, taip pat Medicinos informacijos mokslų skyrius HUG. „Štai kodėl mes norėjome kartu su savo partneriais ir SPHN pasiūlyti strategiją ir bendrus standartus, kurie būtų pakankamai lankstūs, kad tilptų įvairiausios esamos ir būsimos duomenų bazės.“

Trijų ramsčių technika

Mes siejame su 3 pagrindiniais reikalavimais: apibrėžimu, kurį siūlome taškais, nes mes turime atsiskaityti įprastu pagrindu, kad suprastume vienas kitą; technologinis reikalavimas - triukšmas, su kuriuo kalbamės; taip pat galiausiai apibrėžimo, taip pat triukšmo su sakiniais ir gramatikos draugija, kad sąveika būtų suprantama. „Kalbant apie duomenis, tai tas pats, - paaiškina Christiano Loviso vadovaujamos komandos tyrėjas Christophe'as Gaudet-Blavignacas. Turite susitarti dėl semantikos, kad konceptualiai reprezentuotumėte tai, apie ką reikia pranešti. Tada mums reikia kompozicinės kalbos, kad šios reikšmės būtų sujungtos su visa laisve, reikalinga viskam, ką reikia išreikšti, išreikšti. Galiausiai, priklausomai nuo dalyvaujančių projektų ir mokslininkų bendruomenių, tai bus „išversta“ prireikus į duomenų modelius, kurių yra tiek pat, kiek pasaulyje kalbama “.

„Todėl mūsų tikslas buvo suvienodinti žodynus, kad juos būtų galima perteikti bet kokiomis gramatikomis, o ne sukurti naują žodyną nuo nulio, kurio visiems tektų išmokti iš naujo“, - teigia Christianas Lovis. „Šia prasme Šveicarijos federalizmas yra didžiulis privalumas. : tai privertė mus įsivaizduoti decentralizuotą strategiją, kurią galima taikyti visur. Todėl suvaržymas sukūrė galimybę sukurti sistemą, kuri veiktų nepaisant vietinių kalbų, kultūros ir taisyklių “. Tai leidžia naudoti tam tikras informacines versijas, kad tik paskutinis veiksmas būtų pritaikytas prie tam tikro darbo reikalaujamų stilių - maisto ir vaistų administracijos (FDA) maketo, kai kalbama apie bendradarbiavimą su amerikiečių grupe. pavyzdys, ar bet koks kitas konkretus maketas, kurį naudoja tam tikra tauta ar tyrimų kampanija. Tai apima gero supratimo garantiją ir didžiulį laiko taupymą.

Jokios įtakos informacijos gynybai

Tačiau informacijos sąveika nereiškia metodinio keitimosi informacija. „Pavyzdžiui, bankų pasaulis jau seniai priėmė pasaulinius sąveikumo standartus, pabrėžia Christophe Gaudet-Blavignac. Paprastas IBAN gali būti naudojamas pervedant pinigus iš bet kurios sąskaitos į bet kurią kitą. Tačiau tai nereiškia, kad bet kas, tiek fiziniai asmenys, tiek privačios organizacijos, tiek vyriausybės, gali žinoti, kas yra šiose sąskaitose, be griežtos teisinės bazės “. Iš tiesų, reikėtų atskirti priemones, užtikrinančias sąveikumą, ir jų taikymą, taip pat reguliavimo struktūrą, kuri reguliuoja jų prieinamumą, kita vertus.

Strategijos taikymas

Ši metodika Šveicarijoje buvo taikoma laipsniškai, atsižvelgiant į tai, kad 2019 m. Centras Šveicarijos personalizuoto sveikatos tinklo struktūroje „Šveicarijos universitetinės ligoninės jau vykdo siūlomą strategiją dalytis sąveikiais duomenimis apie visus daugiacentrius tyrimų projektus, finansuojamus SPHN iniciatyva “, - įrašo Katrin Crameri, SIB asmeninės sveikatos informatikos grupės vadovas, atsakingas už SPHNData koordinavimo centrą. Be to, kai kurios medicinos įstaigos pradeda taikyti šią techniką praėjus SPHN kampanijai.