Kaip mokslininkai gali pasakyti, ar naktiniame klube kažkas pagavo koronavirusą

Kaip mokslininkai gali padėti pasakyti, ar naktiniame klube kažkas pagavo koronavirusą

Gegužės pradžioje vykusiuose dviejuose bandomuosiuose renginiuose Liverpulyje, naktiniame klube „Circus“ ir muzikos festivalyje „Sefton Park Pilot“, iš viso per 13,000 XNUMX žmonių buvo pakili nuotaika. Tai buvo JK įvykių tyrimų programos dalis, leidžianti žiūrovams paragauti senosios normos - susirinkimas be socialinio atsiribojimo ar veido uždengimo - siekiant sužinoti, kokį poveikį masiniai įvykiai gali turėti koronaviruso plitimui.

Dalyviams turėjo būti atliktas neseniai atliktas neigiamas greito šoninio srauto testas, parodantis, kad mažai tikėtina, kad jie turės COVID-19. Bet nė vienas testas nėra tobulas - visi COVID-19 testai, įskaitant šoninio srauto testus, praleis kai kuriuos atvejus. Todėl buvo įmanoma, kad kai kurie dalyviai buvo užkrėsti ir galėjo užkrėsti kitus. Jei panašūs įvykiai netrukus bus atnaujinti, svarbu žinoti, kokia didelė ši rizika.

Testai ir statistika padėjo mums tai sužinoti. Kiekvienas dalyvis atliko šoninio srauto testą per 36 valandas iki renginio. Tada jų buvo paprašyta atlikti kitokio tipo tyrimą (PGR testą, naudojant namuose esantį rinkinį, kuris siunčiamas analizuoti į laboratoriją) tiek įvykio dieną, tiek po penkių dienų.

Šoninio srauto bandymai yra paprasti. Jie greitai atsako „taip“ ar „ne“, ar kas nors turi COVID-19, veikdamas šiek tiek kaip nėštumo testas.

Naudoti PGR tyrimai buvo šiek tiek sudėtingesni. Jie parodė ne tik tai, ar žmonės buvo teigiami, bet ir pateikė skaičių, vadinamą „ciklo slenksčiu“ (Ct), kuris atspindi koronaviruso kiekį ant žmogaus tampono. Kuo mažesnis Ct skaičius, tuo didesnis viruso kiekis organizme yra, ir tuo labiau jie yra infekciniai. (Neigiami PGR rezultatai yra tie, kur Ct yra didesnis nei tam tikras lygis.)

Infekcijos laiko nustatymas

Norint įvertinti, ar įvykis yra saugus, reikia naudoti šiuos testus, kad išsiaiškintumėte, kiek žmonių įvykyje ar aplink jį pagavo virusą. Norėdami tai padaryti, pirmiausia naudokitės tolesniais bandymais, kad išsiaiškintumėte, kas greitai perneša infekciją. Tada jūs apskaičiuojate, kada virusas užkrėtė testą turinčius asmenis: prieš įvykį, jo metu ar po jo.

Norėdami išsiaiškinti, kada virusas buvo paimtas, turite suprasti COVID-19 infekcijos dinamiką. Tai yra gana paprasta. Kūno viduje COVID-19 turi dvi skirtingas fazes: eksponentiškai padidėja užfiksuoto viruso kiekis (kai Ct todėl mažėja), ir eksponentiškai sumažėja, kai asmuo išmeta virusą (padidėjus Ct).

Naudodami esamus duomenis ir daugelio ankstesnių infekcijų analizę galime pateikti vidutinę COVID-19 infekcijos trajektoriją. Grafike pavaizduotas viruso kiekis organizme vidutinio žmogaus infekcijoje, matuojamas pagal Ct skaičių, atrodo kaip raudona linija žemiau.

Jei kas nors po įvykio grąžina teigiamą PGR testą, jų tyrimo Ct skaičius gali atspindėti vieną iš dviejų infekcijos taškų - vieną, kai infekcija auga, o kitą, kai mažėja.

Pvz., Aukščiau pateiktame grafike, jei asmens Ct skaičius yra C0, tada jo testas buvo atliktas arba taške A laike (X ašyje), arba taške B. Kaip žinome, kiek laiko praėjo tarp jų dalyvaudami renginyje ir atlikę jų PGR testą (grafike pavaizduoti Δ), galime žiūrėti atgal, kad dalyvaudami renginyje galėtume pateikti du jų Ct lygio įvertinimus: CA ir CB. Tai taip pat pateikia du įvertinimus, kiek jie yra užkrėtę, taigi ir du įvertinimus, kada jie užsikrėtė.

Bet kas yra teisinga? Na, mes žinome, kad asmuo turėjo atlikti neigiamą testą likus 36 valandoms iki renginio, kad galėtų dalyvauti. Šoninio srauto testai gali būti klaidingai neigiami, kai žmonių organizme yra nedidelis viruso kiekis, tačiau daug mažesnė tikimybė, kad jie duos klaidingą neigiamą rezultatą, kai kam nors yra didelė virusinė apkrova.

Taigi, jei vienas iš dviejų įvykio metu galimų infekcijos lygių - CA ir CB - rodo didelę viruso apkrovą, bet kitas ne, didelės virusinės apkrovos atvejį greičiausiai galima atmesti. Iš tiesų, mes galime naudoti istorinius duomenis apie šoninių srautų testų tikslumą, kad nustatytume tikimybę, jog bandymas pateiks neigiamą rezultatą, kai Ct skaičius buvo kiekvienas iš CA ir CB, ir tai naudosime norėdami pasakyti, kuris iš dviejų įvertinimų kada jie labiau užsikrėtė.

Tai reiškia, kad kiekvienam asmeniui, kurio PCR testas po įvykio yra teigiamas, turime geriausią numatomą laiką, kai jis užklupo COVID-19. Tiems, kurių numatomas užsikrėtimo laikas yra prieš įvykį, mes manome, kad jie virusą pasiėmė kitur netrukus ir kad jų šoninio srauto testu nepavyko nustatyti jų infekcijos - galbūt dėl ​​to, kad jie buvo anksti užsikrėtę ir todėl vis dar turėjo mažai jų organizme yra viruso kiekis. Mes taip pat galime įvertinti, kada jų virusų krūvis pasiekė aukščiausią tašką ir tuo būdu jie buvo infekciniai įvykyje.

Tiems, kurių užsikrėtimo laikas yra įvykio metu arba labai netrukus po jo, galime manyti, kad jie buvo užkrėsti dalyvaudami. Tada galime palyginti šias dvi grupes - infekcines ir užkrėstąsias -, kad sužinotume, kiek įvyko perdavimo ir koks rizikingas įvykis.

Malonu, kad naudodamiesi šiais metodais mes nustatėme, kad Liverpulio įvykiai neturėjo jokios įtakos COVID-19 plitimui Liverpulio srityje. Bet norėdami sužinoti, ar šie įvykiai yra saugūs, mes tik informavome politikos formuotojus. Jie turėjo nepavydėtiną užduotį įvertinti, ar nustatyta rizika yra pakankamai maža, kad sugrąžintume mus į gyvenimą, kaip kadaise tai žinojome.