Žarnyno mikrobiomos pokyčiai atliekant išilginius kūdikių tyrimus vyksta prieš celiakiją

žarnyno mikrobiomas

Įgyvendindama ilgalaikį, perspektyvų požiūrį į celiakijos vystymąsi, bendradarbiaujanti tyrėjų grupė nustatė esminius mikrobinius pakitimus rizikos grupės kūdikių žarnose prieš prasidedant ligai. Taikydami pažangias genomo sekos nustatymo technologijas, MassGeneral vaikų ligoninės (MGHfC) tyrėjai kartu su kolegomis iš įstaigų Italijoje ir Merilendo universitete, Koledžo parke, atskleidė ryškius ikiklinikinius pokyčius keliuose rūšių, kelių ir metabolitų vaikuose, kuriems išsivystė celiakija, palyginti su rizikos grupės vaikai, kuriems nesirgo celiakija.

Vykdydami MGHfC celiakijos ligos, genomikos, mikrobiomos ir metabolizmo (CDGEMM) tyrimą, mokslininkai nustatė kūdikių žarnyno mikrobiomų (mikroorganizmų kolekcija) ir metabolomų (ląstelių ir audinių molekuliniai komponentai) pokyčius, įvykusius kelis mėnesius prieš celiakijos atsiradimą. Pokyčiai apima „padidėjusį uždegimą skatinančių rūšių skaičių ir sumažėjusį apsauginių ir priešuždegiminių rūšių kiekį įvairiais laiko momentais iki ligos pradžios“, sakoma grupės straipsnyje, paskelbtame Bylos Nacionalinės mokslų akademijos.

„Šiame koncepcijos įrodymo tyrime mes palyginome 10 kūdikių, kuriems išsivystė celiakija, žarnyno mikrobiomą su 10 kūdikių, kuriems nebuvo autoimuninės būklės, žarnyno mikrobiomą“, - sako MD Maureen Leonard, pagrindinis autorius ir MGHfC Celiakijos tyrimų ir gydymo centro klinikinis direktorius. „Mes nustatėme reikšmingus žarnyno mikrobų, kelių ir metabolitų pokyčius jau 18 mėnesių iki ligos pradžios. Tai buvo daug anksčiau, nei tikėjomės “, - priduria Leonardas.

CDGEMM tyrėjai Italijos, Ispanijos ir JAV tyrinėdami 500 genetiškai pavojingų kūdikių nuo gimimo iki dešimties metų leidžia jiems sekti žarnyno mikrobiotos pokyčius, kol dar neatsiranda celiakija. CDGEMM tyrėjai nuo 2014 m. Renka didelius kraujo ir išmatų mėginius bei didelius kiekvieno dalyvio aplinkos duomenis. Šiame tyrime mokslininkai naudojo metagenominę analizę, kuri leido susieti mikrobų sudėtį su funkcija, pabrėžiant pokyčius keliuose, susijusiuose arba su padidėjusiais uždegiminiais procesais, arba su sumažėjusiu sumažėjimu. uždegimas. "Šis tyrimas parodo naujos kartos sekos nustatymo galią kartu su bioinformatika aptikti šiuos svarbius pokyčius", - sako bendraautorė Rita Colwell, daktarė, iš Merilendo universiteto Pažangių kompiuterinių studijų instituto, Koledžo parko.

„Mums reikėjo atlikti išilginį šių rizikos kūdikių gimimo ir kohortos tyrimą, kad mikrobiomų tyrimai būtų perkelti nuo asociatyvių stebėjimų prie labiau priežastinių tyrimų“, - sako vyresnysis autorius Alessio Fasano, MD, MGHfC Celiakijos tyrimų ir gydymo centro direktorius. „Šis požiūris padės mums sukurti naujas įvairių sąlygų, kurioms esant mikrobiomas galėtų atlikti patogeninį vaidmenį, diagnozavimo ir gydymo strategijas“, - priduria Fasano.

Jis siūlo, kad šios išvados, jei jas patvirtins didesni duomenų rinkiniai, gali būti konkretūs terapiniai tikslai ligos perėmimui ir galimai celiakijos atsiradimo prevencijai atliekant manipuliacijas mikrobiomomis ikiklinikinės fazės metu. "Remdamiesi šiomis išvadomis, mes tikimės, kad galėsime atskirti, kas išliks sveikas, o kam išsivystys celiakija kelis mėnesius iki ligos pradžios", - priduria Fasano.