Analisis genomik besar menyoroti faktor risiko COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

Pada bulan Maret 2020, ratusan peneliti di seluruh dunia bergabung untuk menanggapi pertanyaan yang mendesak dan juga rumit: faktor keturunan apa yang memengaruhi mengapa beberapa klien COVID-19 membuat kondisi ekstrem dan mematikan yang memerlukan rawat inap di rumah sakit, sementara yang lain lolos dengan gejala sedang dan gejala atau tidak sama sekali?

Rekap terperinci dari pencarian mereka untuk hari ini, dirilis di Alam, mengungkapkan 13 lokus, atau area dalam genom manusia, yang sangat terkait dengan infeksi atau COVID-19 ekstrem. Para ilmuwan juga menentukan faktor penyebab seperti merokok dan indeks massa tubuh yang tinggi. Hasil ini berasal dari salah satu penelitian organisasi genom terbesar yang pernah dilakukan, yang mencakup hampir 50,000 klien COVID-19 dan juga 2 juta kontrol bersih.

Pencarian dapat membantu memberikan target untuk perawatan masa depan dan juga menyoroti kekuatan penelitian turun-temurun dalam mencari tahu lebih lanjut tentang kondisi menular.

Inisiatif di seluruh dunia, yang disebut Inisiatif Genomik Host COVID-19, dimulai pada Maret 2020 oleh Andrea Ganna, ketua tim di Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), University of Helsinki dan juga Mark Daly, supervisor FIMM dan juga peserta institut. di Broad Institute of MIT dan juga Harvard Kampanye ini telah berkembang menjadi salah satu kemitraan terbesar dalam gen manusia dan saat ini terdiri dari lebih dari 3,300 penulis dan 61 peneliti dari 25 negara.

Ben Neale, co-director Program in Medical and Population Genetics at the Broad dan juga penulis senior penelitian, menyatakan bahwa meskipun vaksinasi memberikan pertahanan versus infeksi, masih ada banyak ruang untuk renovasi dalam terapi COVID-19, yang dapat diinformasikan melalui analisis turun-temurun Dia menambahkan bahwa teknik terapi tambahan dapat membantu mengubah pandemi– yang telah menuntut penutupan besar-besaran di sebagian besar dunia– ke kondisi asli pulau yang lebih lokal dan juga ada dengan harga yang lebih rendah namun teratur. derajat dalam populasi, seperti influenza.

“Semakin baik kita dalam mengobati COVID-19, semakin baik kemampuan komunitas medis untuk mengelola penyakit ini,” katanya. “Jika kita memiliki mekanisme untuk mengobati infeksi dan mengeluarkan seseorang dari rumah sakit, itu akan secara radikal mengubah respons kesehatan masyarakat kita.”

Memanfaatkan variasi

Untuk melakukan analisis mereka, konsorsium menggabungkan informasi medis dan turun-temurun dari hampir 50,000 klien dalam penelitian mereka yang terbukti baik untuk infeksi, dan juga 2 juta kontrol di seluruh bank bio yang tak terhitung jumlahnya, penelitian medis, dan juga bisnis turun-temurun langsung-ke-konsumen seperti sebagai 23andMe. Karena banyaknya pengumpulan informasi dari seluruh dunia, para peneliti memiliki kemampuan untuk membuat evaluasi yang tahan lama secara statistik bahkan lebih cepat, dan juga dari berbagai populasi yang lebih baik, daripada yang dapat dilakukan oleh satu tim mana pun.

Dari 13 lokus yang ditentukan hingga saat ini oleh grup, 2 memiliki keteraturan yang lebih besar di antara klien yang berasal dari Asia Timur atau Asia Selatan daripada klien yang berasal dari Eropa, yang menyoroti pentingnya keragaman dalam kumpulan data turun-temurun.

“Kami jauh lebih berhasil daripada upaya sebelumnya dalam mengambil sampel keragaman genetik karena kami telah melakukan upaya bersama untuk menjangkau populasi di seluruh dunia,” kata Daly “Saya pikir jalan kita masih panjang, tapi kita membuat kemajuan yang sangat baik.”

Kelompok ini menyoroti di antara 2 lokus ini secara khusus, di dekat genetika FOXP4, yang terhubung ke sel kanker paru-paru. Versi FOXP4 yang terhubung dengan COVID-19 ekstrem meningkatkan ekspresi genetika, merekomendasikan bahwa menghambat genetika dapat menjadi metode penyembuhan prospektif. Lokus lain yang terkait dengan COVID-19 ekstrem terdiri dari DPP9, suatu genetik yang juga terkait dengan sel kanker paru-paru dan juga fibrosis paru, serta TYK2, yang terkait dengan beberapa penyakit autoimun.

Mari Niemi, juga di FIMM dan juga ahli utama penelitian, menyatakan konsorsium berfokus pada interaksi ketika para peneliti menilai informasi, langsung meluncurkan hasil di situs web mereka setelah mereka benar-benar mencari presisi. Kelompok berharap hasil mereka dapat mengarahkan sarana ke target yang membantu untuk obat yang digunakan kembali.

Para ilmuwan pasti akan terus meneliti lebih banyak informasi karena mereka dapat ditemukan di dan juga meningkatkan hasil mereka dengan tata letak "Matters Arising" diAlam Mereka pasti akan mulai meneliti apa yang membedakan “penumpang jauh”, atau klien yang gejala dan gejala COVID-19nya berlangsung berbulan-bulan, dari yang lain, dan juga tetap mengenali lokus tambahan yang terkait dengan infeksi maupun kondisi ekstrem.

“Kami ingin mendapatkan beberapa hipotesis terapeutik yang sangat konkret di tahun depan,” kata Daly. “Secara realistis, kami kemungkinan besar akan menangani COVID-19 sebagai masalah kesehatan yang serius untuk waktu yang lama. Terapi apa pun yang muncul tahun ini, misalnya dari penggunaan kembali obat yang ada berdasarkan wawasan genetik yang jelas, akan memiliki dampak yang besar.”

Area baru untuk gen

Ganna menyoroti bahwa para peneliti memiliki kemampuan untuk menemukan sinyal turun-temurun yang tahan lama sebagai hasil dari inisiatif kolektif mereka, semangat alami berbagi data dan keterbukaan, dan juga keseriusan yang mencakup pemahaman bahwa seluruh dunia menghadapi risiko yang sama pada saat yang sama. waktu yang sama. Dia menambahkan bahwa para ahli genetika, yang secara teratur berurusan dengan kumpulan data besar, sebenarnya telah memahami keuntungan dari kerja sama terbuka untuk waktu yang sangat lama. “Ini hanya menggambarkan betapa jauh lebih baik sains—seberapa lebih cepat ia berjalan dan seberapa banyak lagi yang kita temukan—ketika kita bekerja sama,” kata Ganna.

Daly, untuk komponennya, sangat senang dengan betapa jelas dan dapat ditafsirkan hasil mereka bagi ahli genetika. Dia mengatakan pemahaman dari pekerjaan ini sebenarnya khusus dan juga mungkin pergeseran paradigma untuk bidang gen manusia, yang sebenarnya telah dikendalikan oleh penelitian penyakit kronis yang terus-menerus, penyakit keturunan yang tidak biasa, dan juga sel kanker.

“Penemuan ini benar-benar informatif dan membuat kami menyadari bahwa ada banyak potensi yang belum dimanfaatkan dalam menggunakan genetika untuk memahami dan berpotensi mengembangkan terapi untuk penyakit menular,” kata Daly. “Saya harap ini memberikan contoh bagaimana kita dapat membawa pendekatan genetika populasi ke serangkaian masalah baru yang sangat penting dalam mengembangkan bagian dunia.”.

Detonic