Urutan variasi SARS-CoV-2 yang tidak memadai menahan tindakan di seluruh dunia terhadap COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

Tidak adanya pengurutan variasi SARS-CoV-2 oleh AS dan negara-negara lain membahayakan tindakan global terhadap pandemi COVID-19, kata Dana Crawford dari Case Western Reserve University dalam Viewpoint baru yang dirilis 15 Juli di jurnal PLOSGenetika

Pengawasan diperlukan untuk tindakan yang efektif dan cepat terhadap episode penyakit, tetapi keamanan kesehatan masyarakat pada umumnya terkonsentrasi pada pemantauan jumlah kasus, rawat inap, dan kematian. Kemajuan dalam pengurutan genom saat ini memungkinkan kami untuk melacak varian herediter dalam mengembangkan infeksi dalam informasi yang tak tertandingi. Namun, terlepas dari jadwal pengurutan di sejumlah negara, pembinaan genomik sebagai teknik surveilans infeksi SARS-CoV-2, penyebab COVID-19, sebenarnya berjalan lambat, menantang, dan juga tidak teratur. Crawford menyebutkan bahwa, sejak awal April 2021, AS menempati urutan ke-33 di seluruh dunia dalam urutan SARS-CoV-2 untuk keamanan alternatif. Dia mengklaim bahwa secara tradisional, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC) tidak berfokus pada penelitian genomik untuk kesehatan dan kesejahteraan masyarakat, dan kecenderungan ini telah membuka celah dalam pemahaman kita tentang perkembangan real-time dari SARS-CoV-2 dan juga pengaruhnya terhadap penularan penyakit dan juga keseriusan.

Crawford menyebutkan pembiayaan yang tidak memadai, tidak adanya radar contoh yang efisien dan juga kebijakan yang ketat tentang contoh dan juga berbagi informasi sebagai alasan inisiatif pengurutan yang buruk. Namun, berbagai negara lain, seperti Cina dan Inggris, sebenarnya telah berhasil menaklukkan kesulitan tersebut. CDC baru-baru ini mendedikasikan lebih dari $200 juta untuk meningkatkan pengurutan, tetapi Crawford menyebutkan bahwa investasi keuangan yang terlambat ini menunjukkan bahwa AS tidak memiliki sumber data yang diatur tentang detail individu untuk penelitian COVID-19. Dia memperingatkan bahwa investasi keuangan dalam genomik SARS-CoV-2 perlu dilanjutkan dan diperluas karena variasi baru kemungkinan akan berkembang sebagai akibat dari ketidakteraturan dalam harga inokulasi dan kepatuhan terhadap langkah-langkah keamanan COVID-19 di seluruh dunia.

Mengingat bahwa SARS-CoV-2 adalah penyakit zoonosis yang unik tanpa infeksi manusia sebelumnya, Crawford mengatakan bahwa sekuensing dan evaluasi penting untuk memahami lintasan wabah dan juga perkembangannya. Ketentuan juga sangat diperlukan untuk menghubungkan informasi turun-temurun dengan sumber informasi profesional dan epidemiologis untuk studi penelitian kesehatan dan kebugaran masyarakat. Akhirnya, dia menyimpulkan bahwa inisiatif pengurutan global yang berkelanjutan masih diperlukan untuk mengenali dan juga membalas infeksi yang terus berkembang ini yang tidak memahami batasan global.

“Kontrol COVID-19 membutuhkan data genomik dan kesehatan masyarakat patogen inang yang hampir real-time untuk melacak bagaimana SARS-CoV-2 telah berevolusi dan bagaimana evolusi ini memengaruhi penularan dan tingkat keparahan penyakit,” termasuk Crawford. “Upaya pengurutan AS dan global terlalu sedikit dan terlalu terputus-putus, menggarisbawahi kebutuhan untuk terlibat dengan genomik manusia dan mengintegrasikan teknologinya dalam tanggapan kesehatan masyarakat penyakit menular yang muncul.”.