Bagaimana membuat kumpulan data penelitian biomedis menjadi interaktif

Bagaimana agar data penelitian biomedis dapat berinteraksi?

Prinsip interoperabilitas mendefinisikan kemampuan berbagai sistem untuk terhubung. Ini adalah kesulitan besar dalam penelitian biomedis, serta khususnya, di bidang pengobatan khusus, yang terutama didasarkan pada pengumpulan dan penilaian kumpulan data yang tak terhitung jumlahnya Untuk keadaan, pandemi COVID-19 telah mengungkapkan bahwa juga ketika teknologi , pembatasan yang sah dan jujur ​​diajukan, informasi terus sulit untuk dinilai sebagai akibat dari ketidakjelasan semantik. Di bawah naungan Swiss Personalized Health Network (SPHN) serta bekerja sama erat dengan perwakilan dari 5 rumah sakit pendidikan Swiss serta eHealth Suisse, sekelompok peneliti dari Universitas Jenewa (UNIGE) serta Rumah Sakit Universitas Jenewa (HUG), bekerja sama dengan Institut Bioinformatika SIB Swiss dan Rumah Sakit Universitas Lausanne (CHUV), telah menciptakan teknik untuk kerangka kerja nasional yang dianut oleh semua rumah sakit pendidikan Swiss dan lembaga pendidikan. Dengan strategi praktisnya, teknik ini didasarkan pada pengembangan struktur semantik biasa yang tidak bertujuan untuk mengubah persyaratan yang ada, tetapi untuk menggunakannya dalam cara yang kolaboratif dan serbaguna sesuai dengan tuntutan penelitian dan pendamping. melibatkan. Penerapan teknik ini, yang baru saja dimulai, mencatat tindakan penting untuk mempromosikan penelitian dan pengembangan obat yang benar-benar disesuaikan di Swiss.

Pengobatan yang dipersonalisasi didasarkan pada eksploitasi serta evaluasi sejumlah besar informasi baik genomik, epidemiologis atau dari pencitraan klinis, hingga definisi esensi. Untuk dapat melakukan ini, referensi silang serta mengumpulkan informasi yang sama jelas adalah wajib, juga ketika mereka berasal dari berbagai sumber.

Dengan pemikiran ini, pemerintah federal Swiss menghasilkan pada tahun 2017 Jaringan Kesehatan Pribadi Swiss (SPHN), sebuah kampanye yang ditempatkan di bawah manajemen Akademi Ilmu Kedokteran Swiss bekerja sama dengan Institut Bioinformatika Swiss SIB yang bermaksud untuk mengiklankan penggunaan sebagai serta pertukaran informasi kesehatan untuk penelitian “Meskipun investasi besar selama dekade terakhir, masih ada perbedaan besar”, klaim Christian Lovis, supervisor Departemen Radiologi serta Informatika Medis di Fakultas Kedokteran UNIGE serta kepala departemen Divisi Ilmu Informasi Medis di HUG. “Inilah sebabnya kami ingin, dengan mitra kami dan SPHN, untuk mengusulkan strategi dan standar umum yang cukup fleksibel untuk mengakomodasi semua jenis basis data saat ini dan di masa depan.”

Teknik tiga pilar

Kami terhubung pada 3 persyaratan utama: definisi yang kami tawarkan ke poin, karena kami harus menetapkan dasar yang biasa untuk memahami satu sama lain; persyaratan teknologi– kebisingan, yang dengannya kita berbicara; dan pada akhirnya, perusahaan definisi serta kebisingan dengan kalimat dan tata bahasa untuk membingkai interaksi dalam cara yang dapat dipahami. “Dari segi data, sama saja, jelas Christophe Gaudet-Blavignac, peneliti dalam tim yang dipimpin Christian Lovis. Anda harus menyetujui semantik, untuk mewakili secara konseptual apa yang harus dikomunikasikan. Maka kita membutuhkan bahasa komposisi untuk menggabungkan makna-makna ini dengan semua kebebasan yang diperlukan untuk mengekspresikan segala sesuatu yang perlu diungkapkan. Dan akhirnya, tergantung pada proyek dan komunitas penelitian yang terlibat, ini akan 'diterjemahkan' sesuai kebutuhan ke dalam model data, yang jumlahnya sama banyaknya dengan bahasa yang digunakan di dunia.”

“Oleh karena itu, tujuan kami adalah menyatukan kosakata sehingga dapat dikomunikasikan dalam tata bahasa apa pun, daripada menciptakan kosakata baru dari awal yang harus dipelajari semua orang lagi”, klaim Christian Lovis “Dalam hal ini, federalisme Swiss adalah keuntungan besar. : itu telah memaksa kita untuk membayangkan strategi desentralisasi, yang dapat diterapkan di mana-mana. Oleh karena itu, kendala telah menciptakan peluang untuk mengembangkan sistem yang bekerja terlepas dari bahasa, budaya, dan peraturan lokal.” Hal ini memungkinkan untuk menggunakan versi informasi tertentu hanya untuk tindakan terakhir yang disesuaikan dengan gaya yang diminta oleh pekerjaan tertentu – tata letak Administrasi Makanan dan Obat-obatan (FDA) ketika datang untuk bekerja sama dengan kelompok Amerika, sebagai misalnya, atau segala jenis tata letak tertentu lainnya yang digunakan oleh negara atau kampanye penelitian tertentu. Ini terdiri dari jaminan pemahaman yang baik serta penghematan waktu yang besar.

Tidak ada pengaruh pada pertahanan informasi

Namun, interoperabilitas informasi tidak berarti berbagi informasi metodis. “Dunia perbankan, misalnya, telah lama mengadopsi standar interoperabilitas global, tegas Christophe Gaudet-Blavignac. IBAN sederhana dapat digunakan untuk mentransfer uang dari akun mana pun ke akun lainnya. Namun, ini tidak berarti bahwa siapa pun, baik individu, organisasi swasta, atau pemerintah, dapat mengetahui apa yang ada di akun ini tanpa kerangka hukum yang ketat.” Memang, perbedaan harus dibuat antara alat yang menghasilkan interoperabilitas serta aplikasinya, di satu sisi, serta struktur regulatif yang mengatur kemudahan aksesnya, di sisi lain.

Aplikasi strategi

Teknik ini sebenarnya telah diterapkan selangkah demi selangkah di Swiss mengingat pada pertengahan 2019, dalam struktur Jaringan Kesehatan Pribadi Swiss “Rumah sakit universitas Swiss sudah mengikuti strategi yang diusulkan untuk berbagi data yang dapat dioperasikan untuk semua proyek penelitian multisentris yang didanai oleh Inisiatif SPHN”, catat Katrin Crameri, supervisor Personalized Health Informatics Group di SIB yang bertanggung jawab atas Pusat Koordinasi Data SPHN. Selanjutnya, beberapa fasilitas medis mulai menerapkan teknik ini setelah kampanye SPHN.

Detonic