Bagaimana para ilmuwan dapat mengetahui apakah seseorang tertular virus corona di klub malam

Bagaimana para ilmuwan dapat membantu mengetahui apakah seseorang tertular virus corona di klub malam

Kerumunan yang berjumlah lebih dari 13,000 orang sangat bersemangat pada dua acara percontohan di Liverpool di klub malam Circus dan festival musik Sefton Park Pilot pada awal Mei. Ini adalah bagian dari Program Penelitian Acara di Inggris, memberi penonton rasa norma lama — berkumpul tanpa jarak sosial atau penutup wajah — untuk melihat apa efek acara massal terhadap penyebaran virus corona.

Peserta harus menjalani tes aliran lateral cepat negatif baru-baru ini untuk menunjukkan bahwa mereka tidak mungkin memiliki COVID-19. Tetapi tidak ada tes yang sempurna—semua tes COVID-19, termasuk tes aliran lateral, akan melewatkan beberapa kasus. Oleh karena itu, ada kemungkinan bahwa beberapa peserta terinfeksi dan dapat menginfeksi orang lain. Jika acara serupa akan segera dibuka kembali, penting untuk mengetahui seberapa besar risiko ini.

Pengujian dan statistik telah membantu kami menemukan hal ini. Setiap peserta mengikuti tes aliran lateral mereka dalam 36 jam menjelang acara. Mereka kemudian diminta untuk mengambil jenis tes yang berbeda (tes PCR, menggunakan kit di rumah yang dikirim ke laboratorium untuk dianalisis) baik pada hari acara maupun lima hari kemudian.

Tes aliran lateral sederhana. Mereka dengan cepat memberikan jawaban ya atau tidak tentang apakah seseorang memiliki COVID-19, bekerja sedikit seperti tes kehamilan.

Tes PCR yang digunakan sedikit lebih canggih. Mereka tidak hanya menunjukkan apakah orang itu positif, tetapi juga memberikan angka yang disebut "ambang siklus" (Ct) yang mencerminkan jumlah virus corona pada tes swab orang tersebut. Semakin rendah angka Ct, semakin tinggi jumlah virus yang dimiliki seseorang di dalam tubuhnya, sehingga semakin menular mereka. (Hasil PCR negatif adalah hasil di mana Ct lebih tinggi dari level tertentu.)

Bekerja di luar waktu infeksi

Menilai apakah suatu acara aman memerlukan penggunaan tes ini untuk mengetahui berapa banyak orang yang tertular virus di atau di sekitar acara tersebut. Untuk melakukan ini, pertama-tama Anda menggunakan tes lanjutan untuk mengetahui siapa yang membawa infeksi segera setelahnya. Kemudian Anda memperkirakan kapan ada orang yang tes-positif tertular virus: sebelum, selama, atau setelah kejadian.

Untuk menyimpulkan kapan virus itu ditemukan, Anda perlu memahami dinamika infeksi COVID-19. Ini cukup sederhana. Di dalam tubuh, COVID-19 memiliki dua fase berbeda: peningkatan eksponensial dalam jumlah virus yang ada saat virus itu bertahan (dengan demikian Ct menurun), dan penurunan eksponensial saat orang tersebut melepaskan virus (dengan Ct meningkat).

Dengan menggunakan data dan analisis yang ada dari banyak infeksi sebelumnya, kami dapat menemukan lintasan rata-rata infeksi COVID-19. Diplot pada grafik, jumlah virus dalam tubuh di seluruh infeksi rata-rata orang—yang diukur dengan angka Ct—tampak seperti garis merah di bawah ini.

Jika seseorang mengembalikan tes PCR positif setelah kejadian, nomor Ct dari tes mereka dapat mewakili satu dari dua titik infeksi — satu saat infeksi mereka berkembang dan satu saat menurun.

Misalnya, pada grafik di atas, jika nomor Ct orang tersebut adalah C0, maka tes mereka diambil baik di titik A dalam waktu (pada sumbu X) atau titik B. Seperti yang kita ketahui berapa banyak waktu yang telah berlalu antara mereka menghadiri acara tersebut dan mengambil tes PCR mereka (diwakili oleh pada grafik), kita dapat melihat ke belakang untuk mendapatkan dua perkiraan tingkat Ct mereka ketika menghadiri acara: CA dan CB. Ini juga memberi kita dua perkiraan tentang seberapa jauh mereka terinfeksi, dan oleh karena itu dua perkiraan kapan mereka terinfeksi.

Tapi mana yang benar? Nah, kita tahu orang tersebut harus menjalani tes negatif 36 jam sebelum acara tersebut hadir. Tes aliran lateral mungkin negatif palsu ketika orang memiliki sejumlah kecil virus di dalam tubuh mereka, tetapi jauh lebih kecil kemungkinannya untuk memberikan negatif palsu ketika seseorang memiliki viral load tinggi.

Jadi jika salah satu dari dua kemungkinan tingkat infeksi pada saat kejadian—CA dan CB—menunjukkan viral load yang tinggi tetapi yang lain tidak, kasus viral load yang tinggi kemungkinan dapat diabaikan. Memang, kita dapat menggunakan data historis tentang keakuratan tes aliran lateral untuk mengetahui probabilitas tes yang mengembalikan hasil negatif ketika nomor Ct adalah masing-masing CA dan CB, dan menggunakan ini untuk memberi tahu kita yang mana dari dua perkiraan kapan mereka terinfeksi adalah lebih mungkin.

Artinya, untuk setiap orang yang dinyatakan positif pada tes PCR setelah kejadian, kami memiliki perkiraan waktu terbaik ketika mereka tertular COVID-19. Bagi mereka yang perkiraan waktu infeksinya sebelum kejadian, kami berasumsi bahwa mereka tertular virus di tempat lain tidak lama sebelumnya, dan tes aliran lateral mereka gagal mengidentifikasi infeksi mereka—mungkin karena mereka berada di awal infeksi dan masih memiliki tingkat infeksi yang rendah. jumlah virus dalam tubuh mereka. Kami juga dapat memperkirakan kapan viral load mereka memuncak, dan dengan demikian seberapa menularnya mereka di acara tersebut.

Dan bagi mereka yang waktu infeksinya tampak pada atau segera setelah acara, kita dapat berasumsi bahwa mereka terinfeksi saat menghadiri. Kami kemudian dapat membandingkan kedua kelompok ini—yang menular dan yang terinfeksi—untuk melihat seberapa banyak penularan yang terjadi dan seberapa berisiko kejadian itu.

Dengan menggunakan teknik ini, kami menemukan bahwa peristiwa Liverpool tidak berdampak pada penyebaran COVID-19 di area Liverpool. Tetapi dengan melihat apakah peristiwa ini aman, kami hanya memberi tahu pembuat kebijakan. Mereka memiliki tugas yang tidak menyenangkan untuk menilai apakah risiko yang diidentifikasi cukup rendah untuk mengembalikan kita ke kehidupan seperti yang pernah kita ketahui.