Perangkat ekspresi gen mungkin memiliki resistensi, konsekuensi sel kanker

RNA

Alternatif polyadenylation (APA) adalah perangkat penanganan RNA yang mengelola ekspresi genetika dengan membuat berbagai catatan RNA tegak lurus dari genetika yang sama persis. Meskipun mempengaruhi sebagian besar genetika manusia, nilai APA tidak diakui dengan benar. Sekarang penelitian baru oleh The Wistar Institute menjelaskan fitur penting dari APA dalam memungkinkan mRNA tertentu untuk mendapatkan rincian situs sintesis protein yang sehat serta mengungkapkan bahwa ukuran, seri, serta properti arsitektur perumahan dapat mengetahui lokasi (sebagai serta takdir) mRNA di dalam sel. Pencarian ini, dirilis online di jurnal Laporan sel, mengklarifikasi dampak APA yang mungkin mewakili perubahan standar di area laju metabolisme mRNA.

Laboratorium penelitian Bin Tian,Ph D., guru sekaligus co-leader Program Ekspresi & Regulasi Gen di Pusat Kanker The Wistar Institute serta penulis tua dalam penelitian ini, termasuk yang pertama menemukan kejadian ekstensif APA memanfaatkan genomik serta teknik bioinformatika.

Setelah transkripsi genetika, RNA pembawa secara kimiawi disesuaikan untuk menjadi partikel RNA yang sepenuhnya tumbuh yang dapat meninggalkan inti serta melakukan fitur-fiturnya. Salah satu penyesuaian ini adalah poliadenilasi, yang menghentikan kerusakan RNA serta lebih memilih terjemahannya menjadi protein yang sehat.

Melalui APA, sebuah genetika dapat dipoliadenilasi di beberapa situs web, menyebabkan mRNA dengan berbagai seri pengkodean dan/atau area pengatur (3′ area yang tidak diterjemahkan atau 3′ UTR), yang disebut isoform. Transkrip yang menuliskan protein sehat yang sama persis dapat memiliki takdir yang berbeda di dalam sel sebagai hasil dari 3TR UTR yang unik, yang memelihara aspek-aspek yang mengatur laju metabolisme mRNA. Ini secara drastis meningkatkan kerumitan genom kita, untuk memastikan bahwa lebih sedikit genetika yang diperlukan untuk menuliskan semua protein sehat yang dibutuhkan sel.

Tian serta rekan kerjanya menggunakan teknik genomik yang berguna untuk memeriksa sirkulasi isoform APA dalam sel mouse komputer. Evaluasi bioinformatika serta teknik kecerdasan buatan mengungkapkan bahwa APA, menggunakan infleksi mRNA 3′ UTR, mempengaruhi hubungan antara mRNA serta retikulum endoplasma (Ruang Darurat), jaringan tabung yang membangun, merencanakan, serta transportasi yang sehat protein.

Mereka menyebut perangkat ini sebagai organisasi Ruang Darurat independen terjemahan (TiERA) dan menemukan bahwa beberapa mRNA memiliki rangkaian detail dan kerangka kerja yang menetapkan kemungkinan mereka untuk melakukan APA dan pada akhirnya terhubung dengan Ruang Gawat Darurat.

“Ketika mRNA meninggalkan nukleus dan pindah ke sitoplasma, mereka perlu diarahkan dengan benar untuk mencapai tempat translasi protein yang tepat,” kata Tian “Sitoplasma adalah ruang besar untuk molekul RNA: Sebagai perbandingan, bayangkan memasuki stadion bisbol dan membutuhkan petunjuk arah untuk mencapai tempat duduk Anda.”

Kelompok tersebut menemukan bahwa mRNA dengan TiERA yang lebih besar memiliki kecenderungan untuk menulis sinyal protein sehat, yang membantu sel berinteraksi satu sama lain dengan mengirimkan, menerima dan memperbaiki sinyal sebagai reaksi terhadap perubahan di atmosfer.

Mereka merekomendasikan agar APA membuat prosedur ini lebih andal dengan mengamankan isoform mRNA tertentu dengan Ruang Gawat Darurat di tempat-tempat bergerak yang terperinci di mana peristiwa pensinyalan penting terjadi.

"Menurut model kami, ER akan berfungsi sebagai perancah untuk menjaga protein 'di tangan' di tempat yang paling dibutuhkan," kataTian "Ini akan menyediakan platform untuk menandakan peristiwa terjadi secara efektif di tempat yang tepat di dalam sel.".

Detonic