A szennyvíz genomiális vizsgálata hatékonyan képes nyomon követni a COVID-19 aggályos változatait

A kutatások azt mutatják, hogy a szennyvíz genomikai vizsgálata hatékonyan képes nyomon követni a COVID-19 változatait egy régióban

A szennyvízvizsgálattal pontosan és gyorsan fel lehet ismerni a környéken előforduló COVID-19 fertőzések mértékét, amely az aggodalomra okot adó változatok növekedésével jár, javasolja egy vadonatúj kutatási tanulmány, amelyet az UBC tanár, Dr. Ryan Ziels vezetett.

Ziels és munkatársai a Vancouver metró térségében található 5 nagyvárosi szennyvíztelep szennyvízcsatorna-példáit értékelték a megemelt COVID-19 példányszámok alatt, 2021 februárjától áprilisig.

Az eredmények, amelyeket a medrxiv online nyomtatásával magyaráztak, rávilágítottak arra, hogy a Vancouver térségéből felhalmozódott szennyvíz vírusos fókusza gondosan nyomon követte a környékbeli szakmai helyzetek számát.

A tudósok, köztük a Ph.D. Xuan Lin polgári tervezésű tanuló, szintén felfedezték, hogy a szennyvíz aggályos változataival összefüggő anomáliák szabályossága szorosan összefügg a tudományosan azonosított helyzetek mintáival.

Ebben a kérdésben és megválaszolásban Dr. Ziels, a mikrobiális ökológiát kutató ökológiai tervező tudós arról beszél, hogy milyen kutatási kutatásokat kerestek - és arról is, hogy a szennyvíz genomikai vizsgálata hogyan jelentheti a betegség biztonságát és az adminisztráció megközelítését.

Hogyan került kapcsolatba ezzel a kutatással?

Valójában évek óta foglalkozom a szennyvíz genomikai szekvenálásával, és amikor a járvány megrongálódott, úgy döntöttem, hogy ezt a megértést használom a SARS-CoV-2 fertőzés megértésére, különféle más tudósokkal együttműködve. Csoportunk ökológiai mikrobiológusokból, tervezőkből és epidemiológusokból áll (az UBC-nél és a BC CDC-nél is), és számunkra is megtiszteltetés számunkra, hogy munkánk során együtt dolgoztunk a Metro Vancouver-szel.

Számos egyéb betegséghez hasonlóan a SARS-CoV-2 fertőzés a fertőzés során a székletben csökken, és a fővárosi szennyvízben vírusgenom darabok is megtalálhatók.

A hatalmas kérdés az volt, hogyan lehet gyorsan és pontosan azonosítani ezeket a darabokat annak érdekében, hogy extra inputokat nyújtsunk közvetlenül az általános közegészségügyi és wellness eszköztárba?

Milyen technikákat használt fel a Vancouver metró szennyvízének felmérésére és az aggodalomra okot adó változatok nyomon követésére?

Korábban létrehoztam egy gyors és szintén pontos szekvenálási módszert hordozható DNS-szekvenátorok felhasználásával, és néhány változtatással a csoportom és én is ezt a rendszert alkalmaztam a koronavírus genom darabjainak felmérésére Vancouver környékének szennyvíz példáiban.

Amit csinálunk, az hasonlít a CanCOGeN, a kanadai COVID Genomics Network - a kanadai kormány, a vidéki és a helyi közegészségügyi és wellness hatóságok konzorciumának munkájához, amely körülbelül 150,000 XNUMX vírusgenomot szekvenál Kanadában. Az alábbiakban azonban inkább személyi példák szekvenálása , sorrendbe állítunk olyan szennyvíz-példákat, amelyek egy adott területen teljes populációkból gyűjtenek inputot.

Mi volt a legfontosabb keresése?

A koronavírus genomdarabok mennyiségének mérése tekintetében felfedeztünk egy kicsit nagyon korai jelet, szemben a kórházi tartózkodás vagy a példányszám módosításával. Ez azt javasolta, hogy a szennyvízvizsgálat valamilyen korai óvatosságot nyújtson.

A szennyvíz genomszekvenálásával azonosíthatjuk az aggodalomra okot adó változásokkal kapcsolatos anomáliák növekedését, és ezeket az információkat egészségügyi és wellness hatóságainknak is felajánljuk, mint kiegészítő segítséget közegészségügyi és wellness megközelítésükben.

Képessé tehetjük a felmerülő változatok keresésére vonatkozó megközelítésünket, és egy példa alapján képet is kaphatunk az egész területről. A genomszekvenálás hasonlóképpen lehetővé tette számunkra, hogy azonosítsuk a Vancouver-i metrócsatornákat, amelyekben a variánsok extra előnyt jelentenek.

A vírusinformációk gyors szekvenálása lehetővé teszi számunkra, hogy valóban gyors megfordulást nyújtsunk - rekordokat kínálunk a klinikai egészségügyi és wellness rendőreink frissítésére 3–4 napon belül a példa gyűjtésétől számítva.

Milyen hatásai vannak a jövőbeni járványvizsgálatoknak és az adminisztrációnak is?

Bővülő kutatási tanulmány szerint a szennyvízkóstoló szolgálhat a COVID-19 fertőzések mértékének megértésében a területeken. Célunk, hogy kiegészítsük, és ne változtassuk meg a különböző egyéb közegészségügyi tesztelési módszereket. A szennyvízvizsgálat akkor szolgálhat, ha a professzionális tesztelés kihívást jelent, vagy ha nincs nagyvárosi tartományban.

Hasonlóképpen elfogadjuk a kanadai vízhálózatot egy olyan országos munkacsoport létrehozására, amely megosztja egymással a szennyvíz nyomon követésével kapcsolatos megértését. Egy ilyen országos hálózat megbízható információkat hozhat létre, miközben haladunk a gazdasági helyzetünk újbóli megnyitása irányában.