A nagy genomikai elemzés kiemeli a COVID-19 kockázati tényezőket

SARS-CoV-2, COVID-19

2020 márciusában több száz kutató csatlakozott a világ minden tájáról, hogy válaszoljon egy nyomó és bonyolult kérdésre: milyen örökletes tényezők befolyásolják, hogy egyes COVID-19 kliensek miért hoznak létre extrém, halálos állapotot kórházi tartózkodáshoz, míg mások mérsékelt tünetekkel megúszják és tünetek, vagy semmilyen módon?

A mai napon kiadott keresésük részletes összefoglalása, megjelent Természet, 13 olyan lokuszt vagy területet tár fel az emberi genomban, amelyek erősen összefüggenek a fertőzéssel vagy az extrém COVID-19-vel. A tudósok emellett meghatároztak olyan ok-okozati tényezőket, mint a cigarettázás és a magas testtömeg-index. Ezek az eredmények a valaha végzett legnagyobb, az egész genomot átfogó szervezeti kutatásokból származnak, amelyek csaknem 50,000 19 COVID-2 klienst és XNUMX millió tiszta kontrollt tartalmaznak.

A kutatások segíthetnek a jövőbeni kezelések célkitűzésében, és rávilágítanak az örökletes kutatások erejére is, hogy többet megtudjanak az átvihető állapotról.

Ezt a globális kezdeményezést, a COVID-19 Host Genomics Initiative elnevezést 2020 márciusában indította el Andrea Ganna, a Finn Molekuláris Orvostudományi Intézet (FIMM), a Helsinki Egyetem csapatvezetője, valamint Mark Daly, a FIMM felügyelője és az intézet résztvevője a Broad Institute of MIT és a Harvardban A kampány valójában az emberi gének egyik legjelentősebb partnersége közé bővült, és jelenleg több mint 3,300 íróból és 61 nemzet 25 kutatásából is áll.

Ben Neale, a széles körű orvosi és népességgenetikai program társigazgatója, valamint a kutatás egyik vezető írója kijelentette, hogy bár az oltások védelmet nyújtanak a fertőzéssel szemben, a COVID-19 terápiában még mindig jelentős helyet kell felújítani, amelyet örökletes analízissel lehet bejelenteni. Megemlítette, hogy a terápiás technikák javítása segíthet megváltoztatni a világjárvány világszerte nagy bezárásokat követelő pandémiáját a szigeti őshonos állapotban, amely sokkal lokálisabb, és a csökkent, bármennyire rendszeres fok a lakosságban, akárcsak az influenza.

"Minél jobban tudunk kezelni a COVID-19-et, annál jobban felkészült lehet az orvosi közösség a betegség kezelésére" - jelentette ki. "Ha lenne egy mechanizmusunk a fertőzés kezelésére és valakinek a kórházból való kijuttatására, az gyökeresen megváltoztatná a közegészségügyi reakciónkat."

Hasznossága változatosság

Elemzésük elvégzéséhez a konzorcium összevonta a kutatás során csaknem 50,000 2 ügyfél orvosi és örökletes információit, amelyek kedvezőnek bizonyultak a fertőzés szempontjából, valamint 23 millió kontrollt számtalan biobankban, orvosi kutatásban, valamint a fogyasztók közvetlen örökletes üzletágában mint XNUMXandMe. A világ minden tájáról gyűjtött nagy mennyiségű információ miatt a kutatók képesek voltak statisztikailag tartós értékeléseket készíteni még gyorsabban, és a populációk jobb változatosságából is, mint bármelyik csapat képes magának hordozni.

A csoport által eddig meghatározott 13 lókusz közül kettőnek nagyobb volt a szabályszerűsége a kelet-ázsiai vagy dél-ázsiai eredetű ügyfelek körében, mint az európai eredetűeknél, ami rávilágított a változatosság jelentőségére az örökletes adatállományokban.

"Sokkal sikeresebbek voltunk, mint a korábbi erőfeszítések a genetikai sokféleség mintavételében, mert összehangolt erőfeszítéseket tettünk, hogy elérjük a világ népességét" - jelentette ki Daly. "Azt hiszem, még hosszú utat kell megtenni, de nagyon jól halad. ”

A csoport e két lokuszt külön kiemelte, a FOXP2 genetika közelében, amely a tüdőrák sejtjeihez kapcsolódik. Az extrém COVID-4-hez kapcsolódó FOXP4 verzió felveti a genetika kifejeződését, javasolva, hogy a genetika akadályozása perspektívikus gyógyító módszer lehet. Az extrém COVID-19-hez kapcsolódó egyéb lokuszok a DPP19-ből, a genetikából származnak, amely a tüdőrák sejtjeivel és a tüdőfibrózissal is társul, valamint a TYK9-ből, amely egyes autoimmun betegségekhez kapcsolódik.

Mari Niemi, a FIMM-en kívül és a kutatás vezető szakértője szerint a konzorcium az interakcióra összpontosított, miközben a kutatók értékelték az információkat, és azonnal elindították az eredményeket internetes oldalukon, miután valóban pontosságra törekedtek. A csoport azt kívánja, hogy eredményeik célba vehessék az újrafeldolgozott gyógyszerek célpontjait.

A tudósok minden bizonnyal továbbra is kutatni fognak még több információt, mivel ezek megtalálhatók és eredményeiket a „Felmerülő kérdések” elrendezéssel is frissítik.Természet Minden bizonnyal elkezdenék kutatni, mi különbözteti meg a „hosszútávú fuvarozókat” vagy azokat az ügyfeleket, akiknek a COVID-19 jelei és tünetei hónapokig tartanak, másoktól, és továbbra is felismerik a fertőzéssel és az extrém állapottal összefüggő hozzáadott lókuszokat.

"Szeretnénk arra törekedni, hogy a következő évben jó néhány nagyon konkrét terápiás hipotézist kapjunk" - jelentette ki Daly. „Reálisan valószínűleg nagy valószínűséggel sokáig foglalkozunk a COVID-19-vel, mint komoly egészségügyi problémával. Minden olyan terápia, amely ebben az évben megjelenik, például egy meglévő gyógyszer egyértelmű genetikai felismerés alapján történő újrafelhasználása, nagy hatással lenne. "

Vadonatúj terület a gének számára

Ganna kiemelte, hogy a kutatók képesek voltak tartós örökletes jeleket felfedezni kollektív kezdeményezéseik eredményeként, az adatmegosztás természetes szelleme és a nyitottság eredményeként, valamint az egész világ megértésének komolysága pontosan ugyanazzal a kockázattal találkozik pontosan Ugyanakkor. Hozzátette, hogy a genetikusok, akik rendszeresen foglalkoznak nagy adatállományokkal, valóban nagyon régóta megértették a nyílt együttműködés előnyeit. "Ez csak azt illusztrálja, hogy mennyivel jobb a tudomány - mennyivel gyorsabban halad és mennyivel többet fedezünk fel", amikor együtt dolgozunk "- jelentette ki Ganna.

Daly-t alkotórészének örömmel tölti el, hogy az eredményeik mennyire egyértelműek és értelmezhetők voltak a genetikusok számára. Kijelenti, hogy az ebből a munkából származó megértések valójában különlegesek, és paradigmaváltóak is lehetnek az emberi gének területén, amelyet a szokásos tartós betegség, szokatlan örökletes betegség és a rákos sejtek kutatása is irányított.

"Ezek a felfedezések valóban informatívak voltak, és rájöttünk arra, hogy rengeteg kiaknázatlan lehetőség rejlik a genetika alkalmazásában a fertőző betegségek terápiájának megértésére és potenciális fejlesztésére" - jelentette ki Daly. "Remélem, hogy ez példát mutat arra, hogyan hozhatnánk a populációgenetikai megközelítéseket egy olyan új problémakörre, amely különösen fontos a világ fejlődő részein."