Hogyan lehet interaktívvá tenni az orvosbiológiai kutatási adathalmazokat

Hogyan lehet az orvosbiológiai kutatási adatokat kölcsönhatásba hozni?

Az interoperabilitás elve meghatározza a különféle rendszerek csatlakozási képességét. Ez jelentős nehézséget jelent az orvosbiológiai kutatásban, valamint különösen a testreszabott gyógyszerek területén, amely főként számtalan adathalmaz összegyűjtésén és értékelésén alapul. A körülmények fennállása esetén a COVID-19 járvány valójában kiderítette, hogy amikor a technológiai , törvényes és őszinte korlátozásokat vetnek fel, az információkat továbbra is nehéz felmérni a szemantikai homályok eredményeként. A svájci személyre szabott egészségügyi hálózat (SPHN) égisze alatt, valamint szorosan együttműködve mind az öt svájci oktató kórház, valamint az eHealth Suisse munkatársaival, a genfi ​​egyetem (UNIGE), valamint az egyetemi kórházak kutatóinak csoportjával Genf (HUG), a SIB Svájci Bioinformatikai Intézettel, valamint a lausanne-i egyetemi kórházzal (CHUV) együttműködve, valójában megalkotta a technikát egy olyan országos keretrendszerhez, amelyet az összes svájci oktató kórház, valamint az iskolai intézmények magukban foglalnak. Gyakorlati stratégiájával ez a technika egy olyan szokásos szemantikai struktúra fejlődésén alapul, amely nem célja a meglévő követelmények megváltoztatását, ugyanakkor felhasználja azokat együttműködő, valamint sokoldalú eszközökben, a kutatás és a kísérők igényei szerint. azzal jár. Ennek a jelenleg ténylegesen megkezdett technikának az alkalmazása fontos lépést jelent a kutatások, valamint a valóban személyre szabott gyógyszerek fejlesztésének előmozdítása érdekében Svájcban.

A személyre szabott gyógyszeres kezelés hatalmas információmennyiségek kiaknázásán és értékelésén alapul, akár genomiális, epidemiológiai, akár klinikai képalkotástól kezdve a lényeg meghatározásáig. Ahhoz, hogy ezt meg lehessen tenni, kötelező a kereszthivatkozás, valamint az ugyanolyan összetéveszthetetlen információk összegyűjtése, még akkor is, ha valóban különböző forrásokból származnak.

Ezt szem előtt tartva a svájci szövetségi kormány 2017-ben elkészítette a Swiss Personalized Health Network (SPHN) kampányt, amelyet a Svájci Orvostudományi Akadémia irányítása alatt hajtottak végre a SIB Svájci Bioinformatikai Intézettel együttműködve, és amelynek célja a felhasználás reklámozása. valamint a wellness információk cseréje kutatással kapcsolatban: „Az elmúlt évtized jelentős beruházásai ellenére még mindig vannak jelentős eltérések” - állítja Christian Lovis, az UNIGE Orvostudományi Kar Radiológiai és Orvosi Informatikai Tanszékének vezetője, valamint a Orvosi Információs Tudományok Osztálya a HUG-nál. "Ezért szerettük volna partnereinkkel és az SPHN-szel olyan stratégiát és közös szabványokat javasolni, amelyek elég rugalmasak ahhoz, hogy mindenféle jelenlegi és jövőbeni adatbázist befogadjanak."

Három oszlopos technika

Három fő követelményt kötünk össze: az általunk kínált definíciót a pontokhoz, mivel szokásos alapon kell rendeznünk egymást, hogy megértsük egymást; technológiai követelmény - a zaj, amellyel beszélünk; valamint végső soron a definíció társasága, valamint a zaj mondatokkal, valamint a nyelvtan, hogy az interakciót érthető módon keresse meg. „Az adatok tekintetében ez ugyanaz, magyarázza Christophe Gaudet-Blavignac, a Christian Lovis által vezetett csapat kutatója. Meg kell egyeznie egy szemantikában, hogy konceptuálisan képviselje azt, amit közölni kell. Akkor szükségünk van egy kompozíciós nyelvre, hogy ezeket a jelentéseket összekapcsoljuk mindazzal a szabadsággal, amely szükséges ahhoz, hogy kifejezzük mindazt, amit kifejezni kell. És végül, az érintett projektektől és kutatói közösségektől függően, ezt szükség szerint „lefordítják” adatmodellekké, amelyek ugyanolyan sokak, mint a világban beszélt nyelvek. ”

„Célunk tehát az volt, hogy egységesítsük a szókincseket, hogy azok bármilyen nyelvtanban kommunikálhassanak, ahelyett, hogy új szókincset hoznánk létre a semmiből, amelyet mindenkinek újból meg kellene tanulnia” - állítja Christian Lovis „Ebben az értelemben a svájci federalizmus óriási előnyt jelent : arra kényszerített minket, hogy decentralizált stratégiát képzeljünk el, amely mindenhol alkalmazható. A kényszer tehát lehetőséget teremtett egy olyan rendszer kifejlesztésére, amely a helyi nyelvek, kultúrák és előírások ellenére is működik. ” Ez lehetővé teszi bizonyos információs verziók használatát, hogy csak az utolsó műveletet igazítsák az adott munkakör által igényelt stílusokhoz - az Élelmiszer, valamint a Drug Administration (FDA) elrendezéséhez, amikor egy amerikai csoporttal való együttműködésről van szó. példa, vagy bármilyen más különféle elrendezés, amelyet egy adott nemzet vagy kutatási kampány használ. Ez magában foglalja a jó megértés garanciáját, valamint a hatalmas időmegtakarítást.

Nincs hatással az információvédelemre

Az információ interoperabilitása azonban nem jelenti a módszeres információmegosztást. „A banki világ például már régóta elfogadta az interoperabilitás globális normáit - hangsúlyozza Christophe Gaudet-Blavignac. Egy egyszerű IBAN segítségével pénzt lehet átutalni bármely számláról bármelyik másikra. Ez azonban nem jelenti azt, hogy bárki, legyen szó magánszemélyekről, magánszervezetekről vagy kormányokról, szigorú jogi keret nélkül tudhatja, mi van ezeken a számlákon. " Valójában különbséget kell tenni egyrészt az interoperabilitást elősegítő eszközök, másrészt azok alkalmazása és másfelől az azok hozzáférhetőségét szabályozó szabályozási struktúra között.

Stratégia alkalmazása

Ezt a technikát valóban lépésről-lépésre alkalmazták Svájcban, tekintve, hogy 2019 központja, a svájci személyre szabott egészségügyi hálózat struktúrájában „a svájci egyetemi kórházak már követik azt a javasolt stratégiát, hogy interoperábilis adatokat osszanak meg az összes multicentrikus kutatási projekt számára, amelyet a SPHN-kezdeményezés ”- írja Katrin Crameri, a SIB személyre szabott egészségügyi informatikai csoportjának felügyelője, az SPHNData Koordinációs Központ felelőse. Ezenkívül néhány egészségügyi intézmény kezdi végrehajtani ezt a technikát az SPHN-kampányon túl.