Genomska ispitivanja otpadnih voda mogu učinkovito pratiti zabrinjavajuće varijante COVID-19

Istraživanja pokazuju da genomska ispitivanja otpadnih voda mogu učinkovito pratiti zabrinjavajuće varijante COVID-19 unutar regije

Ispitivanje otpadnih voda može precizno i ​​brzo prepoznati stupanj infekcija COVID-19 na tom području, što se sastoji od povećanja zabrinutosti, preporučuje potpuno novo istraživanje koje je vodio učitelj s UBC-a dr. Ryan Ziels.

Ziels i njegovi suradnici procjenjivali su primjere kanalizacije iz 5 gradskih postrojenja za otpadne vode na području Metroa Vancouvera tijekom trajanja povišenog broja slučajeva COVID-19, od veljače do travnja 2021. godine.

Rezultati, objašnjeni na mreži u pretprintu na medrxivu, otkrili su da je virusni fokus u otpadnim vodama nakupljenim s područja Vancouvera pažljivo pratio broj profesionalnih situacija u tom području.

Znanstvenici, među kojima je bio i učenik Ph D. civilnog dizajna Xuan Lin, također su otkrili da je pravilnost anomalija povezanih s varijantama zabrinutosti u otpadnim vodama u velikoj mjeri povezana s obrascima u znanstveno utvrđenim situacijama na tom području.

U ovom odgovoru na pitanja, dr. Ziels, znanstvenik za ekološki dizajn koji istražuje mikrobiološku ekologiju, govori o potrazi za istraživačkim istraživanjem - kao io tome kako genomsko ispitivanje otpadnih voda može izvijestiti o sigurnosti bolesti i pristupima uprave.

Kako ste se povezali s ovim istraživanjem?

Zapravo istražujem genomsko sekvenciranje otpadnih voda već niz godina, a također kad je pandemija oštećena, odlučio sam upotrijebiti ovo razumijevanje za razumijevanje infekcije SARS-CoV-2 u suradnji s raznim drugim znanstvenicima. Našu grupu čine ekološki mikrobiolozi, dizajneri, a također i epidemiolozi (na UBC-u i BC CDC-u), a također smo imali privilegiju surađivati ​​s Metroom Vancouver za svoj posao.

Kao i brojne druge bolesti, infekcija SARS-CoV-2 ispušta se u feces tijekom infekcije, a također se komadi virusnog genoma mogu naći u gradskim otpadnim vodama.

Ogromno je pitanje bilo samo kako možemo brzo i precizno identificirati te dijelove kako bismo ponudili dodatne ulaze u opći priručnik za javno zdravstvo i wellness?

Koje ste tehnike iskoristili za mjerenje, a također i za praćenje varijanti koje zabrinjavaju otpadne vode Metro Vancouver?

Prije sam uspostavio brzu i također preciznu metodu sekvenciranja koristeći prijenosne DNA sekvencere, a uz neke izmjene i moja skupina, a također sam koristio ovaj sustav za mjerenje komada genoma koronavirusa u primjerima otpadnih voda s područja Vancouvera.

Ovo što radimo nalikuje poslu koji obavlja CanCOGeN, kanadska COVID Genomics Network - konzorcij kanadske vlade, ruralnih, ali i lokalnih tijela za javno zdravstvo i wellness, koji sekvencira približno 150,000 XNUMX virusnih genoma u cijeloj Kanadi. Ali u nastavku, umjesto da slijedi primjere osoba , slijedimo primjere otpadnih voda koji akumuliraju unos cijelih populacija unutar područja.

Koja su bila vaša vitalna traženja?

Što se tiče mjerenja količine dijelova genoma koronavirusa, otkrili smo malo vrlo ranog signala nasuprot modifikacijama u bolničkim boravcima ili brojevima primjeraka. Ovo preporučuje da ispitivanje otpadnih voda može pružiti neku vrstu vrlo ranog opreza.

Sekvenciranjem genoma otpadnih voda možemo identificirati pojačanje anomalija povezanih s zabrinjavajućim varijantama, a također nudimo ove informacije našim zdravstvenim i wellness službama kao dodatnu pomoć u njihovim pristupima javnom zdravstvu i wellnessu.

U mogućnosti smo prilagoditi svoj pristup traženju postojećih varijanti, a također zapravo dobiti sliku cijelog područja u jednom primjeru. Sekvenciranje genoma također nam je omogućilo da utvrdimo u kojim kanalizacijskim spremištima u Metro Vancouveru će inačice biti posebno vodeće.

Brzo sekvenciranje virusnih informacija omogućuje nam da ponudimo stvarno brz preokret - nudimo evidenciju za nadogradnju naših kliničkih zdravstvenih i wellness policajaca za samo 3 do 4 dana od prikupljanja primjera.

Koji su učinci na buduće ispitivanje pandemije, a također i na primjenu?

Širi se istraživačka studija da degustacija otpadnih voda može poslužiti za razumijevanje stupnja infekcije COVID-19 na određenim područjima. Cilj nam je dopuniti, a ne mijenjati, razne druge testove javnozdravstvenih tehnika. Ispitivanje otpadnih voda može poslužiti kada je profesionalno ispitivanje izazovno ili ga nema u gradskom dometu.

Također prihvaćamo Kanadsku mrežu voda da razvijemo nacionalni tim koji dijeli razumijevanje o praćenju otpadnih voda. Takva nacionalna mreža može donijeti pouzdane informacije dok napredujemo u smjeru ponovnog otvaranja naše ekonomske situacije.