Kako znanstvenici mogu znati je li netko u noćnom klubu uhvatio koronavirus

Kako znanstvenici mogu reći je li netko uhvatio koronavirus u noćnom klubu

Gužva od preko 13,000 XNUMX ljudi bila je raspoložene na dva pilot događaja u Liverpoolu u noćnom klubu Circus i glazbenom festivalu Sefton Park Pilot početkom svibnja. To su bili dio britanskog Programa za istraživanje događaja, dajući publici okus stare norme - okupljanja bez socijalnog udaljavanja ili pokrivanja lica - kako bi vidjeli kakav bi učinak masovni događaji mogli imati na širenje koronavirusa.

Polaznici su morali obaviti nedavni negativni brzi test bočnog protoka kako bi pokazali da vjerojatno neće imati COVID-19. Ali nijedan test nije savršen - svi testovi na COVID-19, uključujući testove bočnog protoka, propustit će neke slučajeve. Stoga je bilo moguće da su neki polaznici zaraženi, a mogli su zaraziti i druge. Ako će se slični događaji uskoro ponovo otvoriti, važno je znati koliko je velik ovaj rizik.

Testiranje i statistika pomogli su nam da to saznamo. Svaki je polaznik testirao bočni protok u 36 sati prije događaja. Zatim su zamoljeni da urade drugu vrstu testa (PCR test, koristeći komplet kod kuće koji se šalje u laboratorij na analizu) i na dan događaja i pet dana kasnije.

Testovi bočnog protoka su jednostavni. Oni brzo daju odgovor da ili ne na to ima li netko COVID-19, djelujući poput testa za trudnoću.

Korišteni PCR testovi bili su malo sofisticiraniji. Pokazali su ne samo jesu li ljudi pozitivni, već su dali i broj nazvan "prag ciklusa" (Ct) koji odražava količinu koronavirusa na testnom brisu osobe. Što je niži Ct broj, to je veća količina virusa koji netko ima u svom tijelu, pa su stoga i zarazniji. (Negativni PCR rezultati su oni kod kojih je Ct viši od određene razine.)

Određivanje vremena zaraze

Procjena je li događaj siguran, zahtijeva korištenje ovih testova kako bi se utvrdilo koliko je ljudi uhvatilo virus na događaju ili oko njega. Da biste to učinili, prvo upotrijebite naknadne testove da biste otkrili tko prenosi infekciju nedugo nakon toga. Zatim procijenite kada je bilo koja osoba pozitivna na test uhvatila virus: prije, tijekom ili nakon događaja.

Da biste zaključili kada je virus pokupljen, morate razumjeti dinamiku infekcije COVID-19. Ovo su prilično jednostavne. Unutar tijela, COVID-19 ima dvije različite faze: eksponencijalni porast količine prisutnog virusa kako on uzima maha (s time da se Ct smanjuje) i eksponencijalni pad dok osoba baca virus (s povećanjem Ct).

Koristeći postojeće podatke i analizu mnogih prethodnih infekcija, možemo doći do prosječne putanje infekcije COVID-19. Napisana na grafikonu, količina virusa u tijelu u infekciji prosječne osobe - mjerena Ct brojem - izgleda poput crvene crte u nastavku.

Ako netko vrati pozitivan PCR test nakon događaja, Ct broj iz njegovog testa mogao bi predstavljati jednu od dvije točke u infekciji - jednu kada njihova infekcija raste i jednu kada opada.

Na primjer, na gornjem grafikonu, ako je Ct broj osobe C0, tada je njihov test napravljen ili u točki A u vremenu (na osi X) ili u točki B. Kao što znamo koliko je vremena prošlo između njih koji su prisustvovali događaju i uzimajući njihov PCR test (predstavljen s Δ na grafikonu), možemo gledati unatrag i završiti s dvije procjene njihove razine Ct kada prisustvujemo događaju: CA i CB. To nam također daje dvije procjene koliko su daleko od zaraze, a time i dvije procjene kada su se zarazili.

Ali što je točno? Pa, znamo da je osoba morala obaviti negativni test 36 sati prije događaja da bi prisustvovala. Testovi bočnog protoka mogu biti lažno negativni kada ljudi imaju male količine virusa u tijelu, ali je mnogo manja vjerojatnost da će dati lažno negativne rezultate kada netko ima veliko virusno opterećenje.

Dakle, ako jedna od dvije moguće razine infekcije u vrijeme događaja - CA i CB - ukazuje na veliko virusno opterećenje, ali druga ne, slučaj visokog virusnog opterećenja vjerojatno može biti odbačen. Zapravo, možemo koristiti povijesne podatke o točnosti testova bočnog protoka kako bismo utvrdili vjerojatnost testa koji vraća negativan rezultat kada je Ct broj bio svaki od CA i CB, i pomoću toga nam reći koja od dvije procjene za kada vjerojatnije su se zarazili.

To znači da za svaku osobu koja ima pozitivan test na PCR testu nakon događaja imamo najbolje procijenjeno vrijeme kada je uhvatila COVID-19. Za one kojima je procijenjeno vrijeme zaraze prije događaja, pretpostavljamo da su virus pokupili negdje drugdje neposredno prije, te da njihov test bočnog protoka nije uspio identificirati njihovu infekciju - vjerojatno zato što su rano zaraženi, pa su i dalje imali samo nizak nivo količine virusa u njihovom tijelu. Također možemo procijeniti kada je njihovo virusno opterećenje doseglo vrhunac, a time i koliko su bili zaraženi tim događajem.

A za one čije se vrijeme zaraze čini vrlo kratkim ili nakon događaja, možemo pretpostaviti da su zaraženi dok su sudjelovali. Zatim možemo usporediti ove dvije skupine - zarazne i zaražene - da vidimo koliko se prijenosa dogodilo i koliko je događaj bio rizičan.

Ugodno je što smo, koristeći ove tehnike, otkrili da događaji u Liverpoolu nisu utjecali na širenje COVID-19 na području Liverpoola. No promatrajući jesu li ti događaji sigurni, informirali smo samo kreatore politike. Imali su nezavidan zadatak procijeniti je li utvrđeni rizik dovoljno nizak da nas vrati u život kakav smo nekada znali.