Omikron: T-rakkude roll

8eb4513b44bf68c6bcb46ebd83a95d1b - January 23, 2022Kirjutas Timothy Huzar jaanuaril 10, 2022- Fakt uuritud autor Ferdinand Lali, Ph D.Kahe T-raku kokkupõrke kujutamine

  • Lisaks antikehadele on T-rakud immuunsüsteemi tagasisides viiruse vastu võtmetähtsusega.
  • SARS-CoV-2 Omicroni alternatiivil on palju kõrvalekaldeid, mis viitab sellele, et see võib antikehade tagasisidest pääseda.
  • Siiski soovitab siin ja praegu uurimus, et T-rakud peavad siiski kasutama turvalisust võrreldes variatsiooniga.

Uhiuues uurimistöös leidsid teadlased tegelikult tõendeid selle kohta, et T-rakud peavad kasutama turvalisust võrreldes SARS-CoV-2 Omicroni alternatiiviga.

Uuring, mis ilmub ajakirjas Viruses, loob aluse täienduskursustele, et otsinguid kinnitada.

T-rakud

T-rakud täidavad keha immuunsüsteemis mitmeid ülesandeid. Prof Rosemary Boyton Ühendkuningriigi Imperial College Londoni nakkushaiguste osakonna arstiteaduskonnast arutleb:

"T-rakud võivad mängida erinevaid rolle. Nad võivad toimida "tapjarakkudena", rünnates rakke, mis on nakatunud viirusega või muud tüüpi patogeeniga, või võivad toimida "abirakkudena", toetades B-rakkudel antikehade tootmist.

Prof Florian Kern, Brightoni ja Ühendkuningriigi Sussexi meditsiinikooli immunoloogia õppetooli juhataja, rääkis ajakirjaga "Detonic.shop". Ta kirjeldas, et T-rakud teevad seda, tuvastades terved valgutükid, mis koosnevad lühikestest aminohapete ahelatest, mida nimetatakse ka peptiidideks. Prof Kern ei olnud seotud siin ja praegu uurimistööga.

Lisaks nõuavad T-rakud, et peptiidid oleksid seotud spetsiaalsete rakupinna tervete valkudega, mida nimetatakse MHC osakesteks.

"Vaktsineeritud või COVID-19 anamneesiga inimestel reageerivad mälu T-rakud kiiresti, kui nad kohtavad uuesti samu viiruspeptiide, mis on seotud samade MHC molekulidega."

"Kuid kui peptiide, mille nad algselt ära tundsid, pole mutatsioonide tagajärjel viiruses enam olemas, võivad need mälu-T-rakud kaotada oma eesmärgi. See sõltub sellest, kas nad suudavad muteerunud peptiide siiski ära tunda,“ väitis prof Kern.

SARS-CoV-2 Omicroni alternatiivil on palju kõrvalekaldeid, mis teadlaste arvates aitavad sellel põgeneda, vähendades antikehade mõju.

Kui aga Omicron ei suuda T-rakke ära joosta, võib neil pärast seda siiski olla teatud turvalisus võrreldes variatsiooniga.

Viiruslikud tükid

Et mõista, kas Omicron suudab T-rakkude tagasisidet ära hoida, hindasid teadlased 1,500 SARS-CoV-2 epitoopi – omamoodi viiruse tükki.

"Autorid laadisid tõhusalt alla tunnustatud SARS-CoV-2 peptiidide loendi avalikust hoidlast ja joondasid need Omicroni variandi muteeritud valgu aminohappejärjestusega."

"See võimaldas neil täpselt tuvastada, millised varasemates viirusevariantides äratuntud peptiidid ei eksisteerinud enam täpselt sama järjestusega Omicroni variandis," väitis prof Kern.

Ühendkuningriigi Londoni Metropolitani ülikooli molekulaarse immunoloogia õppejõud, professor Gary McLean, mis ei olnud uurimistööga seotud, väitis MNT-le, et üksikisiku T-rakkude resistentsus Omicroni variatsiooni suhtes peab siiski kasutama teatud turvalisust:

"See on bioinformaatikapõhine uuring, milles vaadeldakse SARS-CoV-2 Omicroni variandis leitud T-rakkude epitoope. See tuvastab, et suurem osa ennustatud Omicroni T-raku epitoopidest ei ole selles variandis muutunud, mis viitab sellele, et vaktsineerimisest või looduslikust infektsioonist tulenev T-raku immuunsus Omicroni suhtes ei tohiks liiga palju mõjutada.

Professor Kern nõustus. "Autorid allutasid Omicronis leitud asjakohased muudetud peptiidijärjestused mitmetele arvutialgoritmidele, mis ennustavad hästi, kas teatud peptiidid võivad seostuda teatud MHC molekulidega. Nad leidsid, et ainult mõned neist peptiididest olid tõenäoliselt kaotanud võime seonduda samade MHC molekulidega nagu nende muteerimata eelkäijad.

"See andis neile kindlustunde, et enamikku peptiididest, mis on olulised T-rakkude vastuseks SARS-CoV-2-le, ei mõjutanud Omicronis leitud mutatsioonid ja need seostuvad endiselt MHC molekulidega, millega mutatsioonita järjestused seostuvad. .”

– Prof Florian Kern

Prof McLean pidas silmas, et „[uuringu] piirang seisneb selles, et järeldusi toetavad bioloogilised uuringud puuduvad. Sel põhjusel on uuringutulemused mõnevõrra esialgsed.

"Samal ajal pole üllatav, et T-raku epitoobid on selles variandis vähem mõjutatud. Seda nähtust esineb teadaolevalt ka teiste inimese hingamisteede viiruste puhul ja see annab märku, et T-rakuline immuunsus SARS-CoV-2 suhtes, kui see on loodud, on potentsiaalselt ulatuslikum ja [võib olla] olulisem kui antikehad.

"Kuigi antikehad on SARS-CoV-2 neutraliseerimisel tõhusad, põhjustavad uute variantide spike-valgu mutatsioonid sageli juba olemasolevate antikehade vähenenud võimet seda teha."

"Need andmed võivad viidata sellele, et T-rakuline immuunsus kaitseb rohkem kui antikehad Omicroni põhjustatud raskete haiguste vastu, toetades mõningaid hiljutisi kliinilisi leide," soovitas prof McLean.

Prof Matthew McKay, Austraalia Melbourne'i ülikooli uurimistöö kaaskirjanik, ütleb: "Vaatamata sellele, et tegemist on esialgse uuringuga, usume, et see on positiivne uudis."

"Isegi kui Omicron - või mõni muu variant - võib potentsiaalselt antikehadest pääseda, võib siiski eeldada, et tugev T-raku vastus pakub kaitset ja aitab vältida olulisi haigusi."

T-rakkude vältimine

Dr Ahmed Abdul Quadeer, Hongkongi Teadus- ja Tehnoloogiaülikooli elektroonika- ja arvutitehnika osakonna uurimistöö kaasautor, väitis MNT-ga vesteldes, et ei pruugi olla tõenäoline, et variatsioon võib tekkida. tekivad, mis kindlasti pääseksid indiviidi T-raku immuunsüsteemi tagasisidest.

"T-raku vastuste vältimine võib olla suhteliselt keeruline. Selle põhjuseks on asjaolu, et erinevalt neutraliseerivatest antikehadest, mis tunnevad ära peamiselt SARS-CoV-2 teraviku (pinna) valgu, tunnevad T-rakud ära fragmente viiruse mitmest valgust.

"Seega on [SARS-CoV-2] infektsiooni poolt indutseeritud T-rakud üsna heterogeensed. Isegi spike-valgus, mis on mitme COVID-19 vaktsiini peamine sihtantigeen, on uuringud näidanud, et iga indiviidi sihtmärgiks on mitu epitoopi.

"Selleks, et vältida nii laiaulatuslikku immuunvastust, peaks viirus tegema oluliselt rohkem mutatsioone kui see, mida oleme seni näinud, mis ei pruugi olla viiruse jaoks elujõuline," väitis dr Quadeer.

Prof McLean nõustus. "Üldiselt on vähem tõenäoline, et tekivad T-rakulise immuunsuse eest põgenevad variandid, kuna T-raku epitoobid on sageli väiksema surve all muutuda, erinevalt antikehade epitoopidest, mis kipuvad koonduma teraviku pinnaaladele, millel on kriitiline funktsioon viiruse sisenemine rakkudesse."

"T-rakud otsivad ja hävitavad viirusega nakatunud rakke, sihivad naelu erinevaid osi võrreldes [antikehadega], taludes seeläbi uutes variantides leitud mutatsioone."

Looduslik infektsioon või inokulatsioon?

Dr Quadeer väitis, et T-rakud kasutaksid tõenäoliselt turvalisust olenemata sellest, kas need loodi nakatamise või täiesti loomuliku infektsiooni järgi – selle kinnitamiseks on siiski vaja rohkem uuringuid.

"On näidatud, et nii looduslikud infektsioonid kui ka COVID-19 vaktsiinid tekitavad tugeva T-rakulise vastuse. Loodusliku infektsiooni ja vaktsiinide poolt esile kutsutud T-raku vastuste spetsiifiliste erinevuste ja sarnasuste kohta on siiski palju mõista. Seda uuritakse praegu aktiivselt.

"COVID-19 vaktsiinide koostise põhjal on nende kahe vastuse vahel mõned ilmsed erinevused."

"Nõugetele keskendunud vaktsiinide puhul on näidatud, et T-raku vastused tunnevad ära mitu piigivalgu epitoopi. Täisviirusega inaktiveeritud vaktsiinide puhul, kuigi kirjandust on suhteliselt vähe, on näidatud, et T-raku vastused sihivad lisaks piigivalgule ka muid struktuurseid valke, nagu nukleokapsiid ja membraanivalgud.

"[SARS-CoV-2] nakkuse korral on paljude eksperimentaalsete uuringute käigus leitud, et T-rakud sihivad viiruse mitme valgu fragmente, kasutades verd erinevatest geograafilistest piirkondadest – ülevaate saamiseks vaadake meie eelmist tööd. .”

"Vaktsiinide poolt esile kutsutud T-raku vastuste ja loodusliku infektsiooni sarnasusi on näidanud ka uued uuringud. Näiteks on mõned uuringud teatanud, et sarnased fragmendid on suunatud nii [SARS-CoV-2] infektsiooni kui ka vaktsiinide poolt esile kutsutud T-rakkudele,“ kirjeldas dr Quadeer.