Suur genoomianalüüs toob esile COVID-19 riskifaktorid

SARS-CoV-2, COVID-19

2020. aasta märtsis liitusid sajad teadlased üle kogu maailma, et vastata hoogsale ja ka keerulisele järelepärimisele: millised pärilikud tegurid mõjutavad seda, miks mõned COVID-19 kliendid tekitavad äärmuslikke, surmavaid seisundeid, mis vajavad haiglas viibimist, teised aga saavad mõõdukate märkidega üle ja sümptomid või mitte mingil viisil?

Nende tänaste otsingute üksikasjalik kokkuvõte, avaldatud aastal loodus, avaldab 13 lookust ehk piirkonda inimese genoomis, mis on väga seotud nakkuse või äärmusliku COVID-19-ga. Teadlased määrasid lisaks põhjuslikud tegurid, nagu sigarettide suitsetamine ja ka kõrge kehamassiindeks. Need tulemused pärinevad suurimatest kogu genoomi hõlmavatest organisatsiooniuuringutest, mida on kunagi varem tehtud, hõlmates peaaegu 50,000 19 klienti COVID-2 ja ka XNUMX miljonit puhast kontrolli.

Selle otsimine võib anda eesmärgid edaspidiseks raviks ja rõhutada ka pärilike uuringute jõudu ülekantava seisundi kohta lisateabe saamiseks.

Selle ülemaailmse algatuse, mida nimetatakse COVID-19 Host Genomics Initiative'iks, käivitasid 2020. aasta märtsis Helsingi ülikooli Soome molekulaarse meditsiini instituudi (FIMM) meeskonnajuht Andrea Ganna, samuti FIMMi juhendaja ja instituudis osaleja Mark Daly MITi laiaulatuslikus instituudis ja ka Harvardis. Kampaania on tegelikult laienenud üheks kõige olulisemaks partnerluseks inimgeenides ja koosneb ka praegu enam kui 3,300 kirjanikust ning 61 uurimusest 25 riigilt.

Meditsiini- ja rahvastikugeneetika programmi kaasdirektor ja ka uuringu kaasautor Ben Neale ütles, et kuigi vaktsineerimised pakuvad kaitset versus infektsioon, on COVID-19 teraapias siiski palju ruumi renoveerimiseks, mida saab päriliku analüüsi teel teavitada. Ta lisas, et ravimeetodite täiustamine võib muuta pandeemia - mis on tegelikult nõudnud suuri sulgemisi suures osas maakerast - kohalikule saarele, mis on palju kohalik ja eksisteerib ka vähese, kuid regulaarselt kraadi elanikkonnas, nagu ka gripp.

"Mida paremini suudame ravida COVID-19, seda paremini on meditsiiniringkondadel võimalik haigusega toime tulla," märkis ta. "Kui meil oleks nakkuse ravimise ja kellegi haiglast välja toomise mehhanism, muudaks see radikaalselt meie rahvatervise vastust."

Rakenduste mitmekesisus

Analüüsi tegemiseks ühendas konsortsium meditsiinilise ja päriliku teabe peaaegu 50,000 2 kliendilt, kes uurisid uuringut, mis leidis nakkuse soodsust, samuti 23 miljonit kontrolli arvukates biopankades, meditsiiniuuringutes ja ka otse tarbijatele pärilikus ettevõttes, näiteks kui XNUMXandMe. Kogu maailmast kogutava teabe suure hulga tõttu oli teadlastel võimalus luua statistiliselt vastupidavaid hinnanguid veelgi kiiremini ja ka parema hulga populatsioonide hulgast, kui ükski meeskond suudab enda oma kanda.

Rühma poolt seni kindlaksmääratud 13 lookusest oli kahel Ida-Aasia või Lõuna-Aasia päritolu klientide seas rohkem seaduspärasusi kui Euroopa päritolu klientidel, mis tõi esile mitmekesisuse olulisuse pärilikes andmekogumites.

"Oleme geneetilise mitmekesisuse proovide võtmisel olnud palju edukamad kui varasemad jõupingutused, sest oleme teinud ühiseid jõupingutusi, et jõuda kogu maailma elanikkonnani," märkis Daly. "Ma arvan, et meil on veel pikk tee minna, kuid me teeb väga häid edusamme. "

Rühm tõi nende 2 lookuse seast välja konkreetselt FOXP4 geneetika lähedal, mis on seotud kopsuvähirakkudega. FOXP4 versioon, mis on seotud äärmusliku COVID-19-ga, tõstab geneetika väljendust, soovitades, et geneetika takistamine võib olla tulevane tervendamismeetod. Teised äärmusliku COVID-19-ga seotud lookused koosnesid DPP9-st, geneetikast, mida seostatakse lisaks kopsuvähirakkudega ja ka kopsufibroosiga, ning ka TYK2-st, mis on seotud mõne autoimmuunhaigusega.

Lisaks FIMMis töötav ja uuringu juhtivekspert Mari Niemi kinnitab, et konsortsium keskendus interaktsioonile, kuna teadlased hindasid teavet ja avaldasid oma veebisaidil tulemusi kohe pärast seda, kui nende täpsust oli otsitud. Rühm soovib, et nende tulemused võiksid suunata vahendid uuesti kasutatavate ravimite kasulikele sihtmärkidele.

Teadlased jäävad kindlasti uurima veelgi rohkem teavet, kuna need on leitavad ja täiendavad oma tulemusi ka jaotisega „Tekivad küsimused“ aadressilloodus Kindlasti hakkavad nad uurima, mis eristab kaugvedajaid või kliente, kelle COVID-19 tunnused ja sümptomid kestavad kuid, kuid jäävad ka nakkuse ja äärmuslike seisunditega seotud lookuste tuvastamiseks.

"Tahaksime seada eesmärgiks saada järgmisel aastal hea käputäis väga konkreetseid terapeutilisi hüpoteese," märkis Daly. „Realistlikult käsitleme COVID-19 tõenäoliselt pikka aega tõsise terviseprobleemina. Kõigil sellel aastal tekkivatel ravimitel, näiteks olemasoleva ravimi ümberpaigutamisel, tuginedes selgetele geneetilistele teadmistele, oleks suur mõju. "

Geenide jaoks täiesti uus ala

Ganna rõhutas, et teadlastel oli võimalus kollektiivsete algatuste, andmete jagamise loomuliku vaimu ja ka avatuse tulemusena avastada püsivaid pärilikke signaale ning kogu maailma mõistmise hulka kuuluv tõsidus tabab täpselt sama riski täpselt sama aeg. Ta lisas, et geneetikud, kes tegelevad regulaarselt suurte andmekogudega, on tegelikult avatud koostöö eeliseid mõistnud juba väga pikka aega. "See illustreerib ainult seda, kui palju parem teadus on - kui palju kiiremini see läheb ja kui palju rohkem avastame -, kui me koostööd teeme," nentis Ganna.

Daly on oma komponendi jaoks vaimustuses sellest, kui selged ja ka tõlgendatavad on nende tulemused geneetikute jaoks tegelikult olnud. Ta kinnitab, et selle töö arusaamad on tegelikult olnud erilised ja võib-olla ka paradigma muutused inimese geenide valdkonnas, mida tegelikult on kontrollitud tavapäraste püsivate haiguste, ebatavaliste pärilike haiguste ja ka vähirakkude uurimisega.

"Need avastused on olnud tõesti informatiivsed ja see on pannud meid mõistma, et nakkushaiguste ravimeetodite mõistmiseks ja potentsiaalseks väljatöötamiseks on geneetika kasutamisel palju kasutamata potentsiaali," märkis Daly. "Loodan, et see annab eeskuju, kuidas saaksime populatsioonigeneetilisi lähenemisviise tuua uutele probleemidele, mis on eriti olulised maailma arengumaades."