SARS-CoV-2 variatsioonide ebapiisav järjestamine piirab kogu maailmas toimet COVID-19-le

SARS-CoV-2, COVID-19

USA ja ka paljude teiste riikide SARS-CoV-2 variatsioonide sekveneerimise puudumine seab ohtu ülemaailmse tegevuse COVID-19 pandeemia vastu, ütles Case Western Reserve'i ülikooli Dana Crawford uhiuues vaatepunktis, mis avaldati 15. juulil ajakiri PLOSGeneetika

Järelevalve on vajalik haiguse episoodide tõhusaks ja kiireks tegutsemiseks, kuid rahvatervise ja heaolu turvalisus on üldiselt keskendunud olukorra, haiglas viibimise ja ka surmajuhtumite jälgimisele. Genoomide järjestamise edusammud võimaldavad meil praegu jälgida pärilikku varianti infektsioonide tekkimisel võrreldamatu teabe alusel. Hoolimata sekveneerimiskavast paljudes riikides, on genoomika edendamine SARS-CoV-2 nakkuse uurimise tehnikana, mis loob COVID-19, olnud tegelikult aeglaselt liikuv, väljakutsuv ja ka ebaregulaarne. Crawford mainib, et alates aprilli 2021. aasta algusest oli USA alternatiivse turvalisuse tagamiseks SARS-CoV-33 sekveneerimises kogu maailmas 2. kohal. Ta väidab, et traditsiooniliselt ei ole haiguste tõrje ja ennetamise keskused (CDC) keskendunud rahvatervise ja heaolu genoomilisele uurimisele ning ka see eelsoodumus on tegelikult loonud meie teadmiste avatud reaalajas arengu avatud ava. SARS-CoV-2 ja ka mõju haiguse levikule ning ka tõsidusele.

Crawford nimetab kehvade järjestamisalgatuste põhjusteks ebapiisavat rahastamist, tõhusa näidisradari puudumist, samuti ranget eeskuju ja teabe jagamist. Sellegipoolest on mitmed teised rahvad, näiteks Hiina ja ka Ühendkuningriik, need raskused tegelikult tõhusalt vallutanud. CDC eraldas hiljuti järjestamise parandamiseks rohkem kui 200 miljonit dollarit, kuid Crawford mainib, et see hiline finantsinvesteering näitab, et USA-l pole COVID-19 uuringute jaoks korraldatud üksikute andmete üksikasju. Ta hoiatab, et rahalised investeeringud SARS-CoV-2 genoomikasse peavad jätkuma ja laienema, kuna külvihindade ebakorrapärasuse ja kogu maailmas COVID-19 ohutusmeetmetest kinnipidamise tagajärjel tekivad tõenäoliselt täiesti uued variatsioonid.

Arvestades, et SARS-CoV-2 on ainulaadne zoonootiline haigus ilma inimeste varasemate nakkusteta, ütleb Crawford, et järjestamine ja ka hindamine on olulised nii puhkemise trajektoori kui ka selle arengu mõistmiseks. Samuti on hädasti vaja sätteid päriliku teabe ühendamiseks professionaalsete ja ka epidemioloogiliste teabeallikatega rahvatervise ja heaolu uurimiseks. Lõpuks kirjeldab ta, et pidevad globaalsed sekveneerimisalgatused on endiselt vajalikud selle pidevalt areneva nakkuse tuvastamiseks ja sellele reageerimiseks, mis ei mõista globaalseid piire.

"COVID-19 kontroll nõuab peaaegu reaalajas peremees-patogeeni genoomseid ja rahvatervise andmeid, et jälgida, kuidas SARS-CoV-2 on arenenud ja kuidas see evolutsioon mõjutab edasikandumist ja haiguse tõsidust," sisaldab Crawford. "USA ja ülemaailmsed sekveneerimispüüdlused on olnud liiga vähe ja liiga lahus, rõhutades vajadust tegeleda inimese genoomikaga ja integreerida selle tehnoloogiad rahvatervise nakkushaiguste tekkimisel."