Soolestiku mikrobiomi muutused imikute pikisuunalises uuringus eelnesid tsöliaakia tekkele

soolestiku mikrobiome

Rakendades tsöliaakia arengule pikaajalist ja perspektiivset lähenemisviisi, on teadlaste koostöögrupp tuvastanud olulised mikroobsed muutused riskirühma kuuluvate imikute soolestikus enne haiguse tekkimist. Kasutades arenenud genoomse järjestuse tehnikaid, paljastasid MassGeneral Hospital for Children (MGHfC) teadlased koos kolleegidega Itaalia institutsioonidest ja Marylandi ülikooli College Parkist kolleegiat põdevatel lastel mitmete liikide, radade ja metaboliitide korral erinevad prekliinilised muutused võrreldes riskilapsed, kellel ei tekkinud tsöliaakiat.

Uuringu MGHfC tsöliaakia, genoomi, mikrobioomi ja metabooloomia (CDGEMM) raames tuvastasid teadlased imikute soolestiku mikrobioomides (mikroorganismide kogum) ja metaboloomides (rakkude ja kudede molekulaarsed komponendid) muutused, mis toimusid kuid enne tsöliaakia tekkimist. Muudatused hõlmavad "põletikueelsete liikide suurenenud arvukust ning kaitsvate ja põletikuvastaste liikide arvukuse vähenemist haiguse algusele eelnenud erinevatel ajahetkedel", vastavalt rühma artiklis Proceedings of the National Academy of Sciences.

"Selles ideekontrolli uuringus võrdlesime tsöliaakia väljakujunenud 10 imiku soolestiku mikrobioomi kümne imiku soolestiku mikrobioomiga, kellel ei tekkinud autoimmuunset seisundit," ütleb MD Maureen Leonard, juhtiv autor ja MGHfC tsöliaakia uuringute ja ravi keskuse kliiniline direktor. „Leidsime olulisi muutusi soolestiku mikroobides, radades ja metaboliitides juba 10 kuud enne haiguse algust. See oli palju varem, kui me ootasime, ”lisab Leonard.

CDGEMMis uurivad Itaalia, Hispaania ja USA teadlased 500 geneetiliselt ohustatud imikut alates sünnist kuni kümne eluaastani, võimaldades neil jälgida tsöliaakia tekkimist soolestiku mikrobiootas. CDGEMM-i teadlased on alates 2014. aastast kogunud iga osaleja kohta ulatuslikke vere- ja fekaaliproove ning mahukaid keskkonnateavet. Selles uuringus kasutasid teadlased metagenoomilist analüüsi, mis võimaldas neil seostada mikroobide koostist funktsiooniga, tuues esile muutused radades, mis on seotud kas suurenenud põletikuliste protsesside või vähenenud põletik. "See uuring näitab järgmise põlvkonna sekveneerimise võimet koos bioinformaatikaga nende oluliste muutuste avastamiseks," ütleb kaasautor Rita Colwell, Marylandi ülikooli täiustatud arvutiuuringute instituudi College Parkist.

"Me vajasime nende riskirühma kuuluvate väikelaste pikisuunalist, sündide ja kohordi uuringut, et viia mikrobioomiuuringud assotsiatiivsete vaatluste juurest põhjuslikumate uuringute juurde," ütleb vanemautor Alessio Fasano, MD, MGHfC tsöliaakia uuringute ja ravi keskuse direktor. "See lähenemisviis aitab meil välja töötada uudsed strateegiad mitmesuguste seisundite diagnoosimiseks ja raviks, milles mikrobiom võib mängida patogeenset rolli," lisab Fasano.

Ta soovitab, et kui suuremad andmekogumid seda kinnitavad, võivad need leiud esindada konkreetseid terapeutilisi sihtmärke haiguse kinnipidamiseks ja tsöliaakia tekkimise võimalikuks ennetamiseks prekliinilises faasis mikrobioomi manipuleerimise teel. "Nende järeldustega prognoosime, et suudame eristada, kes jääb terveks ja kellel tekib tsöliaakia juba mitu kuud enne haiguse algust," lisab Fasano.