Οι δοκιμές γονιδιωματικών λυμάτων μπορούν να παρακολουθούν αποτελεσματικά τις παραλλαγές ανησυχίας COVID-19

Η έρευνα δείχνει ότι οι γονιδιωματικοί έλεγχοι λυμάτων μπορούν να παρακολουθούν αποτελεσματικά τις παραλλαγές ανησυχίας COVID-19 σε μια περιοχή

Ο έλεγχος των λυμάτων μπορεί να αναγνωρίσει με ακρίβεια και επίσης γρήγορα τους βαθμούς μολύνσεων COVID-19 στην περιοχή, οι οποίοι συνίστανται στην αύξηση των παραλλαγών που προκαλούν ανησυχία, συνιστά μια νέα ερευνητική μελέτη με επικεφαλής τον καθηγητή του UBC, Δρ Ryan Ziels.

Ο Ziels και οι συνεργάτες του αξιολόγησαν παραδείγματα αποχέτευσης από 5 μητροπολιτικές εγκαταστάσεις λυμάτων στην περιοχή Metro Vancouver καθ 'όλη τη διάρκεια των αυξημένων μετρήσεων COVID-19, από τον Φεβρουάριο έως τον Απρίλιο του 2021.

Τα αποτελέσματα, που εξηγούνται στο διαδίκτυο σε προεκτύπωση στο medrxiv, αποκάλυψαν ότι η ιική εστίαση στα λύματα που συσσωρεύτηκε από την περιοχή του Βανκούβερ παρακολούθησε προσεκτικά τον αριθμό των επαγγελματικών καταστάσεων στην περιοχή.

Οι επιστήμονες, που περιελάμβαναν τον μαθητή Ph D. αστικού σχεδιασμού, Xuan Lin, ανακάλυψαν επίσης ότι η κανονικότητα των ανωμαλιών που συνδέεται με παραλλαγές ανησυχίας στα λύματα σχετίζεται πολύ με τα πρότυπα σε επιστημονικά αναγνωρισμένες καταστάσεις στην περιοχή.

Σε αυτό το Q & A, ο Δρ Ziels, ένας επιστήμονας οικολογικού σχεδιασμού που ερευνά τη μικροβιακή οικολογία, μιλά για τις έρευνες της έρευνας της μελέτης - και επίσης πώς ο έλεγχος της γονιδιωματικής των λυμάτων μπορεί να ειδοποιήσει την ασφάλεια των ασθενειών και επίσης τις διοικητικές προσεγγίσεις

Πώς συνδεθήκατε με αυτήν την ερευνητική μελέτη;

Στην πραγματικότητα έχω εξετάσει την αλληλουχία γονιδιωματικών των λυμάτων για αρκετά χρόνια και επίσης όταν η πανδημία υπέστη ζημιά, επέλεξα να χρησιμοποιήσω αυτήν την κατανόηση για να κατανοήσω τη λοίμωξη SARS-CoV-2 σε συνεργασία με διάφορους άλλους επιστήμονες. Η ομάδα μας αποτελείται από οικολογικούς μικροβιολόγους, σχεδιαστές, καθώς και επιδημιολόγους (στο UBC και επίσης BC CDC), και επίσης είχαμε τα προνόμια να συνεργαστούμε με το Metro Vancouver για τη δουλειά μας.

Όπως πολλές άλλες ασθένειες, η λοίμωξη SARS-CoV-2 πέφτει στα κόπρανα καθ 'όλη τη διάρκεια της μόλυνσης, και επίσης ιικά κομμάτια γονιδιώματος μπορούν να βρεθούν στα μητροπολιτικά λύματα.

Το τεράστιο ερώτημα ήταν ακριβώς πώς μπορούμε να ταυτοποιήσουμε αυτά τα κομμάτια γρήγορα και επίσης με ακρίβεια, προκειμένου να προσφέρουμε επιπλέον πληροφορίες απευθείας στη γενική εργαλειοθήκη δημόσιας υγείας και ευεξίας;

Ποιες τεχνικές χρησιμοποιήσατε για να μετρήσετε και επίσης να παρακολουθείτε παραλλαγές που προκαλούν ανησυχία στα λύματα Metro Vancouver;

Είχα προηγουμένως καθιερώσει μια γρήγορη και επίσης ακριβή μέθοδο προσδιορισμού αλληλουχίας χρησιμοποιώντας φορητές συσκευές αλληλουχίας DNA, και επίσης με κάποιες αλλαγές στην ομάδα μου και επίσης χρησιμοποίησα αυτό το σύστημα για να μετρήσω κομμάτια γονιδιώματος κοροναϊού σε παραδείγματα λυμάτων από την περιοχή του Βανκούβερ.

Αυτό που κάνουμε μοιάζει με τη δουλειά του CanCOGeN, του καναδικού δικτύου γονιδιωματικής COVID - μια κοινοπραξία καναδικής κυβέρνησης, αγροτικών και τοπικών αρχών δημόσιας υγείας και ευεξίας, η οποία ακολουθεί περίπου 150,000 ιικά γονιδιώματα σε ολόκληρη την Καναδά. , ακολουθούμε παραδείγματα λυμάτων που συσσωρεύουν εισροές από ολόκληρους πληθυσμούς σε μια περιοχή.

Ποιες ήταν οι ζωτικές αναζητήσεις σας;

Όσον αφορά τη μέτρηση της ποσότητας των κομματιών του γονιδιώματος του κοροναϊού, ανακαλύψαμε λίγο πολύ πρώιμο σήμα σε αντίθεση με τις τροποποιήσεις σε νοσοκομειακές διαμονές ή αριθμούς παρουσίας. Αυτό συνέστησε ότι η δοκιμή λυμάτων μπορεί να προσφέρει κάποιο είδος πολύ πρώιμης προσοχής.

Με την αλληλουχία γονιδιώματος των λυμάτων, μπορούμε να εντοπίσουμε ενισχύσεις σε ανωμαλίες που σχετίζονται με παραλλαγές ανησυχίας, και επίσης προσφέρουμε αυτές τις πληροφορίες στις αρχές υγείας και ευεξίας μας ως πρόσθετη βοήθεια στις προσεγγίσεις δημόσιας υγείας και ευεξίας.

Έχουμε τη δυνατότητα να προσαρμόσουμε την προσέγγισή μας στην αναζήτηση παραλλαγών που προκύπτουν και επίσης να αποκτήσουμε μια εικόνα ολόκληρης της περιοχής σε ένα παράδειγμα. Ο προσδιορισμός αλληλουχίας γονιδιώματος μας έδωσε επίσης τη δυνατότητα να εντοπίσουμε σε ποια αποχέτευση στο Metro Vancouver οι παραλλαγές έφτασαν να είναι εξαιρετικά κορυφαίες.

Η ταχεία αλληλουχία των ιογενών πληροφοριών μας δίνει τη δυνατότητα να προσφέρουμε πραγματικά γρήγορη ανατροπή - προσφέρουμε αρχεία για την αναβάθμιση των κλινικών αστυνομικών υγείας και ευεξίας σε μόλις 3 έως 4 ημέρες από τη συλλογή παραδειγμάτων.

Ποιες είναι οι επιπτώσεις για μελλοντικές δοκιμές πανδημίας και επίσης για χορήγηση;

Υπάρχει μια διευρυμένη ερευνητική μελέτη ότι η δοκιμή λυμάτων μπορεί να χρησιμεύσει στην κατανόηση του βαθμού των μολύνσεων COVID-19 σε περιοχές. Στόχος μας είναι να συμπληρώσουμε, όχι να αλλάξουμε, διάφορες άλλες δοκιμές τεχνικών δημόσιας υγείας. Οι δοκιμές λυμάτων μπορούν να λειτουργήσουν όταν οι επαγγελματικές δοκιμές είναι δύσκολες ή δεν έχουν σε μητροπολιτική γκάμα.

Αποδεχόμαστε επίσης το Καναδικό Δίκτυο Νερού για να αναπτύξουμε μια εθνική ομάδα εργασίας που μοιράζεται κατανόηση σχετικά με την παρακολούθηση των λυμάτων. Ένα τέτοιο πανεθνικό δίκτυο μπορεί να φέρει αξιόπιστες πληροφορίες καθώς προχωρούμε προς την κατεύθυνση του νέου ανοίγματος της οικονομικής μας κατάστασης.