Πώς να κάνετε διαδραστικά σύνολα δεδομένων βιοϊατρικής έρευνας

Πώς να κάνετε τα βιοϊατρικά ερευνητικά δεδομένα ικανά να αλληλεπιδρούν;

Η αρχή της διαλειτουργικότητας καθορίζει την ικανότητα σύνδεσης διαφόρων συστημάτων. Αυτή είναι μια σημαντική δυσκολία στη βιοϊατρική έρευνα, καθώς και συγκεκριμένα, στον τομέα των προσαρμοσμένων φαρμάκων, η οποία βασίζεται κυρίως στη συλλογή καθώς και στην αξιολόγηση αμέτρητων συνόλων Για περιστάσεις, η πανδημία COVID-19 αποκάλυψε πράγματι ότι επίσης όταν η τεχνολογική , εγείρονται νόμιμοι και ειλικρινείς περιορισμοί, οι πληροφορίες εξακολουθούν να είναι δύσκολο να εκτιμηθούν ως αποτέλεσμα σημασιολογικών ασαφειών. Υπό την αιγίδα του ελβετικού εξατομικευμένου δικτύου υγείας (SPHN) καθώς και σε στενή συνεργασία με εκπροσώπους και των 5 ελβετικών διδακτικών νοσοκομείων, καθώς και του eHealth Suisse, μιας ομάδας ερευνητών από το Πανεπιστήμιο της Γενεύης (UNIGE) καθώς και τα Πανεπιστημιακά Νοσοκομεία της Γενεύης (HUG), σε συνεργασία με το SIB Swiss Institute of Bioinformatics καθώς και το Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Λωζάνης (CHUV), έχουν δημιουργήσει πραγματικά την τεχνική για ένα πανεθνικό πλαίσιο που αγκαλιάστηκε από όλα τα ελβετικά διδακτικά νοσοκομεία καθώς και από σχολικά ιδρύματα. Με την πρακτική της στρατηγική, αυτή η τεχνική βασίζεται στην πρόοδο μιας συνηθισμένης σημασιολογικής δομής που δεν στοχεύει να αλλάξει τις υπάρχουσες απαιτήσεις, ωστόσο να τις χρησιμοποιήσει σε συνεργατικά καθώς και ευέλικτα μέσα σύμφωνα με τις απαιτήσεις της έρευνας, καθώς και τους συντρόφους συνεπάγεται. Η εφαρμογή αυτής της τεχνικής, η οποία έχει ήδη ξεκινήσει, σημειώνει μια σημαντική δράση για την προώθηση της έρευνας καθώς και της ανάπτυξης ενός πραγματικά προσαρμοσμένου φαρμάκου στην Ελβετία

Η εξατομικευμένη φαρμακευτική αγωγή βασίζεται στην εκμετάλλευση, καθώς και στην αξιολόγηση τεράστιων όγκων πληροφοριών, είτε γονιδιωματικής, επιδημιολογικής είτε από κλινική απεικόνιση, έως ουσιαστικό ορισμό. Για να μπορέσουμε να το κάνουμε αυτό, η παραπομπή καθώς και η συσσώρευση εξίσου αναμφισβήτητων πληροφοριών είναι υποχρεωτική, επίσης όταν προέρχονται από πραγματικά διάφορους πόρους.

Έχοντας αυτό υπόψη, η ελβετική ομοσπονδιακή κυβέρνηση δημιούργησε το 2017 το Swiss Personalized Health Network (SPHN), μια εκστρατεία που τέθηκε υπό τη διεύθυνση της Ελβετικής Ακαδημίας Ιατρικών Επιστημών σε συνεργασία με το SIB Swiss Institute of Bioinformatics που σκοπεύει να διαφημίσει τη χρήση ως καθώς και ανταλλαγή πληροφοριών ευεξίας για την έρευνα «Παρά τις σημαντικές επενδύσεις κατά την τελευταία δεκαετία, εξακολουθούν να υπάρχουν σημαντικές ανισότητες», ισχυρίζεται ο Christian Lovis, επιβλέπων του Τμήματος Ακτινολογίας και Ιατρικής Πληροφορικής στην Ιατρική Σχολή της UNIGE, καθώς και επικεφαλής της Τομέας Ιατρικών Επιστημών Πληροφοριών στο HUG. «Γι 'αυτό θέλαμε, με τους συνεργάτες μας και το SPHN, να προτείνουμε μια στρατηγική και κοινά πρότυπα που να είναι αρκετά ευέλικτα για να φιλοξενήσουν κάθε είδους τρέχουσες και μελλοντικές βάσεις δεδομένων.»

Μια τεχνική τριών πυλώνων

Συνδέουμε 3 βασικές απαιτήσεις: τον ορισμό που προσφέρουμε σε σημεία, καθώς πρέπει να διευθετήσουμε τη συνήθη βάση για να κατανοούμε ο ένας τον άλλον. μια τεχνολογική απαίτηση - ο θόρυβος, με τον οποίο μιλάμε. καθώς και τελικά, η εταιρεία του ορισμού, καθώς και ο θόρυβος με προτάσεις καθώς και η γραμματική για να πλαισιώσουν την αλληλεπίδραση με ένα κατανοητό μέσο. «Όσον αφορά τα δεδομένα, είναι το ίδιο πράγμα, εξηγεί ο Christophe Gaudet-Blavignac, ερευνητής στην ομάδα με επικεφαλής τον Christian Lovis. Πρέπει να συμφωνήσετε για ένα σημασιολογικό, για να εκπροσωπήσετε εννοιολογικά αυτό που πρέπει να κοινοποιηθεί. Τότε χρειαζόμαστε μια σύνθετη γλώσσα για να συνδυάσουμε αυτές τις έννοιες με όλη την ελευθερία που απαιτείται για να εκφράσουμε ό, τι χρειάζεται να εκφραστεί. Και τέλος, ανάλογα με τα έργα και τις ερευνητικές κοινότητες που εμπλέκονται, αυτό θα «μεταφραστεί» όπως απαιτείται σε μοντέλα δεδομένων, τα οποία είναι τόσο πολυάριθμα όσο οι γλώσσες που ομιλούνται στον κόσμο.

«Στόχος μας λοιπόν ήταν να ενοποιήσουμε τα λεξιλόγια έτσι ώστε να μπορούν να μεταδοθούν σε οποιαδήποτε γραμματική, αντί να δημιουργήσουμε ένα νέο λεξιλόγιο από το μηδέν που όλοι θα έπρεπε να μάθουν εκ νέου», ισχυρίζεται ο Χριστιανός Λόβις «Υπό αυτή την έννοια, ο ελβετικός φεντεραλισμός είναι τεράστιο πλεονέκτημα : μας ανάγκασε να φανταστούμε μια αποκεντρωμένη στρατηγική, η οποία μπορεί να εφαρμοστεί παντού. Ο περιορισμός, επομένως, δημιούργησε την ευκαιρία να αναπτυχθεί ένα σύστημα που λειτουργεί παρά τις τοπικές γλώσσες, πολιτισμούς και κανονισμούς. " Αυτό καθιστά εφικτή τη χρήση συγκεκριμένων εκδόσεων πληροφοριών για την τελευταία ενέργεια που πρέπει να προσαρμοστεί στα στυλ που απαιτούνται από μια συγκεκριμένη εργασία - τη διάταξη Food and καθώς και Drug Administration (FDA) όταν πρόκειται για συνεργασία με μια αμερικανική ομάδα, ως παράδειγμα, ή οποιοδήποτε είδος διαφόρων άλλων συγκεκριμένων διατάξεων που χρησιμοποιούνται από ένα συγκεκριμένο έθνος ή μια ερευνητική εκστρατεία. Αυτό περιλαμβάνει μια εγγύηση καλής κατανόησης καθώς και μια τεράστια εξοικονόμηση χρόνου.

Καμία επίδραση στην υπεράσπιση των πληροφοριών

Ωστόσο, η διαλειτουργικότητα πληροφοριών δεν συνεπάγεται μεθοδική ανταλλαγή πληροφοριών. «Ο τραπεζικός κόσμος, για παράδειγμα, έχει από καιρό υιοθετήσει παγκόσμια πρότυπα διαλειτουργικότητας, τονίζει ο Christophe Gaudet-Blavignac. Ένα απλό IBAN μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη μεταφορά χρημάτων από οποιονδήποτε λογαριασμό σε οποιονδήποτε άλλο. Ωστόσο, αυτό δεν σημαίνει ότι οποιοσδήποτε, είτε είναι ιδιώτες, ιδιωτικοί οργανισμοί ή κυβερνήσεις, μπορεί να γνωρίζει τι υπάρχει σε αυτούς τους λογαριασμούς χωρίς αυστηρό νομικό πλαίσιο. " Πράγματι, πρέπει να γίνει μια διαφορά μεταξύ των εργαλείων που παράγουν διαλειτουργικότητα καθώς και της εφαρμογής τους, από τη μία πλευρά, καθώς και της ρυθμιστικής δομής που ρυθμίζει την ευκολία πρόσβασης, από την άλλη πλευρά.

Εφαρμογή στρατηγικής

Αυτή η τεχνική έχει πράγματι εφαρμοστεί βήμα-βήμα στην Ελβετία, λαμβάνοντας υπόψη ότι το κέντρο του 2019, στη δομή του SWW εξατομικευμένου δικτύου υγείας «Ελβετικά πανεπιστημιακά νοσοκομεία ακολουθούν ήδη την προτεινόμενη στρατηγική για κοινή χρήση διαλειτουργικών δεδομένων για όλα τα πολυκεντρικά ερευνητικά έργα που χρηματοδοτούνται από το Η πρωτοβουλία SPHN », καταγράφει η Katrin Crameri, επίβλεψη της Εξατομικευμένης Ομάδας Πληροφορικής για την Υγεία στο SIB, υπόλογη στο Κέντρο Συντονισμού SPHNData. Επιπλέον, ορισμένες ιατρικές εγκαταστάσεις αρχίζουν να εκτελούν αυτήν την τεχνική μετά την εκστρατεία SPHN.