Genomische Tests in Abwasser können besorgniserregende COVID-19-Varianten effektiv nachverfolgen

Untersuchungen zeigen, dass genomische Abwassertests besorgniserregende COVID-19-Varianten innerhalb einer Region effektiv nachverfolgen können

Abwassertests können präzise und auch schnell COVID-19-Infektionsgrade in der Region erkennen, die aus der Zunahme besorgniserregender Varianten bestehen, empfiehlt eine brandneue Forschungsstudie unter der Leitung von UBC-Lehrer Dr.

Ziels und auch seine Mitarbeiter werteten Kanalbeispiele von 5 großstädtischen Kläranlagen im Großraum Vancouver während einer Dauer erhöhter COVID-19-Instanzenzahlen von Februar bis April 2021 aus.

Die Ergebnisse, die online im Preprint auf der Medrxiv erläutert wurden, zeigten, dass der virale Fokus im Abwasser aus der Gegend von Vancouver die Anzahl der beruflichen Situationen in der Region sorgfältig verfolgte.

Die Wissenschaftler, zu denen auch der Doktorand des Bauingenieurwesens Xuan Lin gehörte, entdeckten ebenfalls, dass die Regelmäßigkeit von Anomalien im Zusammenhang mit besorgniserregenden Varianten im Abwasser stark mit Mustern in wissenschaftlich identifizierten Situationen in der Region verbunden ist.

In diesem Q&A spricht Dr. Ziels, ein Ökodesign-Wissenschaftler, der mikrobielle Ökologie erforscht, über die Forschungsstudie, nach der gesucht wird – und darüber, wie genomische Tests von Abwasser Krankheitssicherheit und auch Verwaltungsansätze anzeigen können.

Wie kamen Sie zu dieser Forschungsstudie?

Ich beschäftige mich eigentlich schon seit einigen Jahren mit der genomischen Sequenzierung von Abwässern und auch als die Pandemie beschädigt wurde, entschied ich mich, dieses Verständnis zu nutzen, um die SARS-CoV-2-Infektion in Zusammenarbeit mit verschiedenen anderen Wissenschaftlern zu verstehen. Unsere Gruppe besteht aus ökologischen Mikrobiologen, Designern und auch Epidemiologen (bei UBC und auch BC CDC), und auch wir hatten das Privileg, für unseren Job mit Metro Vancouver zusammenzuarbeiten.

Wie zahlreiche andere Krankheiten wird die SARS-CoV-2-Infektion während der gesamten Infektion mit dem Kot ausgeschieden, und auch virale Genomstücke können in städtischen Abwässern gefunden werden.

Die große Frage war, wie wir diese Teile schnell und auch präzise identifizieren können, um zusätzliche Inputs direkt in das allgemeine Gesundheits- und Wellness-Toolkit zu geben.

Welche Techniken haben Sie verwendet, um besorgniserregende Varianten im Abwasser von Metro Vancouver zu messen und auch zu verfolgen?

Ich hatte früher eine schnelle und auch präzise Sequenzierungsmethode mit tragbaren DNA-Sequenzern etabliert, und mit einigen Änderungen haben meine Gruppe und auch ich dieses System verwendet, um Coronavirus-Genomstücke in Abwasserbeispielen aus der Gegend von Vancouver zu messen.

Was wir tun, ähnelt der Arbeit von CanCOGeN, dem kanadischen COVID Genomics Network – einem Konsortium der kanadischen Regierung, ländlichen und auch lokalen öffentlichen Gesundheits- und Wellnessbehörden, das ungefähr 150,000 virale Genome in ganz Kanada sequenziert sequenzieren wir Abwasserbeispiele, die den Input ganzer Bevölkerungen in einem Gebiet ansammeln.

Was waren Ihre wichtigen Suchen?

Bei der Messung der Menge an Coronavirus-Genomstücken haben wir ein sehr frühes Signal im Gegensatz zu Veränderungen bei Krankenhausaufenthalten oder Instanzzahlen entdeckt. Dies empfahl, dass Abwassertests eine Art sehr frühe Vorsicht bieten können.

Mit der Genomsequenzierung von Abwasser können wir verstärkte Anomalien im Zusammenhang mit besorgniserregenden Varianten identifizieren, und wir bieten diese Informationen auch unseren Gesundheits- und Wellnessbehörden als zusätzliche Hilfe bei ihren Ansätzen für öffentliche Gesundheit und Wellness an.

Wir haben die Möglichkeit, unseren Ansatz anzupassen, um nach auftretenden Varianten zu suchen und auch tatsächlich ein Bild des gesamten Gebiets in einem Beispiel zu erhalten. Die Genomsequenzierung ermöglichte es uns ebenfalls, zu identifizieren, in welchen Kanalisationsschuppen in Metro Vancouver die Varianten besonders führend waren.

Die schnelle Sequenzierung viraler Informationen ermöglicht uns eine wirklich schnelle Bearbeitung – wir bieten Aufzeichnungen an, um unsere klinischen Gesundheits- und Wellness-Polizisten in nur 3 bis 4 Tagen ab der Beispielsammlung zu aktualisieren.

Was sind die Auswirkungen für zukünftige Pandemietests und auch die Verwaltung?

Es gibt eine zunehmende Forschungsstudie, in der die Verkostung von Abwasser zum Verständnis des Grades der COVID-19-Infektionen in Gebieten beitragen kann. Unser Ziel ist es, verschiedene andere Testverfahren für die öffentliche Gesundheit zu ergänzen, nicht zu ändern. Abwassertests können hilfreich sein, wenn professionelle Tests schwierig sind oder in einem städtischen Bereich nicht verfügbar sind.

Wir akzeptieren ebenfalls das Canadian Water Network, um ein landesweites Arbeitsteam aufzubauen, das das Verständnis für die Abwasserverfolgung austauscht. Ein solches bundesweites Netzwerk kann vertrauenswürdige Informationen liefern, während wir in Richtung einer Wiedereröffnung unserer wirtschaftlichen Situation voranschreiten.