Genomické testování odpadních vod může účinně sledovat sledované varianty COVID-19

Výzkum ukazuje, že genomické testování odpadních vod může efektivně sledovat varianty COVID-19, které se v regionu vyskytují

Testování odpadních vod dokáže přesně a také rychle rozpoznat stupně infekcí COVID-19 v této oblasti, spočívající v nárůstu variant obav, doporučuje zcela nová výzkumná studie vedená učitelem UBC Dr. Ryanem Zielsem.

Ziels a také jeho spolupracovníci hodnotili příklady kanalizace z 5 metropolitních čistíren odpadních vod v oblasti Metro Vancouver po celou dobu zvýšeného počtu instancí COVID-19, od února do dubna 2021.

Výsledky, vysvětlené online předtiskem v medrxiv, odhalily, že virové zaměření v odpadních vodách akumulovaných z oblasti Vancouveru pečlivě sledovalo počty profesionálních situací v této oblasti.

Vědci, kteří zahrnovali žáka Ph D. civilního designu Xuan Lin, také zjistili, že pravidelnost anomálií spojených s variantami znepokojení v odpadních vodách velmi souvisí se vzory ve vědecky identifikovaných situacích v oblasti.

V této otázce Dr. Ziels, vědec v oblasti ekologického designu, který zkoumá mikrobiální ekologii, hovoří o hledání výzkumných studií - a také o tom, jak může genomické testování odpadních vod upozornit na bezpečnost nemoci a také na administrativní přístupy.

Jak jste se dostali k této výzkumné studii?

Ve skutečnosti se již řadu let zabývám sekvenováním genomiky odpadních vod a také když jsem pandemii poškodil, rozhodl jsem se použít toto porozumění k pochopení infekce SARS-CoV-2 ve spolupráci s různými dalšími vědci. Naše skupina se skládá z ekologických mikrobiologů, designérů a také epidemiologů (v UBC a také BC CDC) a také jsme měli tu čest pracovat společně s Metro Vancouver na naší práci.

Stejně jako mnoho různých jiných nemocí, infekce SARS-CoV-2 klesá ve stolici během infekce a také části virového genomu lze nalézt v metropolitní odpadní vodě.

Obrovský dotaz spočíval v tom, jak můžeme tyto kousky identifikovat rychle a také přesně, abychom mohli nabídnout další vstupy přímo do sady nástrojů pro veřejné zdraví a wellness?

Jaké techniky jste použili k měření a také ke sledování variant zájmu v odpadních vodách Metro Vancouver?

Dříve jsem zavedl rychlou a také přesnou metodu sekvenování využívající přenosné sekvencery DNA a také s některými změnami moje skupina a také jsem použil tento systém k měření kusů genomu koronaviru v příkladech odpadních vod z oblasti Vancouveru.

To, co děláme, se podobá práci CanCOGeN, kanadské sítě COVID Genomics Network - konsorcia kanadské vlády, venkova a také místních úřadů pro veřejné zdraví a wellness, které sekvenuje přibližně 150,000 XNUMX virových genomů v celé Kanadě, ale níže, spíše než sekvenční příklady osob , sledujeme příklady odpadních vod, které akumulují vstupy od celých populací v dané oblasti.

Jaké byly vaše životně důležité hledání?

Pokud jde o měření množství kusů genomu koronaviru, objevili jsme trochu velmi raného signálu v kontrastu s úpravami pobytů v nemocnici nebo počtu případů. To doporučilo, aby testování odpadních vod mohlo nabídnout určitý typ velmi rané opatrnosti.

Se sekvenováním genomu odpadních vod můžeme identifikovat zvýšení anomálií spojených s variantami zájmu, a také nabízíme tyto informace našim zdravotním a wellness úřadům jako další pomoc v jejich přístupech k veřejnému zdraví a wellness.

Máme schopnost upravit náš přístup k hledání vznikajících variant a také v jednom příkladu skutečně získat obrázek celé oblasti. Sekvenování genomu nám také umožnilo identifikovat, ve kterých kanalizacích v Metro Vancouveru varianty přicházejí jako extra vedoucí.

Rychlé sekvenování informací o viru nám umožňuje nabídnout opravdu rychlý obrat - nabízíme záznamy pro upgrade našich klinických zdravotníků a wellness policistů za pouhé 3 až 4 dny od sběru příkladů.

Jaké jsou důsledky pro budoucí pandemické testování a také administraci?

Rozšiřuje se výzkumná studie, že ochutnávka odpadních vod může sloužit k pochopení míry infekce COVID-19 v oblastech. Naším cílem je doplňovat, nikoli měnit, různé další techniky testování veřejného zdraví. Testování odpadních vod může sloužit, když je profesionální testování náročné nebo pokud nemáte v metropolitní oblasti.

Rovněž přijímáme kanadskou vodní síť k rozvoji celostátního pracovního týmu, který sdílí porozumění ohledně sledování odpadních vod. Taková celostátní síť může přinést důvěryhodné informace, jak postupujeme směrem k znovuotevření naší ekonomické situace.