Velká genomová analýza zdůrazňuje rizikové faktory COVID-19

SARS-CoV-2, COVID-19

V březnu 2020 se stovky vědců z celého světa připojili, aby odpověděli na naléhavé a také složité dotazy: jaké dědičné faktory mají vliv na to, proč někteří klienti COVID-19 vytvářejí extrémní, smrtelný stav vyžadující pobyt v nemocnici, zatímco jiní se zbavují mírných známek a příznaky nebo vůbec žádným způsobem?

Podrobná rekapitulace jejich dnešního pátrání, zveřejněná v Příroda, popisuje 13 lokusů nebo oblastí v lidském genomu, které jsou vysoce spojeny s infekcí nebo extrémem COVID-19 Vědci dále určili kauzální faktory, jako je kouření cigaret, a také vysoký index tělesné hmotnosti. Tyto výsledky pocházejí z největších genomových organizačních výzkumů, jaké kdy byly provedeny, což zahrnuje téměř 50,000 19 klientů COVID-2 a také XNUMX miliony čistých kontrol.

Hledání může pomoci poskytnout cíle pro budoucí léčbu a také zdůraznit sílu dědičných výzkumů při zjišťování více informací o přenositelném stavu.

Tuto celosvětovou iniciativu nazvanou COVID-19 Host Genomics Initiative zahájila v březnu 2020 Andrea Ganna, vedoucí týmu na Institutu pro molekulární medicínu Finsko (FIMM), Helsinská univerzita a také Mark Daly, vedoucí FIMM a také účastník ústavu na Broad Institute of MIT and also Harvard Kampaň se ve skutečnosti rozšířila tak, aby patřila k jednomu z nejdůležitějších partnerství v lidských genech a v současné době ji tvoří více než 3,300 61 autorů a také 25 výzkumů z XNUMX zemí.

Ben Neale, spoluautor Programu pro lékařskou a také populační genetiku na Broad a také spoluautor výzkumu, uvedl, že zatímco očkování poskytuje obranu proti infekci, v terapii COVID-19 stále existuje značný prostor pro renovaci, který může být oznámen dědičnou analýzou. Zahrnul, že zdokonalení terapeutických technik může pomoci změnit pandemii - která ve skutečnosti vyžaduje velké uzávěry na velké části světa - na situaci původního ostrova, která je mnohem lokálnější a také existuje při omezených, i když pravidelných stupňů v populaci, stejně jako chřipka.

"Čím lépe se budeme léčit COVID-19, tím lépe bude lékařská komunita vybavena pro zvládnutí této nemoci," uvedl. "Kdybychom měli mechanismus léčby infekce a dostat někoho z nemocnice, radikálně by to změnilo naši reakci na veřejné zdraví."

Využití rozmanitosti

Aby provedli svou analýzu, konsorcium sloučilo lékařské a také dědičné informace od téměř 50,000 2 klientů ve svém výzkumu, kteří zkontrolovali příznivý výskyt infekce, a také 23 miliony kontrol v nesčetných biobankách, lékařských výzkumech a také dědičném podnikání přímo spotřebitelům, jako je jako XNUMXandMe. Vzhledem k velkému množství informací shromážděných z celého světa měli vědci schopnost vytvářet statisticky odolná hodnocení ještě rychleji a také z lepší rozmanitosti populací, než jakýkoli jeden tým může nést sám.

Z 13 lokusů, které skupina doposud určila, měla 2 větší pravidelnost mezi klienty východoasijského nebo jihoasijského původu než u těch evropských, což zdůraznilo význam rozmanitosti v dědičných souborech dat.

"Ve vzorkování genetické rozmanitosti jsme byli mnohem úspěšnější než minulé snahy, protože jsme vyvinuli společné úsilí, abychom oslovili populace po celém světě," uvedl Daly. "Myslím, že nás ještě čeká dlouhá cesta, ale jsme dělat velmi dobrý pokrok. “

Skupina zdůraznila mezi těmito 2 lokusy konkrétně blízko genetiky FOXP4, která je spojena s buňkami rakoviny plic. Verze FOXP4 spojená s extrémním COVID-19 zvyšuje genetický výraz a doporučuje, aby bránění genetice mohlo být perspektivní léčivou metodou. Další lokusy spojené s extrémní COVID-19 sestávaly z DPP9, genetiky navíc spojené s buňkami rakoviny plic a také plicní fibrózy, a také TYK2, který je spojen s některými autoimunitními chorobami.

Mari Niemi, navíc na FIMM a také hlavní odbornice na výzkum, uvádí, že konsorcium se zaměřilo na interakci, když vědci hodnotili informace, a okamžitě zveřejnili výsledky na svých internetových stránkách poté, co skutečně hledali přesnost. Skupina si přeje, aby jejich výsledky mohly směřovat prostředky k užitečným cílům pro opětovně použité léky.

Vědci určitě zůstanou, aby zkoumali ještě více informací, jak je lze najít, a také vylepšili své výsledky uspořádáním „Matters Arising“ naPříroda Určitě začnou zkoumat, co odlišuje „dálkové“, nebo klienty, jejichž příznaky a příznaky COVID-19 přetrvávají měsíce, od ostatních, a také zůstanou rozpoznávat přidaná místa spojená s infekcí a také extrémním stavem.

"Chtěli bychom se v příštím roce snažit získat dobrou hrstku velmi konkrétních terapeutických hypotéz," uvedl Daly. "Realisticky budeme COVID-19 s největší pravděpodobností dlouhodobě řešit jako vážný zdravotní problém." Jakákoli lék, který se objeví tento rok, například z opětovného použití existujícího léku na základě jasných genetických poznatků, by měl velký dopad. “

Zcela nová oblast pro geny

Ganna zdůraznila, že vědci měli schopnost objevit trvalé dědičné signály v důsledku svých kolektivních iniciativ, přirozeného ducha sdílení dat a také otevřenosti a také vážnosti, která zahrnuje pochopení celého světa, naráží na přesně stejné riziko přesně stejný čas. Zahrnoval, že genetici, kteří se pravidelně zabývají velkými datovými soubory, skutečně velmi dlouho chápali výhody otevřené spolupráce. "To jen ilustruje, o kolik je věda lepší - o kolik rychleji jde a o kolik toho objevíme - když pracujeme společně," uvedla Ganna.

Daly je nadšený tím, jak jasné a interpretovatelné byly jejich výsledky pro genetiky. Uvádí, že chápání této práce bylo ve skutečnosti zvláštní a možná i posun paradigmatu pro oblast lidských genů, která byla skutečně řízena výzkumy obvyklých přetrvávajících nemocí, neobvyklých dědičných nemocí a také rakovinných buněk.

"Tyto objevy byly opravdu informativní a díky nim jsme si uvědomili, že existuje spousta nevyužitého potenciálu v používání genetiky k pochopení a potenciálnímu vývoji terapeutik pro infekční onemocnění," uvedl Daly. "Doufám, že to bude příkladem toho, jak bychom mohli přinést populační genetické přístupy k nové sadě problémů, které jsou zvláště důležité v rozvojových částech světa."